Jalostuksen tavoiteoh tavoiteo jelma JTO Katariina Mki Kokonaisvaltaisen

  • Slides: 45
Download presentation
Jalostuksen tavoiteoh tavoiteo jelma (JTO) Katariina Mäki Kokonaisvaltaisen koiranjalostuksen tuki HETI ry www. koiranjalostus.

Jalostuksen tavoiteoh tavoiteo jelma (JTO) Katariina Mäki Kokonaisvaltaisen koiranjalostuksen tuki HETI ry www. koiranjalostus. fi katariina. maki@animal. helsinki. fi

4. Nykytilanne

4. Nykytilanne

4. 1 Populaation koko ja rakenne n n n Rodun vuosittainen sukusiitosaste u laskennassa

4. 1 Populaation koko ja rakenne n n n Rodun vuosittainen sukusiitosaste u laskennassa käytettyjen sukupolvien lkm mainittava – suositus min. 5 Tehollisen populaatiokoon arviointi Yksittäisten koirien jalostuskäyttö u korkeintaan 10% kahtena edell. vuonna syntyneistä tai 5% sukupolvea kohden u Käytetyimpien keskinäiset sukulaisuussuhteet

4. 1 Populaation koko ja rakenne Eri sukulinjojen edustus ja säilyminen n Populaatiot muissa

4. 1 Populaation koko ja rakenne Eri sukulinjojen edustus ja säilyminen n Populaatiot muissa maissa? n

Kahta laatua sukusiitosta Sukulaisten tahallinen paritus (nopea sukusiitos) u haitallista vain kyseisille eläimille n

Kahta laatua sukusiitosta Sukulaisten tahallinen paritus (nopea sukusiitos) u haitallista vain kyseisille eläimille n Koko populaation sukulaisuuden kasvu (pieni populaatio, matadorit) u haitallista – ja peruuttamatonta – koko populaatiolle n u sukulaisuussuhde pienenee vain risteyttämällä

Sukusiitosasteilla ei sinänsä merkitystä n n n ARVIOITA; eivät vertailukelpoisia rotujen tai yksittäisten koirien

Sukusiitosasteilla ei sinänsä merkitystä n n n ARVIOITA; eivät vertailukelpoisia rotujen tai yksittäisten koirien välillä u taustainfon määrä ratkaisee u tallennusvirheet? u asteet korkeiksi monen sukupolven mukaan laskettuna t mutaatiot, luonnonvalinta Vältettävä lähisukulaisten yhdistämistä Sukusiitosasteen kasvunopeus populaatiotasolla tärkeä!!

Sukusiitosasteen kasvunopeus n n Ei saa ylittää prosenttia sukupolvea kohden u useimmilla roduilla sukupolvien

Sukusiitosasteen kasvunopeus n n Ei saa ylittää prosenttia sukupolvea kohden u useimmilla roduilla sukupolvien välinen aika n. 4 vuotta -> sukusiitosaste saa kasvaa enintään 0. 25% vuodessa = esim. 3. 0% -> 3. 25% Tätä nopeampi kasvu merkitsee vaarallisen kapeaa jalostuspohjaa (Ne alle 50)

Sukusiitosasteet vuosina 70 -99 (min. 5 sukupolvea)

Sukusiitosasteet vuosina 70 -99 (min. 5 sukupolvea)

Tehollinen populaatiokoko, Ne n n n Kuvaa jalostuspohjan laajuutta Suositeltava Ne 100 -200 Yhteydessä

Tehollinen populaatiokoko, Ne n n n Kuvaa jalostuspohjan laajuutta Suositeltava Ne 100 -200 Yhteydessä niiden yksilöiden lukumäärään, jotka siirtävät geenejä seuraavaan sukupolveen Ne < Ntot Ne = 1/(2 F) F = sukusiitosasteen kasvunopeus F = 1/(2 Ne)

Ne = 4 Nm * 4 Nf Nm + Nf Nm = lisääntyvien urosten

Ne = 4 Nm * 4 Nf Nm + Nf Nm = lisääntyvien urosten määrä Nf = lisääntyvien narttujen määrä Uroksia 5 20 10 13 Narttuja 100 19 500 20 27 36 67 200 77 333

Ne = 4 Nm*Nf/(Nm+Nf) suomenajokoira

Ne = 4 Nm*Nf/(Nm+Nf) suomenajokoira

Tehollisen populaatiokoon laskukaavat… …antavat siis kaikki yliarvioita PAITSI tämä: Ne = 1/(2 F). Tämä

Tehollisen populaatiokoon laskukaavat… …antavat siis kaikki yliarvioita PAITSI tämä: Ne = 1/(2 F). Tämä kaava kuitenkin edellyttää joko suljettua populaatiota tai kantakoiriin asti tallennettuja sukupolvia (=nouseva sukusiitosaste)

…Lisää kaavoja n Sukusiitosasteen kasvunopeus, F = 1/8 Nm + 1/8 Nf Nm =

…Lisää kaavoja n Sukusiitosasteen kasvunopeus, F = 1/8 Nm + 1/8 Nf Nm = lisääntyvien urosten määrä Nf = lisääntyvien narttujen määrä

Käyttämättömien urosten osuus

Käyttämättömien urosten osuus

Käyttämättömien narttujen osuus

Käyttämättömien narttujen osuus

Ideaalipopulaatio Ei päällekkäisiä sukupolvia n Jokaisessa sukupolvessa yhtä paljon yksilöitä n Narttuja ja uroksia

Ideaalipopulaatio Ei päällekkäisiä sukupolvia n Jokaisessa sukupolvessa yhtä paljon yksilöitä n Narttuja ja uroksia yhtä paljon n Jokaista urosta ja narttua kohden yksi uros- ja yksi narttujälkeläinen n

Analysointiohjelmia n n n Descent: itb. biologie. huberlin. de/~hagen/Descent/ Breeder’s Assistant Pedigree Software: www.

Analysointiohjelmia n n n Descent: itb. biologie. huberlin. de/~hagen/Descent/ Breeder’s Assistant Pedigree Software: www. tenset. co. uk/ Pedigree Viewer: wwwpersonal. une. edu. au/~bkinghor/pedigree. htm Monia ohjelmia: www. vortex 9. org/ Pedig: wwwsgqa. jouy. inra. fr/sgqa/diffusions/pedig. E. htm ilmainen fortran-kääntäjä: http: //www. geocities. com/Athens/Olympus/55 64/g 77. htm

Analysointiohjelmia n Koirasuku: gamma. nic. fi/~baystone/koirasuku/koiras uku. htm

Analysointiohjelmia n Koirasuku: gamma. nic. fi/~baystone/koirasuku/koiras uku. htm

4. 2 Luonne ja käyttöominaisuudet ”A Dobermann that has no breed type may not

4. 2 Luonne ja käyttöominaisuudet ”A Dobermann that has no breed type may not be deserving of the title Dobermann, but if he has a vicious or cowardly character he is unworthy of the title dog” Malcom Willis, ”Genetics of the Dog”

4. 2 Luonne ja käyttöominaisuudet Missä ollaan nyt n Mitä parannettavaa, mitä tarkkailtavaa n

4. 2 Luonne ja käyttöominaisuudet Missä ollaan nyt n Mitä parannettavaa, mitä tarkkailtavaa n Todellinen tilanne vs. rotumääritelmä n Muut maat? n

4. 3 Terveys 4. 3. 1 PEVISA-ohjelma n n n n n Lyhyt kuvaus

4. 3 Terveys 4. 3. 1 PEVISA-ohjelma n n n n n Lyhyt kuvaus Lähteet Periytymistapa ja periytymisaste Jalostusrajoitukset Yhteenveto tutkimustuloksista 5 v ajalta Kuinka paljon rajoitukset kaventaneet jalostusmateriaalia Sairauksien merkitys Yhteenveto PEVISAn muutoksista Muut maat?

Periytymistapoja (1) Dominanssi u alleeli tuo yksinkertaisenakin itsensä esiin ja peittää toisen u esim.

Periytymistapoja (1) Dominanssi u alleeli tuo yksinkertaisenakin itsensä esiin ja peittää toisen u esim. genotyypit BB, Bb ja bb fenotyypit musta ja ruskea n Epätäydellinen dominanssi = intermediaarinen periytyminen u Bb on BB: n ja bb: n välimuoto n

Periytymistapoja (2) n n n Epistasia u eri lokuksissa olevat geenit vaikuttavat toisiinsa Pleiotropia

Periytymistapoja (2) n n n Epistasia u eri lokuksissa olevat geenit vaikuttavat toisiinsa Pleiotropia u geeni vaikuttaa useampaan kuin yhteen ominaisuuteen Sukupuolikromosomaalinen periytyminen u uroksella X: n geeneistä vain 1 versio riittää tuomaan ominaisuuden esiin – siirtää tyttärilleen X: n, pojilleen Y: n

Periytymistapoja (3) Kvalitatiivinen Kvantitatiivinen vain muutama geeni monta geeniä ympäristöllä vain pieni vaikutus ympäristöllä

Periytymistapoja (3) Kvalitatiivinen Kvantitatiivinen vain muutama geeni monta geeniä ympäristöllä vain pieni vaikutus ympäristöllä suuri vaikutus nähdään päälle genotyyppi fenotyyppi turkin väri, monet silmäsairaudet rakenne, luustoviat, luonne

Periytymistapoja (4) n Epätäydellinen penetranssi tarjottu usein selitykseksi kun dominoivaksi luultu alleeli ei näykään

Periytymistapoja (4) n Epätäydellinen penetranssi tarjottu usein selitykseksi kun dominoivaksi luultu alleeli ei näykään fenotyypissä Useat tällaiset ominaisuudet kvantitatiivisia!

Periytymistapoja (5) n Kynnysominaisuudet u Polygeeninen ominaisuus, fenotyyppejä kuitenkin vain muutama u Ominaisuutta aiheuttavia

Periytymistapoja (5) n Kynnysominaisuudet u Polygeeninen ominaisuus, fenotyyppejä kuitenkin vain muutama u Ominaisuutta aiheuttavia geenejä oltava tietty määrä ennen kuin ominaisuus näkyy u Esim. epilepsia (? ), jotkut sydänviat

4. 3 Terveys 4. 3. 2 Muut Suomessa rodulla todetut merkittävät sairaudet n n

4. 3 Terveys 4. 3. 2 Muut Suomessa rodulla todetut merkittävät sairaudet n n n n Esiintyvyys, periytymistapa Jos 3% koirista sairastaa resessiivistä sairautta, kantajia 28% Normaali lisääntyminen Miten tietoa kerätään Merkitys Muut maat? Lähteet

Haitallisen alleelin kantajien lukumäärä (1) Esimerkiksi PRA: genotyyppi fenotyyppi genotyyppifrekvenssi terve, R, dominoiva sairas,

Haitallisen alleelin kantajien lukumäärä (1) Esimerkiksi PRA: genotyyppi fenotyyppi genotyyppifrekvenssi terve, R, dominoiva sairas, r, resess. RR Rr rr terve kantaja sairas p 2 2 pq p+q = 1 q 2

Haitallisen alleelin kantajien lukumäärä (2) jos noin 3/100 koirasta sairastaa PRA: ta eli q

Haitallisen alleelin kantajien lukumäärä (2) jos noin 3/100 koirasta sairastaa PRA: ta eli q 2 = 0. 03 (3%) q = fr(r) = 0. 03 = 0. 17 (17%) p = fr(R) = 1 -0. 17 = 0. 83 (83%) fr(Rr) = 2 pq = 2*0. 17*0. 83 = 0. 28 SIIS 28% yksilöistä kantaa PRA: ta aiheuttavaa alleelia

4. 3 Terveys 4. 3. 3 Rodulla muissa maissa kuvatut sairaudet n n n

4. 3 Terveys 4. 3. 3 Rodulla muissa maissa kuvatut sairaudet n n n Yhteenveto Online Mendelian Inheritance in Animals (OMIA Database): kaikki koirien perinnöllisistä sairauksista ja vioista tehdyt tutkimukset, viitteet ja yhteenvetoja: morgan. angis. su. oz. au/Databases/BIRX/omia/ Kirjallisuus: Nicholas (Veterinary Genetics), Ruvinsky (Genetics of the Dog), Willis (Genetics of the Dog)

4. 4 Ulkomuoto n Ulkomuodon liioiteltu jalostaminen u liian pieni / liian suuri koko

4. 4 Ulkomuoto n Ulkomuodon liioiteltu jalostaminen u liian pieni / liian suuri koko u lisääntynyt loukkaantumisten riski u hengitysvaikeudet u ylenmääräinen nahka u synnytysvaikeudet u ja paljon muuta. . Kielletyt rodut? ? ?

5. Yhteenveto aiemman tavoiteohjelman toteutumisesta

5. Yhteenveto aiemman tavoiteohjelman toteutumisesta

5. Yhteenveto aiemman ohjelman toteutumisesta Tässä vaiheessa kaikilla ei vielä konkreettisia tavoitteita aiemmissa ohjelmissa

5. Yhteenveto aiemman ohjelman toteutumisesta Tässä vaiheessa kaikilla ei vielä konkreettisia tavoitteita aiemmissa ohjelmissa n Toimenpiteet: mitä tehty n Seuraus: mitä saatu aikaan n Jos menty huonompaan suuntaan, miksi? n

6. Jalostuksen tavoitteet ja strategiat Kun rodun tilanne eri ominaisuuksien suhteen tiedetään, voidaan miettiä

6. Jalostuksen tavoitteet ja strategiat Kun rodun tilanne eri ominaisuuksien suhteen tiedetään, voidaan miettiä karsinnan mahdollisuuksia

Populaatiokoon vaikutus Suurin osa >400 maailman koirarodusta hyvin pieniä populaatioita n Pieni populaatiokoko =

Populaatiokoon vaikutus Suurin osa >400 maailman koirarodusta hyvin pieniä populaatioita n Pieni populaatiokoko = hyvin vähän mahdollisuuksia jalostusvalintaan n Pieni populaatiokoko = sukusiitoksen välttäminen vaikeaa n Pienen populaation jalostus: u minimaalista valintaa, maksimaalista sukusiitoksen välttämistä n

Pienen populaation hoito

Pienen populaation hoito

Jos tilanne ei vielä ole karannut käsistä. . n n n n Jalostusmateriaalin tasainen

Jos tilanne ei vielä ole karannut käsistä. . n n n n Jalostusmateriaalin tasainen käyttö Urosten määrä suhteessa narttuihin mahdollisimman suuri Populaatiokoon pitäminen vakaana Ei samojen yhdistelmien toistamista Väri- ja kokomuunnosten risteytykset helpoiksi Sukutaulusta löytyvien esi-isien lkm mahdollisimman suuri Rotuunotot

Jos tilanne ei vielä ole karannut käsistä. . Alhainen MK (mean kinship) = arvokas

Jos tilanne ei vielä ole karannut käsistä. . Alhainen MK (mean kinship) = arvokas jalostuskoira n Vierasta materiaaliakin käytettävä harkitusti u vaarana sukusiitoksen lisääminen ennestään ja tuontieläinten vikojen lisääntyminen populaatiossa n

Miten enemmän koiria käyttöön? Madalletut näyttelyvaatimukset u kakkonen tarpeeksi hyvä u jalostustarkastusten suosiminen luotettavampia

Miten enemmän koiria käyttöön? Madalletut näyttelyvaatimukset u kakkonen tarpeeksi hyvä u jalostustarkastusten suosiminen luotettavampia n Urosten käyttömäärien seuraaminen ja niistä tiedottaminen n Kompromissit – kaiken käytettävän materiaalin ei tarvitse olla huippuluokkaa! n

Kun tilanne huonompi n Risteytys u rotumuunnokset u samankaltaiset rodut Muuntelu Sairaudet Vastustuskyky Elinvoima

Kun tilanne huonompi n Risteytys u rotumuunnokset u samankaltaiset rodut Muuntelu Sairaudet Vastustuskyky Elinvoima

6. 1 Visio Mitä on odotettavissa tulevaisuudessa n Mihin suuntaan rotu kehittyy n Alkuperäinen

6. 1 Visio Mitä on odotettavissa tulevaisuudessa n Mihin suuntaan rotu kehittyy n Alkuperäinen vs. nykyinen käyttötarkoitus – tulevaisuus? n

6. 2 Rotujärjestön tavoitteet n Konkreettiset, selkeät jalostustavoitteet u populaation tila ja rakenne t

6. 2 Rotujärjestön tavoitteet n Konkreettiset, selkeät jalostustavoitteet u populaation tila ja rakenne t tehollisen populaatiokoon kasvattaminen = sukusiitosasteen kasvunopeuden rajoittaminen u luonne t tavoiteosuus testattaville, esim. 20% u käyttö

6. 2 Rotujärjestön tavoitteet terveys t tavoiteosuus tutkittaville t sairausfrekvenssien alentaminen t kartoitus on

6. 2 Rotujärjestön tavoitteet terveys t tavoiteosuus tutkittaville t sairausfrekvenssien alentaminen t kartoitus on myös tavoite u ulkomuoto u tärkeysjärjestys? Miten suhteutuvat vision kanssa Ovatko tavoitteet muuttuneet? u n n

6. 3 Rotujärjestön strategia n n n Keinot millä päästään tavoitteisiin u urosten jälkeläisarvostelut

6. 3 Rotujärjestön strategia n n n Keinot millä päästään tavoitteisiin u urosten jälkeläisarvostelut = käytetyimpien urosten listaus ja niiden jälkeläisten keskiarvo eri ominaisuuksissa u sairauksien vähentäminen: vanhemmat, edelleen terveet koirat jalostuskäyttöön u tiedon keruu ihan joka asiasta Rotua osattava tarkastella populaationa, ei yksittäisinä koirina Lyhyen ja pitkän aikavälin keinot

n n n 6. 4 Uhat ja mahdollisuudet 6. 5 Varautuminen ongelmiin 6. 6

n n n 6. 4 Uhat ja mahdollisuudet 6. 5 Varautuminen ongelmiin 6. 6 Toimintasuunnitelma JTO: n toteuttamiseksi n 7. Tavoiteohjelman toteutumisen seuranta u jottei mentäisi myöskään yli