Watson et al BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE Zanichelli
Watson et al. , BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2005
Watson et al. , BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2005
Watson et al. , BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2005
Ruolo degli Isolatori
Watson et al. , BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2005
Watson et al. , BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2005
LCR and insulators § An LCR is located at the 5 end of the domain and consists of several hypersensitive sites. § Insulators are specialized chromatin structures that have hypersensitive sites. § All known insulators are able to block passage of any activating or inactivating effects from enhancers, silencers, or LCRs. § In some cases, insulators have directionality, and may stop passage of effects in one direction but not the other.
Watson et al. , BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2005
Altri elementi del promotore di pol II
Fattori di trascrizione negli eucarioti (trans-acting factors = fattori che agiscono in trans ) Possono essere distinti in: - Fattori generali - Fattori specifici (attivatori)
Complesso di inizio su un promotore Pol II 1 TBP + vari TAF -5 0 -4 0 -3 0 -2 0 TATA TFII D TATA TFII B TFIIF Pol II TFII E Pol -1 0 1 10 20
Watson et al. , BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2005
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006
Attivazione della trascrizione
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006
Initiation at pol II promoters ¨ Binding of TFIID to the TATA box is the first step in initiation. ¨ Other transcription factors bind to the complex in a defined order, extending the length of the protected region on DNA. ¨ When RNA polymerase II binds to the complex, it initiates transcription.
Later events of pol II initiation ¨ TFIIE and TFIIH are required to melt DNA to allow polymerase movement. ¨ Phosphorylation of the CTD may be required for elongation to begin. ¨ Further phosphorylation of the CTD is required at some promoters to end abortive initiation. ¨ The CTD may coordinate processing of RNA with transcription.
Fattori di trascrizione negli eucarioti (trans-acting factors = fattori che agiscono in trans ) Possono essere distinti in: - Fattori generali - Fattori specifici (attivatori)
Struttura“modulare” degli attivatori trascrizionali • legame al DNA • transattivazione • dimerizzazione • legame al ligando
Strategia per lo studio degli attivatori
Struttura degli attivatori
Scambio di domini (attivatori chimerici)
Scambio di domini N h. GR h. ER Recettore “chimera” modulatore DNA ligando C
Watson et al. , BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2005
Combinazioni di omodimeri ed eterodimeri
Domini di attivazione • Domini acidici: es. GAL 4 • Domini ricchi di glutammine: es. Sp 1 • Domini ricchi di proline: es. CTF
Famiglie di fattori di trascrizione • Domini a zinco • Omeodominio (elica-giro-elica) HTH • Elica-ansa-elica HLH • Cerniera di leucina
Watson et al. , BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2005
Watson et al. , BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2005
Complesso d’inizio di pol II
RNA pol II holoenzyme ¨ Includes pol II, GTFs, Srb/Mediator complex ¨ Exists in more than one form ¨ Can initiate transcription and respond to activators
Regolazione negativa Watson et al. , BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2005
Watson et al. , BIOLOGIA MOLECOLARE DEL GENE, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2005
Regolazione degli attivatori
Trasduzione del segnale dalla membrana al nucleo
Le vie delle MAP chinasi
Trasduzione del segnale dalla membrana al nucleo
- Slides: 47