ENZIMAS Las enzimas son protenas l l l

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ENZIMAS

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Las enzimas son proteínas l l l Catalizan reacciones químicas necesarias para la sobrevivencia

Las enzimas son proteínas l l l Catalizan reacciones químicas necesarias para la sobrevivencia celular Sin las enzimas los procesos biológicos serían tan lentos que las células no podrían existir. Las enzimas pueden actuar dentro de la célula , fuera de ésta, y en el tubo de ensayo. E + S ES EP E + P E E

La enzima disminuye la energía de activación Sin enzima Con enzima • La Ea

La enzima disminuye la energía de activación Sin enzima Con enzima • La Ea de la hidrólisis de la urea baja de 30 a 11 kcal/mol con la acción de las enzimas, acelerando la reacción 1014 x E+S E+P Tiempo de la reacción • El aumento de temperatura necesario para producir la reacción no catalizada seria de 529ºC

Enzima - Catalizador l l l Tanto la enzima como el catalizador aceleran la

Enzima - Catalizador l l l Tanto la enzima como el catalizador aceleran la velocidad de una reacción química. Una enzima puede transformar 1000 moléculas de sustrato/ segundo Las enzimas tienen 3 propiedades que los catalizadores NO tienen • • • Especificidad por el sustrato Se inactivan por desnaturación Pueden ser reguladas

l Las enzimas se unen a los reactivos (sustratos) reduciendo la energía de activación

l Las enzimas se unen a los reactivos (sustratos) reduciendo la energía de activación l Cada enzima tiene una forma única con un sitio o centro activo en el que se une al sustrato l Después de la reacción, enzimas y productos se separan. l Las moléculas enzimáticas no han cambiado después de participar en la reacción

Las enzimas cumplen su papel catalítico gracias a: • Fijación estereoquímicamente complementaria del substrato

Las enzimas cumplen su papel catalítico gracias a: • Fijación estereoquímicamente complementaria del substrato • Transformación catalítica del mismo En ambas funciones participan: • Cadenas laterales de los aminoácidos • Grupos o moléculas no proteicas: v Grupos prostéticos v Iones metálicos v Cofactores

Los siguientes hechos: l Especificidad de la reacción enzimática l Carácter heterogéneo de la

Los siguientes hechos: l Especificidad de la reacción enzimática l Carácter heterogéneo de la catálisis enzimática Nos llevan a postular la existencia de un Centro Activo en la molécula de enzima, capaz de: Fijar específicamente al substrato l Transformarlo catalíticamente. l

Enzima Sustrato Sitio activo

Enzima Sustrato Sitio activo

La unión del sustrato es muy específica l Complementariedad geométrica l Complementariedad iónicas l

La unión del sustrato es muy específica l Complementariedad geométrica l Complementariedad iónicas l Modelos: Ø Ø Ø de Encaje inducido Llave – cerradura. Estado de transición cargas, uniones

Teorías de la acción enzimática, 1 Modelo de Llave y Cerradura (Emil Fischer) Substrato

Teorías de la acción enzimática, 1 Modelo de Llave y Cerradura (Emil Fischer) Substrato y enzima se acoplan de forma estereospecífica, de la misma manera que una llave se ajusta a su cerradura. Modelo aceptado durante mucho tiempo; hoy se considera insuficiente al no explicar algunos fenómenos de la inhibición enzimática

Teorías de la acción enzimática, 2 Modelo de Ajuste Inducido (Koshland) Tanto la enzima

Teorías de la acción enzimática, 2 Modelo de Ajuste Inducido (Koshland) Tanto la enzima como el substrato sufren una alteración en su estructura por el hecho físico de la unión. Está mucho más de acuerdo con todos los datos experimentales conocidos hasta el momento.

Teorías de la acción enzimática, 3 Estabilización del Estado de Transición La teoría del

Teorías de la acción enzimática, 3 Estabilización del Estado de Transición La teoría del Ajuste Inducido se amplía en la actualidad definiendo la acción enzimática como Según lo cual, el Centro Activo enzimático es en realidad complementario no al substrato o al producto, sino al estado de transición entre ambos.

Una enzima puede unir dos sustratos en su sitio activo

Una enzima puede unir dos sustratos en su sitio activo

Clasificación y nomenclatura de enzimas

Clasificación y nomenclatura de enzimas

Clasificación y nomenclatura Nombre sistemático: Grupo transferido ATP: hexosa fosfotransferasa Donador Aceptor Tipo de

Clasificación y nomenclatura Nombre sistemático: Grupo transferido ATP: hexosa fosfotransferasa Donador Aceptor Tipo de reacción catalizada Grupos químicos Número Enzyme Commission: Enzyme Comission EC 2. 7. 1. 1 Grupo Enzimas Subgrupo Nombre común (sustrato+”asa”): Hexokinasa

Clasificación y nomenclatura Clasificación de enzimas por Grupos EC 1. x Oxidorreductasas EC 2.

Clasificación y nomenclatura Clasificación de enzimas por Grupos EC 1. x Oxidorreductasas EC 2. x Transferasas EC 3. x Hidrolasas EC 4. x Liasas EC 5. x Isomerasas EC 6. x Ligasas

Clasificación y nomenclatura Grupo 1: Oxidorreductasas Catalizan reacciones de oxidorreducción, en que átomos de

Clasificación y nomenclatura Grupo 1: Oxidorreductasas Catalizan reacciones de oxidorreducción, en que átomos de oxigeno ó hidrogeno son trasladados entre moléculas: Ared + Box Aox + Bred AH 2 + B A + BH 2 En las reacciones redox, siempre tienen que estar presentes a la vez el aceptor y el dador electrónico.

Clasificación y nomenclatura Grupo 1: Oxidorreductasas Nombre: Dador: Aceptor oxidorreductasa b-D-Glucosa : O 2

Clasificación y nomenclatura Grupo 1: Oxidorreductasas Nombre: Dador: Aceptor oxidorreductasa b-D-Glucosa : O 2 1 -oxidorreductasa Dador EC 1. 1. 3. 4 Aceptor Nombre común: Glucosa oxidasa

Clasificación y nomenclatura Grupo 1: Oxidorreductasas Nomenclatura del subgrupo en oxidorreductasas: EC 1. 1.

Clasificación y nomenclatura Grupo 1: Oxidorreductasas Nomenclatura del subgrupo en oxidorreductasas: EC 1. 1. x EC 1. 2. x EC 1. 3. x EC 1. 4. x EC 1. 5. x EC 1. 6. x etc. Deshidrogenasas Oxidasas Peroxidasas Oxigenasas Hidroxilasas Reductasas Aplicaciones: Ensayos de diagnostico clínico (glucosa oxidasa y colesterol oxidasa Deslignificación ó Bioblanqueamiento

Clasificación y nomenclatura Grupo 2: Transferasas Catalizan reacciones de transferencia de átomos ó grupo

Clasificación y nomenclatura Grupo 2: Transferasas Catalizan reacciones de transferencia de átomos ó grupo de átomos entre moléculas: A-X + B A + B-X Dador: Aceptor Grupo transferido - transferasa ATP: D-Hexosa Fosfotransferasa Nombre común: hexokinasa EC 2. 7. 1. 1

Clasificación y nomenclatura Grupo 2: Transferasas Clasificación de subgrupo de las transferasas: EC 2.

Clasificación y nomenclatura Grupo 2: Transferasas Clasificación de subgrupo de las transferasas: EC 2. 1. x EC 2. 2. x EC 2. 3. x EC 2. 4. x EC 2. 5. x EC 2. 6. x EC 2. 7. x EC 2. 8. x EC 2. 9. x - Grupos monocarbonados Grupos aldehido o ceto Aciltransferasas Glicosiltransferasas Alquil- o Ariltransferasas Grupos nitrogenados Grupos fosfato Grupos sulfato Grupos selenio Aplicaciones: Síntesis de oligosacáridos

Clasificación y nomenclatura Grupo 3: Hidrolasas Catalizan reacciones de hidrólisis y también su reverso.

Clasificación y nomenclatura Grupo 3: Hidrolasas Catalizan reacciones de hidrólisis y también su reverso. Son las más comunes en el dominio de la tecnología enzimática: A-B + H 2 O A-OH + H-B No se suelen utilizar nombres sistemáticos en las hidrolasas. Muchas de ellas conservan el nombre Primitivo. Ejemplo: Quimosina EC 3. 4. 23. 4.

Clasificación y nomenclatura Grupo 3: Hidrolasas Clasificación de las hidrolasas: 3. 1. -. 3.

Clasificación y nomenclatura Grupo 3: Hidrolasas Clasificación de las hidrolasas: 3. 1. -. 3. 2. -. 3. 3. -. 3. 4. -. 3. 5. -. etc. Esterasas (carboxilesterasas, fosfoesterasas, sulfoesterasas) Glicosidasas Éter hidrolasas Péptido hidrolasas Acil anhídrido hidrolasas Aplicaciones: Lipasas → Síntesis de tensioactivos Proteasas → Fabrico de quesos Glicosidasas → Clarificación de jugos; liberación de aromas en los vinos; aplicaciones textiles

Clasificación y nomenclatura Grupo 3: Hidrolasas Caso particular Péptido hidrolasas: clasificación común (no sistemática)

Clasificación y nomenclatura Grupo 3: Hidrolasas Caso particular Péptido hidrolasas: clasificación común (no sistemática) I. Según la situación del enlace atacado: - Exopeptidasas (extremos de la cadena) (Peptidasas) - Endopeptidasas (interior de la cadena) (Proteinasas) II. Según el mecanismo catalítico: - Serin proteinasas - Tiol proteinasas - Aspartil proteinasas - Metaloproteinasas

Clasificación y nomenclatura Grupo 4: Liasas Catalizan reacciones reversibles de remoción de grupo de

Clasificación y nomenclatura Grupo 4: Liasas Catalizan reacciones reversibles de remoción de grupo de átomos del sustrato (este grupo no incluye las hidrolasas): A-B Ejemplo Nombre sistemático: Histidina amonio-liasa (EC 4. 3. 1. 3) Nombre común: Histidasa A+B

Clasificación y nomenclatura Grupo 4: Liasas Clasificación de las liasas: 4. 1. x -

Clasificación y nomenclatura Grupo 4: Liasas Clasificación de las liasas: 4. 1. x - Actúan sobre enlaces C-C 4. 2. x - Actúan sobre enlaces C-O 4. 3. x - Actúan sobre enlaces C-N 4. 4. x - Actúan sobre enlaces C-S 4. 5. x - Actúan sobre enlaces C-Haluro (S-, Cl-, Br-, I- At-) 4. 6. x - Actúan sobre enlaces P-O 4. 99. x - Otras liases Aplicaciones: Pectato liasa – Remueve los compuestos indeseables (ceras, pectinas, proteínas) en fibras en la industria textil – “bioscouring”

Clasificación y nomenclatura Grupo 5: Isomerasas Catalizan reacciones de isomerización moleculares A Ejemplo: Glucosa

Clasificación y nomenclatura Grupo 5: Isomerasas Catalizan reacciones de isomerización moleculares A Ejemplo: Glucosa isomerasa (EC 5. 3. 1. 5) B

Clasificación y nomenclatura Grupo 5: Isomerasas Clasificación de las isomerasas: 5. 1. x -

Clasificación y nomenclatura Grupo 5: Isomerasas Clasificación de las isomerasas: 5. 1. x - Rasemasas y Epimerasas 5. 2. x - cis-Trans-Isomerasas 5. 3. x - Oxidoreductasas Intramolecular 5. 4. x - Transferasas Intramoleculares (mutases) 5. 5. x - Liasas Intramoleculares 5. 99. x - Otras Isomerasas

Clasificación y nomenclatura Grupo 6: Ligasas Catalizan la unión de dos grupos químicos a

Clasificación y nomenclatura Grupo 6: Ligasas Catalizan la unión de dos grupos químicos a expensas de la hidrólisis de un nucleótido trifosfato (ATP, GTP, etc. ). A + B + ATP A-B + ADP + Pi Ejemplo: Glutationa sintasa (EC 6. 2. 2. 3) Nombre sistémico: G-L-glutamilo-L-cisteina: glicina ligase

Clasificación y nomenclatura Grupo 6: Ligasas Clasificación de las ligasas: 6. 1. x 6.

Clasificación y nomenclatura Grupo 6: Ligasas Clasificación de las ligasas: 6. 1. x 6. 2. x 6. 3. x 6. 4. x 6. 5. x 6. 6. x - Forman enlaces C-O - Forman enlaces C-S - Forman enlaces C-N - Forman enlaces C-C - Forman enlaces ésteres fosfóricos - Actúan sobre enlaces N-metal

Cinética Enzimática

Cinética Enzimática

Cinética Enzimática Ø La cinética enzimática es el análisis cuantitativo del efecto de cada

Cinética Enzimática Ø La cinética enzimática es el análisis cuantitativo del efecto de cada uno de los factores que intervienen en la actividad enzimática, que se evalúa a través de la velocidad de la reacción catalizada. Ø Las variables más importantes son: • Concentración de enzima, sustratos y productos (incluyendo inhibidores y/o activadores) • p. H • Temperatura

Ø Ella está basada en la medición de la velocidad de reacción. Así en

Ø Ella está basada en la medición de la velocidad de reacción. Así en la reacción: S E P Ø Se tendrá: Ø Como se observa en la figura, la velocidad de reacción (pendiente) disminuye continuamente a partir de un valor máximo inicial. Esto se puede deber a: Ø Desaturación de la enzima con sustrato, por disminución de la concentración del sustrato Ø Inactivación de la enzima por su inherente inestabilidad Ø Inhibición por el producto Ø Desplazamiento del equilibrio, si la reacción es reversible

Baja concentración de sustrato ALTA concentración de sustrato SATURACION

Baja concentración de sustrato ALTA concentración de sustrato SATURACION

. . . Efecto de la concentración de substrato v . . . [s]

. . . Efecto de la concentración de substrato v . . . [s]

Concepto de velocidad inicial [ ] d[P] v = dt , t 0 p

Concepto de velocidad inicial [ ] d[P] v = dt , t 0 p s t

Una cinética hiperbólica implica un proceso saturante: Hay un número limitado de sitios en

Una cinética hiperbólica implica un proceso saturante: Hay un número limitado de sitios en la enzima para fijar substrato; una vez que están ocupados todos, por mucho que aumente la concentración de substrato, la velocidad permanecerá constante tendiendo a un valor asintótico E+S k+1 k-1 ES k+2 E+P

El sistema de ecuaciones diferenciales que describe la dinámica del sistema E+S k+1 k-1

El sistema de ecuaciones diferenciales que describe la dinámica del sistema E+S k+1 k-1 ES k+2 Sistema No admite solución analítica. - Simulaciones numéricas - Hipótesis que lo simplifiquen E+P

Hipótesis de Michaelis - Menten E+S k+1 k-1 ES k+2 E+P - La primera

Hipótesis de Michaelis - Menten E+S k+1 k-1 ES k+2 E+P - La primera parte del mecanismo, k+1 E+S k-1 ES Tiene lugar mucho más rápidamente que la segunda: ES k+2 E+P

Hipótesis de Michaelis-Menten Equilibrio rápido

Hipótesis de Michaelis-Menten Equilibrio rápido

Hipótesis de estado estacionario Según veíamos en la simulación numérica, hay un tiempo relativamente

Hipótesis de estado estacionario Según veíamos en la simulación numérica, hay un tiempo relativamente prolongado en el curso de la reacción en el que la variación de complejo [ES] es prácticamente igual a cero: dx/dt = k+1 es - (k-1 + k+2) x = 0 A partir de esta expresión podemos llegar a obtener una expresión que nos da la velocidad para la concentración de substrato

Hipótesis de estado estacionario

Hipótesis de estado estacionario

A partir de las suposiciones de Michaelis-Menten y Estado estacionario, llegamos a la ecuación

A partir de las suposiciones de Michaelis-Menten y Estado estacionario, llegamos a la ecuación v= Vmax * s Km + s La única diferencia radica en el significado de Km: Km = k-1/k+1 en mecanismo de M. M. Km = (k-1 + k+2)/k+1 en mecanismo de E. E.

Significado de la constante Km 1. Constante de equilibrio de disociación del complejo ES

Significado de la constante Km 1. Constante de equilibrio de disociación del complejo ES (en condiciones de equilibrio rápido) 2. Medida inversa de la afinidad de la enzima por el substrato (en condiciones de equilibrio rápido) 3. Mide la función de fijación (en cond. de equilibrio rápido) 4. Concentración de substrato para la que la velocidad se hace igual a la mitad de la máxima (s 0. 5) 5. Se define para una pareja enzima-substrato 6. Se mide en unidades de concentración

Significado de la constante Vmax = k+2 e 0 1. Velocidad asintótica para s

Significado de la constante Vmax = k+2 e 0 1. Velocidad asintótica para s 2. Directamente proporcional a la concentración de enzima (hoy se prefiere caracterizar a la enzima por k+2) 3. Mide función de transformación catalítica 4. Se expresa en unidades de velocidad

Velocidad de la reacción (v) Vmax Relación entre Km y Vmax Michaelis y Menten

Velocidad de la reacción (v) Vmax Relación entre Km y Vmax Michaelis y Menten Vmax/2 Km Concentración de Sustrato [S] La Km es la concentración de sustrato donde se obtiene la mitad de la Vmax

Velocidad de la reacción (v) Vmax/2 Km Concentración de Sustrato [S] A mayor Km,

Velocidad de la reacción (v) Vmax/2 Km Concentración de Sustrato [S] A mayor Km, menor es la afinidad de la enzima por el sustrato A menor Km mayor es la afinidad de la enzima por el sustrato

Vmax Km

Vmax Km

Representación Lineweaver-Burke 1/Vmax -1/Km

Representación Lineweaver-Burke 1/Vmax -1/Km

Representación Hanes 1/ -Km ax m V

Representación Hanes 1/ -Km ax m V

Representación de Eadie-Hofstee Vmax -K m

Representación de Eadie-Hofstee Vmax -K m

Métodos de linealización para determinación parámetros cinéticos Método Eje Y Eje X Intercepto Eje

Métodos de linealización para determinación parámetros cinéticos Método Eje Y Eje X Intercepto Eje Y Intercepto Eje x Pendiente Lineweaver. Burke 1/v 1/s 1/V -1/K K/V Hanes s/v s K/V -K 1/V Eadie. Hofstee v v/s V V/K -K

Definición Actividad Enzimática l l Es el número de moles de sustrato que reaccionan

Definición Actividad Enzimática l l Es el número de moles de sustrato que reaccionan para formar producto, por mol de enzima y por unidad de tiempo. Esto supone que la enzima está plenamente saturada con sustrato y por tanto que la reacción se efectúa con su máxima rapidez El índice de recambio muestra la eficiencia impresionante de la catálisis enzimática

Ø A fin de normalizar la medición de la actividad, se ocupa el valor

Ø A fin de normalizar la medición de la actividad, se ocupa el valor de la velocidad inicial de reacción, donde eses factores son despreciables. Así, Ø Esta velocidad inicial no se espera que sea observada en un proceso enzimático donde, debido a los elevados tiempos de operación, es razonable suponer que esos factores ejercerán su influencia.

Cálculo de Actividad Enzimática l l La velocidad de reacción catalizada por 0, 1

Cálculo de Actividad Enzimática l l La velocidad de reacción catalizada por 0, 1 ml de una dilución 1: 100 de Fosfatasa Alcalina es 0, 3 umoles / min. de producto. ¿Cuál es su actividad enzimática? 0, 1 ml---- 0, 3 umoles producto / min. 1, 0 ml------3, 0 umoles producto / min. dil 1: 100 -------300 umoles producto / min. Respuesta: 300 U/ml

Número o Índice de Recambio l l Es útil definir una constante de velocidad

Número o Índice de Recambio l l Es útil definir una constante de velocidad más general, k cat , para describir la velocidad limitante de cualquier reacción enzimática a saturación kcat x Et= Vmáx V 0 = k cat x Et x [S] / KM + [S]; Kcat es una constante de velocidad de 1 er orden con unidades de tiempo-1, también llamada Número de Recambio

Efecto del p. H en la ENZIMA Cada enzima tiene un p. H óptimo

Efecto del p. H en la ENZIMA Cada enzima tiene un p. H óptimo para su actividad El p. H afecta las interacciones iónicas

Efecto del p. H 1. Sobre la fijación del substrato al centro activo: -

Efecto del p. H 1. Sobre la fijación del substrato al centro activo: - Grupos disociables de la enzima - Grupos disociables del substrato 2. Sobre la transformación catalítica del substrato 3. Sobre la estructura de la proteína enzimática

En el efecto de la temperatura hay dos componentes: 1. Aceleración de la reacción

En el efecto de la temperatura hay dos componentes: 1. Aceleración de la reacción según la ecuación de Arrhenius k = A exp (-Ea/RT) 2. Desnaturalización térmica de la proteína

Efecto de la temperatura en la ENZIMA Aumento de la velocidad 15º Desnaturación por

Efecto de la temperatura en la ENZIMA Aumento de la velocidad 15º Desnaturación por calor 40º 75º Temperatura Cada enzima tiene una temperatura óptima.

ORGANISMOS TERMÓFILOS l l l Son organismos que viven a altas tº y realizan

ORGANISMOS TERMÓFILOS l l l Son organismos que viven a altas tº y realizan sus reacciones enzimáticas a estas altas tº Ejemplos son los que viven en las aguas termales Es tema de investigación el aislamiento de las enzimas de estos organismos para desarrollar procesos industriales en condiciones más extremas

Coenzimas l l l Las coenzimas son pequeñas moléculas orgánicas, que se unen a

Coenzimas l l l Las coenzimas son pequeñas moléculas orgánicas, que se unen a la enzima. Las coenzimas colaboran en la reacción enzimática recibiendo transitoriamente algún grupo químico: H+ , OH, CH 3. La enzima sin la coenzima recibe el nombre de APOENZIMA

El NAD es una coenzima aceptora de H Sustrato oxidado

El NAD es una coenzima aceptora de H Sustrato oxidado

Algunas enzimas requieren metales para mejorar su actividad

Algunas enzimas requieren metales para mejorar su actividad

Isoenzimas o Isozimas l l l l Son formas moleculares diferentes de una misma

Isoenzimas o Isozimas l l l l Son formas moleculares diferentes de una misma enzima Catalizan la misma reacción Ejemplo: Lactato deshidrogenasa Lactato + NAD ==== Piruvato + NADH M 4 , M 3 H 1 , M 2 H 2 , M 1 H 3 y H 4 Se diferencian por su movilidad electroforética Usadas en clínica: sueros normales y sueros con alguna patología

Ø Así esta actividad corresponde al máximo potencial catalítico que las enzimas poseen para

Ø Así esta actividad corresponde al máximo potencial catalítico que las enzimas poseen para un determinado conjunto de condiciones ambientales. Luego, estas deben ser consideradas en las expresiones matemáticas representativas del proceso enzimático. Ø Existen situaciones (sustratos heterogéneos) donde la velocidad inicial de reacción no es representativa del real potencial catalítico de la enzima. Ø Se asume que la velocidad inicial de reacción es proporcional a la concentración de proteína enzimática.

Inhibición enzimática

Inhibición enzimática

Inhibidor: Efector que hace disminuir la actividad enzimática, a través de interacciones con el

Inhibidor: Efector que hace disminuir la actividad enzimática, a través de interacciones con el centro activo u otros centros específicos (alostéricos). Esta definición excluye todos aquellos agentes que inactivan a la enzima a través de desnaturalización de la molécula enzimática De esta forma, habrá dos tipos de inhibidores: I. Isostéricos: ejercen su acción sobre el centro activo II. Alostéricos: ejercen su acción sobre otra parte de la molécula, causando un cambio conformacional con repercusión negativa en la actividad enzimática.

Inhibición enzimática isostérica

Inhibición enzimática isostérica

Los inhibidores isostéricos pueden ser de dos tipos: 1. Inhibidor reversible: establece un equilibrio

Los inhibidores isostéricos pueden ser de dos tipos: 1. Inhibidor reversible: establece un equilibrio con la enzima libre, con el complejo enzima-substrato o con ambos: E+I EI ES + I ESI 2. Inhibidor irreversible: modifica químicamente a la enzima: E+I E’

Inhibición reversible (a) El inhibidor se fija al centro activo de la enzima libre,

Inhibición reversible (a) El inhibidor se fija al centro activo de la enzima libre, impidiendo la fijación del substrato: Inhibición Competitiva (b) El inhibidor se fija a la enzima independientemente de que lo haga o no el substrato; el inhibidor, por tanto, no impide la fijación del substrato a la enzima, pero sí impide la acción catalítica: Inhibición No Competitiva (c) El inhibidor se fija únicamente al complejo enzima-substrato una vez formado, impidiendo la acción catalítica; este tipo se conoce como Inhibición Anticompetitiva

Inhibición Competitiva

Inhibición Competitiva

Inhibidores Competitivos l l l Compiten con el sustrato por el sitio activo de

Inhibidores Competitivos l l l Compiten con el sustrato por el sitio activo de la enzima Se une solo a la enzima libre V máx no se altera y K M cambia

Inhibición competitiva Al aumentar la cantidad de SUSTRATO el inhibidor competitivo es desplazado y

Inhibición competitiva Al aumentar la cantidad de SUSTRATO el inhibidor competitivo es desplazado y se forma producto

S E ES E+P I EI Se define una constante de equilibrio de disociación

S E ES E+P I EI Se define una constante de equilibrio de disociación del inhibidor: [E] [I] Ki = [EI] Características: - Las fijaciones de substrato e inhibidor son mutuamente exclusivas - A muy altas concentraciones de substrato desaparece la inhibición - Por lo general, el inhibidor competitivo es un análogo químico del substrato. - El inhibidor es tan específico como el substrato

En condiciones de equilibrio rápido, llamando y a la concentración del complejo EI, para

En condiciones de equilibrio rápido, llamando y a la concentración del complejo EI, para la inhibición competitiva obtenemos el sistema de ecuaciones De donde Que resuelto para x nos da

Por tanto, en la inhibición competitiva, 1. El efecto cinético del inhibidor es el

Por tanto, en la inhibición competitiva, 1. El efecto cinético del inhibidor es el aumento aparente de la Km, que aparece multiplicada por el factor (1 + i/Ki) 2. La Vmax no aparece modificada; para concentraciones muy altas del substrato, v = Vmax, igual que en ausencia de inhibidor 3. Cuanto más pequeño sea el valor de Ki mayor será la potencia del inhibidor competitivo.

Sin inhibidor Con inhibidor El inhibidor competitivo aumenta la Km Km Km Sin con

Sin inhibidor Con inhibidor El inhibidor competitivo aumenta la Km Km Km Sin con inhibidor

Inhibición competitiva - Representación recíproca doble 1/Vmax -1/Km -1/(Km(1 + i/Ki))

Inhibición competitiva - Representación recíproca doble 1/Vmax -1/Km -1/(Km(1 + i/Ki))

Ejemplo Inhibidor Competitivo l l l Ácido succínico + FAD == ácido fumárico +

Ejemplo Inhibidor Competitivo l l l Ácido succínico + FAD == ácido fumárico + FADH 2 El inhibidor competitivo es el ácido malónico Es un análogo estructuralmente parecido al ácido succínico

Ácido Fólico y Sulfanilamida l l La sulfanilamida es un análogo estructural del ácido

Ácido Fólico y Sulfanilamida l l La sulfanilamida es un análogo estructural del ácido p - aminobenzoico (PABA) PABA es el punto de partida para la síntesis de ácido fólico en las bacterias El ácido fólico es una vitamina esencial para la proliferación (división) bacteriana Sulfanilamida se usa en el tratamiento algunas infecciones

Metotrexato y Dihidrofolato l l l El ácido fólico en sus formas de dihidro

Metotrexato y Dihidrofolato l l l El ácido fólico en sus formas de dihidro y tetrahidrofolato es coenzima de la reacción catalizada por la dihidrofolato reductasa Esta reacción es parte del metabolismo de los nucleótidos para la síntesis de DNA Metotrexato se usa en la terapia de algunos cánceres, inhibiendo la síntesis de DNA

Inhibidor competitivo su estructura es similar a la del sustrato No se forma producto

Inhibidor competitivo su estructura es similar a la del sustrato No se forma producto

Inhibición No Competitiva

Inhibición No Competitiva

Inhibidor No Competitivo l l l Se une a un lugar diferente del sitio

Inhibidor No Competitivo l l l Se une a un lugar diferente del sitio activo la enzima Se une a la enzima libre y también al complejo enzima-sustrato Por acción del inhibidor disminuye la Vm pero el valor de Km no se altera

Inhibición NO competitiva

Inhibición NO competitiva

Inhibidor NO competitivo El inhibidor NO competitivo se une a la enzima en un

Inhibidor NO competitivo El inhibidor NO competitivo se une a la enzima en un sitio diferente del sitio activo

S E ES I I Inhibición No Competitiva S EI E+P ESI El inhibidor

S E ES I I Inhibición No Competitiva S EI E+P ESI El inhibidor se fija indistintamente a la enzima libre E y al complejo enzima-substrato ES; ni el complejo EI ni el complejo ESI son productivos

Inhibición Anticompetitiva o Incompetitiva

Inhibición Anticompetitiva o Incompetitiva

Inhibidor Incompetitivo En este tipo de inhibición el inhibidor se enlaza al centro activo

Inhibidor Incompetitivo En este tipo de inhibición el inhibidor se enlaza al centro activo pero solo después de que el sustrato lo haya hecho y, por tanto, inhibidor y sustrato no compiten. De esta manera, aunque todo el sustrato esté saturando la enzima y toda la enzima esté como complejo ES, el inhibidor puede enlazarse produciendo un complejo inactivo ESI. Como I solo se une a ES estimula la formación de ES y, por tanto, incrementa la unión del sustrato a la enzima, disminuyendo Km. Sin embargo, el complejo ESI no conduce a productos y Vm disminuye.

Inhibidor Incompetitivo l l l Se une a un lugar diferente del sitio activo

Inhibidor Incompetitivo l l l Se une a un lugar diferente del sitio activo de la enzima Se une sólo al complejo enzima-sustrato Los efectos que tiene: disminuye el valor de Km y también el de Vmáx

S E I ES ESI E+P Inhibición Anticompetitiva El inhibidor sólo puede fijarse al

S E I ES ESI E+P Inhibición Anticompetitiva El inhibidor sólo puede fijarse al complejo ES; el complejo ESI no es productivo

Determinación de parámetros cinéticos de inhibición Modelo Inh comp Inh no comp total Inh

Determinación de parámetros cinéticos de inhibición Modelo Inh comp Inh no comp total Inh anticomp Kap Vap Km(1+i/Ki) Vm Km Vm/(1+i/Ki) Km/(1+i/Ki) Vm/(1+i/Ki)

Inhibición Irreversible - Los inhibidores irreversibles reaccionan con un grupo químico de la enzima,

Inhibición Irreversible - Los inhibidores irreversibles reaccionan con un grupo químico de la enzima, modificándola covalentemente - Su acción no se describe por una constante de equilibrio Ki, sino por una constante de velocidad ki: E+I E’ - A diferencia de la inhibición reversible, el efecto de los inhibidores irreversibles depende del tiempo de actuación del inhibidor. - Los inhibidores irreversibles son, por lo general, altamente tóxicos.

Inhibidores Irreversibles l l l Producen inactivación permanente de la actividad enzimática Se interfiere

Inhibidores Irreversibles l l l Producen inactivación permanente de la actividad enzimática Se interfiere con el normal desarrollo de una reacción o vía metabólica Ejemplos: p-cloromercuribenzoato, yodoacetato, diisopropilfluorfosfato

Algunos tipos de inhibidores irreversibles 1. Reactivos de grupos -SH 2. Organofosfóricos 3. Ligandos

Algunos tipos de inhibidores irreversibles 1. Reactivos de grupos -SH 2. Organofosfóricos 3. Ligandos de metales 4. Metales pesados

Inhibición enzimática alosterica

Inhibición enzimática alosterica

Enzimas Alostéricas l l l Son enzimas cuya estructura proteica está formada de varias

Enzimas Alostéricas l l l Son enzimas cuya estructura proteica está formada de varias subunidades No se rigen por la cinética de M - M Además del sitio o centro activo tienen sitios alostéricos o de regulación Sitio activo/sustratos; Sitio alostérico/moduladores o reguladores La relación entre la velocidad de reacción y la concentración de sustrato sigue cinética sigmoídea

Enzimas alostéricas l l Las enzimas alostéricas presentan estructura cuaternaria. Tienen diferentes sitios activos,

Enzimas alostéricas l l Las enzimas alostéricas presentan estructura cuaternaria. Tienen diferentes sitios activos, unen mas de una molécula de sustrato La unión del sustrato es cooperativa la curva de velocidad presenta una forma sigmoidal

Concepto de Cooperatividad l l l La unión de los sustratos al sitio activo

Concepto de Cooperatividad l l l La unión de los sustratos al sitio activo de una subunidad produce un cambio conformacional que por contacto físico se transmite a las subunidades vecinas, facilitando las interacciones Modelos de unión: secuencial y concertado Ejemplos: unión Hb-O 2, enzimas alostéricas y sustratos

Moduladores Alostéricos l l l También reciben el nombre de efectores y pueden ser

Moduladores Alostéricos l l l También reciben el nombre de efectores y pueden ser positivos o negativos Se unen al sitio alostérico que puede estar en la misma subunidad que tiene al sitio activo o en las subunidades regulatorias Su unión produce un cambio conformacional que afecta al sitio activo

Aspartato Transcarbamilasa l l l Ác L-asp + Carbamil-P === Carbamilasp + Pi. Primera

Aspartato Transcarbamilasa l l l Ác L-asp + Carbamil-P === Carbamilasp + Pi. Primera reacción en la síntesis de pirimidinas Efector positivo: CTP Efector negativo: ATP Tiene dos subunidades catalíticas para los sustratos y tres subunidades regulatorias para los efectores

RESUMEN l l l Las enzimas son proteínas que catalizan las reacciones biológicas Presentan

RESUMEN l l l Las enzimas son proteínas que catalizan las reacciones biológicas Presentan especificidad por su sustrato Cada enzima presenta dos parámetros importantes Vmax (saturación de la enzima) y la Km (medida de la afinidad por el sustrato)

RESUMEN l l l La actividad enzimática puede ser inhibida, por inhibidores competitivos (similares

RESUMEN l l l La actividad enzimática puede ser inhibida, por inhibidores competitivos (similares al sustrato) o por inhibidores no competitivos. La temperatura y el p. H afectan a la enzima en su actividad catalítica. Algunas enzimas requieren de coenzimas y/o cofactores para su actividad.