Projekt Stepper Aplikace pro podporu vcerovov formalizace textovch

Projekt Stepper – Aplikace pro podporu víceúrovňové formalizace textových dokumentů Marek RŮŽIČKA Euro. MISE – Kardio, VŠE Praha KEG - 26. 3. 2003

Obsah • • • Metodiky víceúrovňové formalizace Souhrn požadavků na aplikaci Uživatelský interface Dodatečné moduly aplikace Možnosti využití Plány do budoucna KEG - 26. 3. 2003

Metodika víceúrovňové formalizace • Vznikla na základě zkušeností při formalizaci „lékařských doporučených postupů (LDP)“ • Ostatní metodiky určené k formalizaci LDP: – Modelově orientované (např. EON, GLIF 3, Asgaard) – Dokumentově orientované (GEM, Active. Guidelines) • Snaha vytvořit dokumentově orientovanou metodiku, řešící některé nedostatky výše uvedených KEG - 26. 3. 2003

Metodika víceúrovňové formalizace • Rozdělení procesu formalizace do několika úrovní • Každá úroveň představuje původní dokument v určitém stádiu formalizace doplněný o odkazy do předešlé úrovně • Pro ukládání úrovní použit jazyk XML • Výhody – minimalizaci ztráty obsažených informací – zprůhlednění celého procesu – omezení „subjektivizace“ zpracovávaných znalostí KEG - 26. 3. 2003

Původní představa formalizačního procesu Průběh formalizace • Identifikace základních znalostních bloků v textu <goal direct="yes" overall="no" id="g 4"> • <goal-of> Upřesnění vnitřní struktury znalostních bloků v <activity type="treatment"> následujících úrovních <goal id="g 6" type="complex"> BP lowering • Export výstupního formátu </activity> Thedo goal of antihypertensive treatment </goal-of> Související should be činnosti to achieve "optimal" or <is-goal> "normal" BP in pro young, middle-aged, orúrovně • Vyhotovení předpisu syntaktický zápis každé <state> v <compound-predicate DTD souboru <con>diabetic</con> subjects (below bool-op="or"> <predicate attribute="age" op="le" value="middle-aged"/> 130/85 mm Hg; bloků Tablea 1. )and at least "high • Anotace znalostních z nich vzešlých elementů <predicate attribute="Diabetes" op="eq" value="yes"/> -normal" <con> BP</con> in elderly pomocí XLinku pro případné sledování vývoje </compound-predicate> patientsbloků (below 140/90 mm Hg; konkrétních napříč úrovněmi. . . </goal> KEG - 26. 3. 2003

Skutečný průběh formalizace • • • Úroveň 1 – hrubá sémantická struktura Bezproblémové vyznačení znalostních bloků Velmi náročné ruční vyhotovení XLinkových odkazů Úroveň 2 – detailní sémantická struktura Dokument přestává být „čitelný“ Práce s XLinkem je již ručně nemožná Úroveň 3 – znalostní báze Ručně nelze vyhotovit Akutní potřeba softwarové podpory editace KEG - 26. 3. 2003

Stepper - požadavky na software • Odbourat ruční vyhotovení dokumentu • Skrýt XML zápis • Automatické vytvoření XLink odkazů • Umožnit sledování vývoje znalostního bloku napříč úrovněmi • Export do výstupního formátu KEG - 26. 3. 2003

Charakteristika Stepperu • • • Programovací jazyk - Java Vlastní DTD i XML parser Částečná podpora XLink/XPointer Zahrnuje XSLT procesor XALAN Vlastní procesor XKBT pravidel KEG - 26. 3. 2003

Stepper – Uživatelský interface Úroveň 1 - vyznačení znalostních bloků KEG - 26. 3. 2003

Stepper – Uživatelský interface Úrovně 2. . n – upřesnění sémantické struktury KEG - 26. 3. 2003

Pravidla • • • Transformační pravidla (XKBT) Definují povolené transformace znalostního bloku při přechodu do následující úrovně Typy pravidel - dekompoziční, agregační apod. Pravidla pro úpravu vazeb mezi atributy v rámci jedné úrovně XML/DTD architektura se tomuto problému nevěnuje a ani XML schémata nejsou ideální Zjednodušuje doplňování hodnot atributů Pomáhá udržovat konzistenci úrovně KEG - 26. 3. 2003

Pravidla • Systematická taxonomie transformačních pravidel i pravidel pro úpravu vazeb atributů • Modul schopný načítat a aplikovat oba typy pravidel • Integrovaný editor pravidel KEG - 26. 3. 2003

XKBT vs. XSLT Transformační jazyk XKBT (XML knowledge block transformation) • XKBT - jazyk určený k transformaci dokumentů XML (obdobně jako XSLT) • Na rozdíl od XSLT je kladen důraz na řízenou transformaci • Zaměřen na transformaci znalostí tzn. bloků, které je často nutné během transformace interpretovat doménovým expertem KEG - 26. 3. 2003

Pohled napříč úrovněmi Dva možné náhledy • Dohledávání všech zdrojových pasáží v textu pro zvolenou elementární část modelu • Dohledávání všech částí modelu pro určitou pasáž v textu KEG - 26. 3. 2003

Možnosti využití Transformace textových dokumentů • Aplikovatelné na dokumenty s podobnými vlastnostmi jako mají LDP • V případě LDP existuje několik formálních modelů založených na XML – GLIF 3, Asgaard Transformace mezi modely pro zachycování znalostí • Zrychluje proces transformace (v případě existence odpovídajících sad pravidel) • Při úpravách v jednom modelu lze snadno najít dopad změn i na druhý model • Sdílení nástrojů pro reprezentaci znalostí KEG - 26. 3. 2003

Plány do budoucna • Formalizace LDP pro léčbu NAP • Testování metodiky na modelu Asgaard • Vývoj dalších modulů (např. reprezentace rozhodovacích struktur) KEG - 26. 3. 2003