PERFILES DE EXPRESIN GNICA Y DIAGNSTICO PRONSTICO EN

PERFILES DE EXPRESIÓN GÉNICA Y DIAGNÓSTICO / PRONÓSTICO EN CÁNCER 17 DE JUNIO MONTSERRAT SERÉS ROIG 2013 GENÓMICA Y PROTEÓMICA CURSO 2012 -2013

DEFINICIONES • EXPRESIÓN GÉNICA : proceso por el cual todos los organismos procariotas y eucariotas transforman la información por los ácidos nucleicos ( DNA ) en las proteinas necesarias para su desarollo y funcionamiento. • PERFIL DE EXPRESIÓN GÉNICA : medida de expresión de varios genes en una célula en un momento dado.

METODOS DE DETECCIÓN GEN PORTERO : • Secuencia conocida. • Caraterísticas visulamente identificables. • Luminiscentes / fluorecentes. NOTHERN BLOT : • Sonda radioactiva-m. RNA • Electroforesis en gel • Separación de fragmentos según su tamaño.

WESTERN BLOT : • Detectar proteinas específicas. • Electroforesis en gel. • Unión mediante Ag-Ac. HIBRIDACIÓN IN SITU : • Capacidad de AANN de hibridación. • Complementariedad • Sonda marcada con isotopo radioactivo con secuencia de ADN o ARN.

PCR : • gran número de copias. • Fragmento ADN en particular.

MICROARRAYS ( chip de ADN ) • Superficie sólida a la cual se una colección de ADN • Medir el nivel de hibridación entre sonda y molécula diana (target ) mediante fluorescencia.

APLICACIONES • Estudio de expresión de genes. • Clasificar enfermedades • Identificar genes específicos de ciertas patologias. • Predicción de respuesta a un tratamiento. • Detección de polimorfismo de un gen ( SNP’s).

DIAGNÓSTICO/ PRONÓSTICO EN CÁNCER • Pulmon / hígado / mama / próstata / digestivos / hematológicos / pancreas etc. • Clasificación de subtipos. • Diagnóstico. • Pronóstico : - respuesta a un tratamiento - supervivencia del paciente. • Buscar nuevas moléculas diana ( TARGETS ).

CÁNCER / GENÉTICA • Visualizar el cáncer como una enfermedad genética. (mutaciones heredables ) • Ciertos genes se convierten en oncogenes causantes de cáncer. • Otros genes , supresores , previenen el crecimiento incontrolado de células ; si son anulados provocan aparición de cáncer. • Las mutaciones aisladas , generalmente no son suficientes para causar cáncer , sino que producen cambios que predisponen a las células al crecimiento maligno.

EL CANCER ES UN PROCESO DE MUCHAS ETAPAS

CLASIFICIÓN MOLECULAR EN EL CÁNCER DE MAMA • Clasificado en 4 subtipos : luminal A / luminal B / Her 2 neu / Basal Like. • Estudio descriptivo transversal en 399 pacientes. • Seguimiento en 5 años. • Se mide : - EFECTIVIDAD DEL TRATAMIENTO - PRONÓSTICO - CLASIFICACIÓN GENÉTICA - RIESGO • DIAGNÓSTICO INICIAL : mediante biopsias guiadas por ultrasonidos.

CÁNCER DE MAMA DESDE EL PUNTO DE VISTA INMUNOHISTOQUÍMICO Luimnal A Luminal B Herb 2 Neu Basal Like estrogeno positivo negativo progestageno Positivo/negativo positivo negativo Gen C-er. B 2 negativo positivo negativo Pre / postmenopausa post pre diagnóstico precoz tardío pronóstico favorable desfavorable Diferenciado/ indiferenciado indiferenciado edad precoz tardía Tratamiento inicial IQ IQ QT Diseminación precoz negativa positiva

DIAGNÓSTICO GENÉTICO MICROARRAYS : • Identificar la expresión génica. • Precisión en el diagnóstico. • Un pronóstico más preciso. • Selectividad en el tratamiento con QT : -menos morbi/mortalidad inducida por el tratamiento QT. -menos coste -más índice de curación

GENÉTICA EN CÁNCER DE MAMA • De los 4 subtipos luminal A / B son menos agresivos respecto a los otros 2. • Diagnóstico subclinico mayor en luminal A / B. • Menor / mayor agresividad. • Selectividad del tratamiento. • Posibilidad de realización de un ONCOTYPE

TCGA ( The Cancer Genome Atlas ) • Artículo publicado : « Endometrial cancer findings emerge from genome sequencing study «. • Publicación del análisis genético de 7 cánceres , entre ellos el endometrial. • Publicado en el New England Journal of Medecine . • Intenta caracterizar el análisis genómico de hasta 20 cánceres diferentes. • Gracias a la contribución de muchos pacientes en proporcionar sus datos clínicos

Cáncer de Endometrio • 4 subtipos. • Analizar similitudes con otros cánceres comunes (ovario , mama , colorectal ). • Determinar que pacientes se benefician de un tratamiento más agresivo. • Es el 4° cancer más común en U. S en mujeres. • Clasificamos 2 tipos : - Endometrial : asociado a un exceso de estrógenos y obesidad. - Seroso : más común en mujeres en edad post menopáusica.

OBJETIVOS DEL ESTUDIO • Clasificar la mortalidad asociada segun el tipo de cáncer. • Adecuar un tratamiento agresivo a cada subtipo. • identificación de mutaciones : - Gen supresor TP 53 - Extensión de «copy numbers « Que proporcinan mayor agresividad al tipo serosos.

• Compartir características genéticas con otros tipos de cánceres : - Ovario seroso / basal-like mama / endometrio comparten similar « copy numbers « y mutación en el gen TP 53. - Menos frecuente la mutación en el gen PTEN - Endometrio- colorectal comparten la mutación en el gen POLE involucrado en la reparación del ADN.

CONCLUSIONES • TCGA permite conocer el perfil genético de ciertos cánceres. • Mayor efectividad en los tratamientos de ciertos cánceres con diferente perfil genético. • Asociación de anomalías genéticas entre cánceres. • Contribución pública del conocimiento de la genética de un cáncer para un mejor futuro en su manejo y tratamiento

BIBLIOGRAFIA • « Endometrial cancer findings emerge from genome sequencing study «. Broad Institute of MIT and Harvard. 8 de mayo 2013 • Clasificación molecular del cáncer de mama y su correlación – J. Uribe , C. Herenandez, F. Menolascino. Rev Venez Oncol 2010; 22(2): 109 -116. • Pubmed : perfiles de expresión génica en cáncer.

MUCHAS GRACIAS