Paraclinique de gntique Paramtres gntiques pour la rsistance

Paraclinique de génétique « Paramètres génétiques pour la résistance à la souche vaccinale de Salmonella abortusovis, Rv 6 » Marie Lejong Katinka van Golen 2ème Doc

Objectifs 1) Étude de la susceptibilité à salmonella abortusovis chez le mouton 2) Étude du contrôle génétique de la réponse à l’infection (héritabilités et corrélations génétiques) quel(s) critère(s) sélectionner pour augmenter la résistance à S. abortusovis

Matériel Population « Inra 401 » de 1216 agneaux ü Issue de 30 pères ü Lignée développée à. p. d. 2 races: Berrichon du Cher et Romanov Souche vaccinale (atténuée) de S. abortusovis: souche Rv 6 Lieu: Institut National de la Recherche Agronomique en France Année: 2002

Protocole expérimental J 0 Prise de poids: Prise de sang: Inoculation IV: Wt 0 (objectif M: 38 kg et F: 32 kg) Ig. G 10 et Ig. M 0 108 bactéries de la souche vaccinale Rv 6 J 7 Prise de poids: Prise de sang: Wt 7 Ig. G 17 et Ig. M 7

Protocole expérimental J 10: Abattage et échantillonnage ( rate/nœuds lymphatiques) ü Enumération bactérienne Bg. S: n bactéries/g de rate Bg. S 01: absence/présence de bactéries dans la rate Bg. RN: n bactéries/g de NL préscapulaire droit Bg. LN: idem nœud lymphatique gauche ü Poids des organes Wts poids de la rate Wtln/rn poids des NL Wtrs: poids relatif de la rate: Wts/Wt 0 ü Perte de poids entre J 0 et J 7: loss-Wt

Modèles 1) Analyse des variables continues: le modèle gaussien: effets fixes significatifs effets fixes choisis dans le modèle final: P<0, 05

Modèles 2) Analyse de la variable binaire: le modèle seuil « présence ou absence de salmonella abortusovis dans un gramme de rate » .

Signification des effets testés variable Variance expliquée sexe poids Ig. M 0 Var Ig. M Log Ig. G 10 Log. Va. Ig. G 10 0. 35 0. 17 0. 13 0. 22 NS + NS NS NS Log. Bg. LN Log. Bg. RN Log. Bg. S 0. 10 0. 11 0. 05 ++ ++ ++ Log. Wt. LN Log. Wt. RN Log. Wt. S Log. Wtr. S 0. 17 0. 18 0. 30 0. 18 Log. Loss. Wt 0. 11 Bg. S 01 - type Nais/tétée ssgroupe +++ + ++ NS NS NS ++ + +++ +++ NS NS NS +++ +++ NS NS +++ +++ +++ NS NS +++ +++ +++ + ++ NS NS NS + + - Age père

Modèles • Estimation de l’héritabilité et des corrélations phénotypiques et génétiques: le modèle mixte linéaire: Ykl=Xkl. β+ε Y: variable aléatoire dépendante X: variable explicative β: effets fixes ε : erreur corrélée

Héritabilités, corrélations génétiques et phénotypiques Log Ig. G 10 Log Var. Ig. G 10 Ig. M 0 Var Ig. M Log LN Log Bg. RN Log Bg. S Log LN Log Wt. RN Log Wtr. S Log Loss. Wt Log Ig. G 10 0. 14 ± 0. 04 -0. 53 -0. 17 -0. 06 -0. 05 0. 19 -0. 11 0. 49 0. 48 0. 27 0. 12 Log Var. Ig. G 1 -0. 10 0. 30 ± 0. 03 0. 11 0. 55 0. 16 0. 12 0. 11 0. 28 0. 45 0. 27 0. 24 Ig. M 0 0. 13 0. 04 0. 64 ± 0. 03 -0. 12 0 0. 09 -0. 60 -0. 12 0. 25 -0. 38 Var. Ig. M -0. 01 0. 33 -0. 09 0. 37 ± 0. 02 0. 29 0. 25 0. 13 0. 14 0. 16 0. 31 0. 45 Log. Bg. LN 0. 03 0. 09 0. 04 0. 18 0. 22 ± 0. 03 O. 93 0. 56 0. 01 0. 06 0. 26 0. 41 Log. Bg. RN 0. 04 0. 06 -0. 02 0. 19 0. 53 0. 27 ± 0. 03 0. 51 -0. 06 0. 07 0. 38 0. 20 Log. Bg. S -0. 02 0. 07 -0. 04 0. 19 0. 16 0. 17 0. 06 ± 0. 01 -0. 34 -0. 12 0. 01 O. 58 Log. Wt. LN -0. 04 0. 01 0. 05 -0. 03 0. 25 0. 10 0. 02 0. 33 ± 0. 04 0. 89 0. 08 0. 06 Log. Wt. RN -0. 01 0. 05 0. 04 -0. 01 0. 16 0. 26 0. 04 0. 52 0. 26 ± 0. 03 0. 24 0. 16 Log. Wtr. S -0. 02 -0. 01 0. 13 0. 06 0. 01 0. 04 0. 01 0. 07 0. 10 0. 54 ± 0. 03 0. 24 Log. Loss. Wt -0. 03 O. 16 -0. 07 0. 40 0. 06 0. 09 0. 25 -0. 14 -0. 17 -0. 14 0. 10 ± 0. 02

Applications • Objectif: une plus grande résistance des moutons face à salmonella abortusovis. • En pratique: utilisation de Ig. M 0 comme critère de sélection? ? Remarques • Effet maternel? ? ? • Recherches à approfondir avant sélection!

Héritabilités, corrélations génétiques et phénotypiques Log Ig. G 10 Log Var. Ig. G 10 Ig. M 0 Var Ig. M Log LN Log Bg. RN Log Bg. S Log LN Log Wt. RN Log Wtr. S Log Loss. Wt Log Ig. G 10 0. 14 ± 0. 04 -0. 53 -0. 17 -0. 06 -0. 05 0. 19 -0. 11 0. 49 0. 48 0. 27 0. 12 Log Var. Ig. G 1 -0. 10 0. 30 ± 0. 03 0. 11 0. 55 0. 16 0. 12 0. 11 0. 28 0. 45 0. 27 0. 24 Ig. M 0 0. 13 0. 04 0. 64 ± 0. 03 -0. 12 0 0. 09 -0. 60 -0. 12 0. 25 -0. 38 Var. Ig. M -0. 01 0. 33 -0. 09 0. 37 ± 0. 02 0. 29 0. 25 0. 13 0. 14 0. 16 0. 31 0. 45 Log. Bg. LN 0. 03 0. 09 0. 04 0. 18 0. 22 ± 0. 03 O. 93 0. 56 0. 01 0. 06 0. 26 0. 41 Log. Bg. RN 0. 04 0. 06 -0. 02 0. 19 0. 53 0. 27 ± 0. 03 0. 51 -0. 06 0. 07 0. 38 0. 20 Log. Bg. S -0. 02 0. 07 -0. 04 0. 19 0. 16 0. 17 0. 06 ± 0. 01 -0. 34 -0. 12 0. 01 O. 58 Log. Wt. LN -0. 04 0. 01 0. 05 -0. 03 0. 25 0. 10 0. 02 0. 33 ± 0. 04 0. 89 0. 08 0. 06 Log. Wt. RN -0. 01 0. 05 0. 04 -0. 01 0. 16 0. 26 0. 04 0. 52 0. 26 ± 0. 03 0. 24 0. 16 Log. Wtr. S -0. 02 -0. 01 0. 13 0. 06 0. 01 0. 04 0. 01 0. 07 0. 10 0. 54 ± 0. 03 0. 24 Log. Loss. Wt -0. 03 O. 16 -0. 07 0. 40 0. 06 0. 09 0. 25 -0. 14 -0. 17 -0. 14 0. 10 ± 0. 02

Merci