Zadanie I Poniej przedstawiono fragment sekwencji genu GAL

Zadanie I Poniżej przedstawiono fragment sekwencji genu GAL 1 S. cerevisiae. GAL 4 -393 -374 -356 GAL 4 1 5’ TGAAGTACGG ATTAGAAGCC GCCGAGCGGG CGACAGCCCT CCGACGGAAG ACTCTCCTCC GTGCGTCCTC GTCTTCACCG sekwencja UASG 80 81 -291 GAL 4 GTCGCGTTCC TGAAACGCAG ATGTGCCT CG CGCCGCACTG CTCCGAACAA TAAAGATTCT ACAATACTAG CTTTTATGGT 160 161 TATGAAGAGG AAAAATTGGC AGTAACCTGG CCCCACAAAC CTTCAAATTA ACGAATCAAA TTAACAACCA TAGGATGATA 240 241 -86 ATGCGATTAG TTTTTTAGCC TTATTTCTGG GGTAAT CAGCGAAGCG ATGATTTTTG ATCTATTAAC AGATATATAA 320 321 (+1) ATGGAAAAGC TGCATAACCA CTTTAACTAA TACTTTCAAC ATTTTCAGTT TGTATTACTT CTTATTCAAA TGTCATAAA A 400 401 +62 GTATCAACAA AAAATTGTTA ATATACCTCT ATACTTTAAC GTCAAGGAGA AAAAACTATA ATGACTAAAT CTCATTCAGA 480 481 AGAAGTGATT GTACCTGAGT TCAATTCTAG CGCAAAGGAA TTACCAAGAC CATTGGCCGA AAAGTGC sekwencja UASG blok TATA (ang. TATA-box) Met Thr Lys 3’ 574 Polecenia. - Podaj orientację nici DNA. Odszukaj i zaznacz blok TATA. Nad wszystkimi zaznaczonymi sekwencjami wpisz, jakie białka wiążą się z nimi, a pod sekwencjami podaj ich nazwę. Podaj pozycję pierwszego nukleotydu z każdej z zaznaczonych sekwencji, według przyjętej konwencji numeracji w genie. Zaznacz pierwsze trzy kodony sekwencji kodującej i podaj pozycję pierwszego nukleotydu tej sekwencji. Podaj pozycję sekwencji 5'UTR , według numeracji przyjętej dla opisania genu.

Zadanie II Celem niniejszego zadania jest prezentacja i omówienie posttranskrypcyjnych etapów ekspresji genu eukariotycznego wraz z elementami strukturalnymi, warunkującymi ich właściwy przebieg. ekson 1 ekson 2 ekson 3 DNA +1 5’ 3’ ATTTATTATGGAGTATGGACATCAGT AGCGCTAGACCAGATTCAGT AGAAACGACCATTGGATTAAGCTCAATAAAGCATAGCCAGCGACCTGCAGTGTTGTCCTAG intron 1 intron 2 promotor Transkrypcja 1 pre-m. RNA 2 5’ AUUUAUUAUGGAGUAUGGACAUCAGU---AGCGCUAGACCAGAUUCAGU---AGAAACGACCAUUGGAUUAAGCUCAAUAAAGCAUAGCCAGCGACCUGCAGUGUUGUCCUAG m. RNA Dodawanie czapeczki Składanie pre-m. RNA (ang: splicing) Poliadenylacja 5’UTR Te procesy zachodzą kotranskrypcyjnie 3’UTR 5’ m 7 Gppp. AUUUAUUAUGGAGUAUGGACAUCACGCUAGACCAGAUUCAAAACGACCAUUGGAUUAAGCUCAAUAAAGCAUAGCCAGCGACCUGCA(A)n Sekwencja kodująca Transport m. RNA Translacja polipeptyd 3’ Jądro Cytoplazma N-Met Glu Tyr Gly His Ala Arg Pro Asp Ser Lys Arg Pro Leu Asp -C N- M E Y G H H A R P D S K R P L D -C Obróbka potranslacyjna Kompartmentacja Polecenia. 3’ AKTYWNE BIAŁKO - Narysuj schemat pre-m. RNA, uwzględniając sekwencję. - Narysuj schemat dojrzałego m. RNA, zaznaczając otwartą ramkę odczytu oraz sekwencję 5’ i 3’ UTR. - Narysuj schemat polipeptydu, zaznaczając aminokwasy kodowane przez otwartą ramkę odczytu. - Przy strzałkach podaj w odpowiedniej kolejności nazwy procesów, prowadzących do powstania aktywnego białka oraz zapisz, w których przedziałach komórkowych zachodzą. - Zaznacz orientację nici pre-m. RNA i m. RNA oraz końców polipeptydu. - Zaznacz nad sekwencją DNA pozycje eksonów. - UWAGA 1 – w trakcie transkrypcji zachodzą kolejne etapy dojrzewania pre-m. RNA. 2 – w związku uwagą nr 1, taka cząsteczka jest hipotetyczna.