Virologisk och epidemiologisk influensavervakning Mia Brytting Folkhlsomyndigheten mnen

Virologisk och epidemiologisk influensaövervakning Mia Brytting, Folkhälsomyndigheten

Ämnen • Övervakningssystem • Viruskaraktärisering • Diagnostik Sid .

Influensapyramiden Sid 3.

Olika influensavarianter drabbar olika hårt • Från förkylning till död pga organsvikt/lunginflammation • A(H 3 N 2)>A(H 1 N 1)pdm>B • Barn har alltid högre incidens, men dör sällan • B och A(H 1 N 1)pdm 09 drabbar större andel yngre och vuxna. • A(H 3 N 2) fler äldre dör. • DET FINNS VACCIN! Sid 4. 2021 -10 -24

Riskgrupper för svår influensasjukdom • personer 65 år och äldre • gravida efter graviditetsvecka 16 (se nedan) • vuxna och barn över 6 månader med följande sjukdomar eller tillstånd: – kronisk hjärtsjukdom – kronisk lungsjukdom, såsom KOL och svår astma – andra tillstånd som leder till nedsatt lungfunktion eller försämrad hostkraft och sekretstagnation (till exempel extrem fetma, neuromuskulära sjukdomar eller flerfunktionshinder) – kronisk lever- eller njursvikt – diabetes mellitus – tillstånd som innebär kraftigt nedsatt immunförsvar på grund av sjukdom eller behandling Sid .

Smittade • Cirka 2/3 av influensainfektionerna är asymtomatiska • Mäts inte idag • Kan analyseras mer seroepidemiologi • Om det görs inför kommande säsong kan med identifiera åldersgrupper som har låg immunitet Sid 6. 2021 -10 -24

Sjuka • Webbsök - uppskattningar av influensa baserat på sökningar på 1177. se • Samtal 1177 - Syndromövervakning Sid 7. 2021 -10 -24

Söker vård • Sentinelprovtagning - läkare på vårdcentraler som provtar patienter med influensaliknande symtom. – Andel positiva, typ, subtyp och linjetyp – Prover för viruskaraktärisering – Geografisk spridning – Patientdata – Åldersgrupp – Riskgrupp – Vaccinationsstatus Sid 8. 2021 -10 -24

Sjukhusvård • Laboratorierapportering – Anmälningsplikt (Typ, Datum, Ålder, Kön, Geografi) – Andel positiva via frivilligrapportering av nämnardata • Viruskaraktärisering • Antiviralförsäljning 1200 Totalt (alla typer) 1000 Influensa A 15/16 Antalet laboratorieverifierade fall Influensa B 15/16 800 600 400 200 0 40 42 44 46 48 50 52 1 3 2015 7 9 11 2016 Vecka Sid 9. 2021 -10 -24 5 13 15 17 19

Intensivvårdade • Svenska intensivvårdsregistrets influensamodul SIR-I/SIR – Antal fall – Typ, subtyp – Patientdata – – Åldersgrupp Riskgrupp Vaccinationsstatus Död efter 30 dagar • Viruskaraktärisering – Virulens? Sid 10. 2021 -10 -24

Död • Överdödlighet (Alla dödsfall/vecka, åldersgrupper) • Död 30 dagar efter diagnos (Anmälda fall) • Viruskaraktärisering – Virulens? År och vecka Sid 11. 2021 -10 -24

Viruskaraktärisering – Typ, subtyp, linjetyp 2013 -2014 -2015 -2016 Influenza type Sentinel Lab A(H 1 N 1)pdm 09 73. 1% 67. 2% 9. 4% 6. 4% 70, 5% 63, 5% A(H 3 N 2) 14. 4% 24. 6% 52. 3% 57. 8% 3% 1. 3% 0. 6% 0. 5% 1. 1% 24, 4% 17, 9% 11. 2% 7. 6% 37. 8% 34. 7% 2, 1% 5, 6% B/Victoria lineage B/Yamagata lineage • Som vanlig ser man mer A(H 3 N 2) på sjukhusen (lab). • Mildare varianter (A(H 1 N 1)pdm 09 och B) påvisas i högre grad inom primärvården (sentinel). Sid 12. 2021 -10 -24

Helgenomssekvensering • Hemagglutinin - vaccinlikhet, receptoraffinitet • Neuraminidas – resistens • PB 1, PB 2, PA, NS – virulensfaktorer • NP, M - reasortment • Resultat skickas till WHO och ECDC • Ligger till grund för nytt vaccin Sid 13. 2021 -10 -24

Virusisolering • Nästa vaccinstam? • Hämagglutinationsinhibition – vaccinlikhet (serologiskt) • Fenotypisk resistensbestämning • Utan era prover, inga nya vaccinstammar! Sid 14. 2021 -10 -24

Diagnostik av influensa 2009 Immuno- Direkt IF Indirekt IF kromatografi Sid . PCR

Skifte i metodologi • Deltagarantal, 35, 26, 31, 34, 38, 34. 90 80 70 2003 60 2004 50 2005 2006 40 2007 2008 30 2009 20 10 0 Direkt IF Sid . Indirekt IF PCR Im. kromatografi

Analytisk känslighet Binax Now Quick Vue Indirekt IF BD Directigen IF 49% Snabbtester 33 -39% Sid .

Enkät om influensadiagnostik, 2016 • Enkäten skickades till 25 laboratorier • Svar erhölls från samtliga • Fantastiskt ! Sid 18. 2021 -10 -24

In house eller kommersiell PCR? Vilken sorts PCR använder ni för influensaanalys i ditt mikrobiologiska laboratorium? Kommersiell PCR 84% 15 laboratorier använder bara en kommersiell PCR 6 laboratorier använder både kommersiell och in house PCR In house PCR 40% 0% Sid 19. 2021 -10 -24 20% 4 laboratorier använder bara en in house PCR 60% 80% 100%

Vilket/vilka kit använder ni för kommersiell PCR-analys i ditt mikrobiologiska laboratorium? Gene. Xperts A/B/p. H 1 N 1 3 Gene. Xperts A/B/RSV 10 Simplexa Flu A/B & RSV Direct 6 Film. Array Respiratory panel 1 Diagenode Respiratory Flu A/B real-time 1 Anyplex ll. RV 16 detection 1 Allplex TM Respiratory Panel 1 Annat 1 0 Sid 20. 2021 -10 -24 Annat: FTD 33 respiratory patogen panel 0 5 10 15 20

21 laboratorier använder snabb. PCR för sin diagnostik 9 gör analys på det mikrobiologiska laboratoriet 6 laboratorier gör analyser på dagtid varje dag i veckan 2 laboratorier gör analyser på dagtid vardagar och lördagar på dagtid 1 laboratorium gör analyser på dagtid varje vardag 12 gör analys antingen på mikrobiol. lab. och/eller klin kem. lab. 10 laboratorier har täckning dygnet runt, sju dagar i veckan 1 laboratorium gör analyser på dag och kväll sju dagar i veckan 1 laboratorium gör analyser på dagtid sju dagar i veckan Sid 21. 2021 -10 -24

Vilket/vilka kit används för influensaanalys vid laboratoriet för klinisk kemi Gene. Xperts A/B/p. H 1 N 1 1 Gene. Xperts A/B/RSV 7 Simplexa Flu A/B & RSV Direct 3 Film. Array Respiratory panel 0 Diagenode Respiratory Flu A/B real-time 1 Anyplex ll. RV 16 detection 0 Allplex TM Respiratory Panel 1 0 0 Sid 22. 2021 -10 -24 1 2 3 4 5 Antal 6 7 8 9 10

När är influensadiagnostik tillgänglig Chart Title 20 18 16 14 12 10 8 6 4 2 0 Alla dagar Vardag+Lör Dygnet runt Sid 23. 2021 -10 -24 Vardagar Dag+Kväll Dagtid

Är ditt laboratorium intresserat av att delta i kvalitetssäkringen av snabb-PCR under säsongen 2016 -2017? Ja 22 Nej 1 Vet ej 2 0 Sid 24. 2021 -10 -24 5 10 15 20 25