Purificacin de protenas Parte II 20 Agosto 2013

Purificación de proteínas Parte II 20 Agosto, 2013

Purificación de proteínas Proceso que cuenta con varias etapas cuyo objetivo es lograr la concentración diferencial de una proteína o molécula de interés

Empezar a separar Métodos de Baja resolución Precipitación con sales, solventes, temperatura o p. H Métodos cromatográficos: Métodos de Alta Resolución filtración en gel, intercambio iónico, afinidad Métodos electroforéticos: electroforesis no desnaturalizante, desnaturalizante

Características Procedimiento Solubilidad 1. Salting in 2. Salting out Carga iónica 1. Cromatografia de intercambio iónico 2. Electroforesis Polaridad 1. 2. 3. 4. Cromatografía de adsorción Cromatografía en papel Cromatografía en fase reversa Cromatografía interacción hidrófoba Tamaño molecular 1. 2. 3. 4. Dialisis y ultrafiltración Electroforesis en gel Cromatografía de filtración en gel Ultracentrifugación Especificidad de unión 1. Cromatografía de afinidad

Propiedades Sal más usada: Sulfato de Amonio

Solubilidad de las proteínas en Sulfato de Amonio Fibrinogeno Mioglobina

Lactato deshidrogenasa 1. 1. 1. 27

Homogenización 1) 2) 3) 4) 5) 6) 100 g de pechuga de pollo troceado (sin grasa ni tejido conectivo) Licuar en frío (3 Vol de Amortiguador por gramo de tejido, 3 pulsos/3 seg. ) Filtrar mezcla en gasa. Tomar fracción cero (F 0) Centrifugar a 7, 000 rpm 4° C 10 min. Decantar sndnte y tomar fracción 1 m. L (F 1) Guardar fracciones a -20°C Precipitación por salado 1) 25 m. L del sndnte en vaso de pp. 2) Agitar en hielo y añadir lentamente 8. 15 g de sulfato de amonio (55 % de saturación) 3) Centrifugar a 4°C a 10, 000 rpm 10 min. 4) Registrar volumen y tomar 1 m. L fracción 2 (F 2) Guardar a -20°C 5) Realizar segunda precipitación para llegar a 75 %, repetir pasos 2 y 3 6) Descartar el sndante 7) Resuspender botón o pellet en 1 m. L de agua 8) Distribuir en 3 tubos, uno de ellos con 1 m. L. Guardar a -20°C

Carga p. H solución> p. I= proteína carga(-) por desprotonación. p. H solución< p. I= proteína carga(+) por protonación p. H solución =p. I =proteína carga(0) precipitado insoluble

Cromatografía Es un conjunto de técnicas basadas en el principio de retención selectiva, cuyo objetivo es separar los distintos componentes de una mezcla, permitiendo identificar dichos componentes. Muestra aplicada Eluyente Volumen de columna Matriz Tapón poroso Eluyente Proteínas separadas

Matriz de la columna. Sustancia que está empapada de solvente y que se empaqueta en la columna. También se denomina fase estacionaria o lecho de la columna. Fase Móvil. Solución Tamponada que se hace pasar a través de la columna. Longitud del dispositivo en el que se empaqueta la columna: Es importante en algunos tipos de cromatografía como la de filtración en gel y poco importante en otras como la cromatografía de afinidad. Volumen de la columna. Volumen total de gel que se empaqueta en una columna cromatográfica. Volumen muerto de la columna. Cantidad de solvente que tiene que atravesar la columna para asegurar que se ha reemplazado completamente.

k. Da MASA Å TAMAÑO Å

Cromatografía de exclusión molecular PRINCIPIO: Tamaño de partícula y masa molecular. Mayor masa molecular eluye primero El gel retiene particuas de menor masa molecular

TIPOS DE MATRIZ APLICACIONES Desalado de proteínas Purificación de proteínas Determinación del peso molecular de las proteínas GRANULOS DE UN MATERIAL ESPONJOSO E HIDRATADO Dextranos con enlaces cruzados Agarosa Poliacrilamida

FASE ESTACIONARIA En esta práctica se utilizará el gel dextrano. Tipo Peso molecular Límite de fraccionamiento (daltons) Agua retenida (g/g gel sec) Volumen de gel hidratado (ml/g gel seco) G 10 Hasta 700 1. 0 2 G 15 Hasta 1500 1. 5 3 G 25 1000 - 5000 2. 5 5 G 50 1500 - 30 000 5. 0 10 G 75 3000 -80 000 7. 5 12 -15 G 100 4000 - 150000 10. 0 15 -20 G 150 5000 – 400 000 15. 0 20 -30 G 200 5000 – 800 000 20. 0 30 -40

Las proteínas son moléculas cargadas • De • Suma de las cargas de las cadenas laterales de los aminoácidos • Dependen de: p. H y p. Ka; ambiente que los rodea

Cromatografía de intercambio iónico

Intercambio catiónico Fase estacionaria cargada negativamente Intercambio aniónico Fase estacionaria cargada positivamente

GRADIENTE DE CONCENTRACIÓN

Factores que afectan a la retención 1. Fuerza Iónica 2. p. H 3. Modificadores Orgánicos

Reconocimiento molecular

Cromatografía de Afinidad

Utiliza la alta especificidad entre las moléculas biológicas para separar componentes específicos de mezclas complejas.

Pur. Prot. Wash Flow Pellet Pur. Prot. Wash Flow k. Da Pellet IOJAP 75 50 37 25 W. Succinogenes 30 k. Da M. Genitalium 28 k. Da

VENTAJAS: No hay restricción por volumen. Especificidad Pureza del producto final DESVENTAJAS: Precio (alto) Condiciones de elución drásticas Ligando específico no disponible o inadecuado

Determinación de la concentración de proteína Métodos espectrofotométricos Ventajas de la técnica Rápida Precisa Versátil Fácil de usar Eficiente en costo

MÉTODO VENTAJAS DESVENTAJAS Método de Absorción No se pierden las muestras Interfieren compuestos que absorben en el UV Biuret Específico para proteínas, muestra pocas interferencias es barato Poca sensibilidad 1 a 6 mg/m. L Lowry Tiene bastante sensibilidad de 0, 1 -1 mg/m. L. No todas las proteínas reaccionan igual. Muestra interferencias con detergentes no iónicos, sulfato de amonio Bradford Muy sensible 0, 5 -1, 4 mg/m. L Muestra interferencias con detergentes MÉTODOS COLORIMÉTRICOS