Estrutura dos cidos Nuclicos 1 Aspectos Gerais 2

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Estrutura dos Ácidos Nucléicos 1 -Aspectos Gerais 2 -Composição dos Ácidos Nucléicos 3 -Estrutura

Estrutura dos Ácidos Nucléicos 1 -Aspectos Gerais 2 -Composição dos Ácidos Nucléicos 3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos 4 -Química dos ácidos nucléicos Edmar Vaz de Andrade www. ufam. edu. br/~edandrade 1

1 -Aspectos Gerais Tipos Ácido Ribonucléico – RNA 100 a milhares de nucleotídeos Ácido

1 -Aspectos Gerais Tipos Ácido Ribonucléico – RNA 100 a milhares de nucleotídeos Ácido Desoxirribonucléico – DNA até 100 milhões de nucleotídeos Relacionados com a informação genética de todos os organismos vivos 2

2 -Composição dos Ácidos Nucléicos Formação de um nucleotídeo por remoção de água 3

2 -Composição dos Ácidos Nucléicos Formação de um nucleotídeo por remoção de água 3

2 -Composição dos Ácidos Nucléicos Comparação entre um nucleosídeo e um nucleotídeo 4

2 -Composição dos Ácidos Nucléicos Comparação entre um nucleosídeo e um nucleotídeo 4

2 -Composição dos Ácidos Nucléicos Composição geral dos nucleotídeos (monômeros) Grupamento fosfato - Açúcar

2 -Composição dos Ácidos Nucléicos Composição geral dos nucleotídeos (monômeros) Grupamento fosfato - Açúcar - Base nitrogenada Grupo fosfato Desoxirribose 5

2 -Composição dos Ácidos Nucléicos Bases Nitrogenadas Purinas Adenina Guanina Pirimidinas Citosina Timina (DNA)

2 -Composição dos Ácidos Nucléicos Bases Nitrogenadas Purinas Adenina Guanina Pirimidinas Citosina Timina (DNA) Uracila (RNA) 6

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Estrutura primária Representação esquemática ilustrando a orientação química 7

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Estrutura primária Representação esquemática ilustrando a orientação química 7

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Estrutura primária Formação da ligação fosfodiéster na sequência linear

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Estrutura primária Formação da ligação fosfodiéster na sequência linear de polinucleotídeos 8

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos James Watson & Francis Crick (1953) • Estudos de

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos James Watson & Francis Crick (1953) • Estudos de Chargaff (1947) – Conteúdo de adenina é igual ao de timina – Conteúdo de citosina é igual ao de guanina • Estudos por Raios X (Rosalind Franklin & Maurice Wilkins) – DNA como sendo uma molécula longa e fina – Possui dois filamentos associados entre si – Molécula helicoidal 9

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Formação de Pontes de hidrogênio entre as Bases Nucleotídicas

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Formação de Pontes de hidrogênio entre as Bases Nucleotídicas Complementares Compatibilidade entre grupos doadores e aceptores de H Pareamento instável 10

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Formação de Pontes de hidrogênio entre as Bases Nucleotídicas

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Formação de Pontes de hidrogênio entre as Bases Nucleotídicas – Fitas Complementares Antiparalelas Ambos pares de bases possuem a mesma geometria 11

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Aceptores e doadores de elétrons Fenda maior Fenda menor

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Aceptores e doadores de elétrons Fenda maior Fenda menor Estrutura secundária do DNA 12

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Estrutura secundária do DNA 13

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Estrutura secundária do DNA 13

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Estrutura secundária do DNA 14

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Estrutura secundária do DNA 14

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Grupos químicos expostos nas fendas maior e menor do

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Grupos químicos expostos nas fendas maior e menor do DNA 15

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Estrutura secundária do DNA • Dupla hélice, onde cada

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Estrutura secundária do DNA • Dupla hélice, onde cada hélice é uma cadeia de nucleotídeos mantidos juntos por ligações fosfodiéster. • As duas hélices são mantidas juntas por pontes de hidrogênio, interações hidrofóbicas e forças de van der Waals (empilhamento de bases) 16

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Formas do DNA 17

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Formas do DNA 17

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Dobramento da dupla-hélice quando associada a proteínas 18

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Dobramento da dupla-hélice quando associada a proteínas 18

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Estrutura em α-hélice rígida de proteínas Estrutura em α-hélice

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Estrutura em α-hélice rígida de proteínas Estrutura em α-hélice flexível de ácidos nucléicos 19

3 -Estruturas dos Ácidos Nucléicos Estruturas não usuais Palíndromo Repetição especular 20

3 -Estruturas dos Ácidos Nucléicos Estruturas não usuais Palíndromo Repetição especular 20

3 -Estruturas dos Ácidos Nucléicos Estruturas não usuais Em forma de grampo: envolve uma

3 -Estruturas dos Ácidos Nucléicos Estruturas não usuais Em forma de grampo: envolve uma fita Em forma de cruz: envolve as duas fitas 21

3 -Estruturas dos Ácidos Nucléicos Estruturas não usuais Pareamento de Hoogsteen (Karst Hoogsteen –

3 -Estruturas dos Ácidos Nucléicos Estruturas não usuais Pareamento de Hoogsteen (Karst Hoogsteen – 1963) H-DNA: DNA tripla hélice 22

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Formas topológicas do DNA circular ccc. DNA – covalentely

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Formas topológicas do DNA circular ccc. DNA – covalentely closed circular DNA a) Circular relaxado b) Circular super-hélice (super-enovelado, super-torção) 23

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Formas topológicas do DNA circular a) Super-torção plectonêmica (inter-hélices)

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Formas topológicas do DNA circular a) Super-torção plectonêmica (inter-hélices) b) Super-torção em espiral (interação DNA-proteínas) 24

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Comparação entre a estrutura dupla hélice no DNA com

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Comparação entre a estrutura dupla hélice no DNA com 25 simples fita (hélice) no RNA

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Estrutura secundária do RNA Acima de 10 a centenas

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Estrutura secundária do RNA Acima de 10 a centenas de nucleotídeos 5 -10 nucleotídeos Região de alça em dupla hélice Grampo Haste-alça 26

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Simples fita Bolha Alça interna Grampo Estrutura secundária do

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Simples fita Bolha Alça interna Grampo Estrutura secundária do RNA Grampo. Hélice do tipo A 27

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Estrutura secundária do RNA M 1 Componente da RNase

3 -Estrutura dos Ácidos Nucléicos Estrutura secundária do RNA M 1 Componente da RNase P de Escherichia coli 377 bases 28

4 -Química dos Ácidos Nucléicos DNA dupla-fita Desnaturação Anelamento Parcialmente desnaturado Desnaturação total Associação

4 -Química dos Ácidos Nucléicos DNA dupla-fita Desnaturação Anelamento Parcialmente desnaturado Desnaturação total Associação por pareamento de bases DNA simples fita 29

4 -Química dos Ácidos Nucléicos Temperatura de fusão 30

4 -Química dos Ácidos Nucléicos Temperatura de fusão 30

Quando não mencionado, as figuras apresentadas foram retiradas, com ou sem modificações, das seguintes

Quando não mencionado, as figuras apresentadas foram retiradas, com ou sem modificações, das seguintes referências: 1. LODISH, H; DARNELL, J. E. e BALTIMORE, D. 2005. “Biologia Celular e Molecular”, 5ª edição. Artmed Editora SA. Porto Alegre-Brasil. (www. whfreeman. com/lodish) 2. LEHNINGER, A. L. NELSON, D. L e COX, M. M. 2000. “Principles of Biochemistry”. 3ª Edition, Worth Publitions. 3. Watson et al. , Mol. Biol. of the Gene. Referência Complementar 1. Bansal, M. DNA structure: Revisiting the Watson–Crick double helix. CURRENT SCIENCE, (85), NO. 11, 2003 31