VASP QUANTUM ESPRESSO SIESTA ABACUS VASP Vienna Abinitio

常用第一性原 理计算软件 VASP QUANTUM ESPRESSO SIESTA ABACUS

VASP: Vienna Ab-initio Simulation Package 安装：针对不同计算平台，配置makefile. include文件 以TC 4600平台为例 Fortran 编译器: PGI 或Intel MPI 库: Open MPI 或 Intel MPI 数学库：BLAS，LAPACK/sca. LAPACK，FFTW；或 Intel MKL $ module purge $ module load intel/2018. update 3 $ module load intelmpi/2018. update 3 $ module load mkl/2018. update 3 Gamma 点 自旋轨道耦合 标准版本 • Intel 2018 ifort • Intel MPI • Intel MKL

Quantum Espresso（简称QE） Quantum op. En-Source Package for Research in Electronic Structure，Simulation，and Optimization 安装（以qe-6. 3 版本为例）： 首先，直接下载软件(www. quantum-espresso. org/download)，获取源代码，解压 独立软件包模块： 通用模块：

Quantum Espresso（简称QE） Quantum op. En-Source Package for Research in Electronic Structure，Simulation，and Optimization 安装：针对不同计算平台，配置make. inc文件 以TC 4600平台为例 Fortran 编译器: PGI 或Intel MPI 库: Open MPI 或 Intel MPI 数学库：BLAS，LAPACK/sca. LAPACK，FFTW；或 Intel MKL 加载编译环境 $ module purge $ module load intel/2018. update 3 $ module load intelmpi/2018. update 3 $ module load mkl/2018. update 3 • Intel 2018 ifort • Intel MPI • Intel MKL 设置环境变量 $ export MPIF 90=mpiifort $ export F 90=ifort $ export CC=icc $ export F 77=ifort 编译PW模块 $ make pw 生成make. inc文件 可执行文件：$Your. Path/qe-6. 3/bin/pw. x $. /configure BLAS_LIBS=-mkl SCALAPACK_LIBS="-lmkl_scalapack_lp 64 -lmkl_blacs_intelmpi_lp 64" FFT_LIBS=-mkl

Quantum Espresso（简称QE） Quantum op. En-Source Package for Research in Electronic Structure，Simulation，and Optimization 控制�算�型，�入�出参数 输入文件：Si 2_diamond. scf. in （文件名可自定义） 描述体系参数 自洽求解参数 晶格矢量 元素，��文件，原子位置 布里渊区k 点

Quantum Espresso（简称QE） Quantum op. En-Source Package for Research in Electronic Structure，Simulation，and Optimization 输出文件：标准输出，即屏幕输出 电子迭代过程 晶胞，能量截断值 程序版本，并行核数

Quantum Espresso（简称QE） Quantum op. En-Source Package for Research in Electronic Structure，Simulation，and Optimization 输出文件： 从输出文件获取信息： l 总能量 $ grep ‘! total energy’ l 费米能级 $ grep ‘Fermi energy’ 更多信息可进入到文件查看 参考资料： 1. http: //www. quantum-espresso. org/ 2. http: //www. quantum-espresso. org/Doc/INPUT_PW. html 3. www. quantumchemistry. net/node/546

SIESTA: Spanish Initiative for Electronic Simulations with Thousands of Atoms SIESTA是由西班牙开发的第一性原理软件包，Fortran语言 特色： 原子轨道基组，线性标度算法，可以处理较大尺寸的体系； 模守恒（Norm Conserving）赝势； 基于GNU GPL协议开源发布； 官网：https: //departments. icmab. es/leem/siesta/

SIESTA: Spanish Initiative for Electronic Simulations with Thousands of Atoms 功能： 参考SIESTA手 册

SIESTA: Spanish Initiative for Electronic Simulations with Thousands of Atoms 安装（以siesta 4. 1 -b 3 版本为例）： 首先，直接下载软件(https: //launchpad. net/siesta)，获取源代码，解压 主要目录： l siesta-4. 1 -b 3: 解压后的根目录 l Docs: 文档 l Src: 源代码 l Examples : 算例 l Tests: 测试例子（更多体系、更多功能） l Tutorial: 生成基组(Bases) ，赝势(Pseudo)教程 l Util: 后处理 具 l Obj: 存放编译过程中产生的文件，也是编译目录

SIESTA: Spanish Initiative for Electronic Simulations with Thousands of Atoms 安装：针对不同计算平台，配置arch. make文件 以TC 4600平台为例 Fortran 编译器: MPI 库: Open MPI 或 Intel MPI 数学库：BLAS，LAPACK/sca. LAPACK；或 Intel MKL 加载编译环境 $ module purge $ module load intel/2018. update 3 $ module load intelmpi/2018. update 3 $ module load mkl/2018. update 3 编辑arch. make文件 可执行文件：$Your. Path/siesta-4. 1 -b 3/Obj/siesta • Intel 2018 ifort • Intel MPI • Intel MKL

SIESTA: Spanish Initiative for Electronic Simulations with Thousands of Atoms 输入文件：*. fdf文件，*. psf文件 Si. psf 文件 赝势文件*. psf 使用前需要测 试！！！ si 2. fdf 文件

SIESTA: Spanish Initiative for Electronic Simulations with Thousands of Atoms 输出文件： 从输出文件获取信息： l 总能量 $ grep ‘siesta: E_KS’ 更多信息可进入到文件查看 参考资料： 1. https: //departments. icmab. es/leem/siesta/ 2. https: //departments. icmab. es/leem/siesta/Documentatio n/Manuals/siesta-4. 0. pdf

Plane waves/Atomic orbital dual bases sets 已 完 成 Normal conserving pseudopotential (UPF format) V 1. 0 Functionals: LDA, GGA, spins, van der Waals (DFT-D 2) Electronic structures，structural relaxation Molecular dynamics (NVE，NVT) stress and cell optimization Real-time TDDFT 测 试 中 Berry phase, electric polarization Interface to Wannier 90 spin-orbital coupling Hybrid functional (HSE and PBE 0) Transports 进 行 中 RPA, GW, optical, dielectric properties Will be included in the next release V 1. 1

ABACUS: Atomic-orbital Based Ab-initio Computation at UStc 安装（以ABACUS v 1. 0. 1版本为例）： 首先，直接下载软件(http: //abacus. ustc. edu. cn/)，获取源代码，解压 主要目录： l ABACUS. 1. 0. 1_2016 -12 -19 : 解压后的根目录 l source: 源代码 l examples : 算例 l data: 赝势、原子轨道基组 l tools: 基组产生 具

ABACUS: Atomic-orbital Based Ab-initio Computation at UStc 安装：针对不同计算平台，配置source/Makefile. vars文件 以TC 4600平台为例 C++ 编译器 MPI 库: Open MPI 或 Intel MPI 数学库：BLAS，LAPACK/sca. LAPACK，FFTW, boost；或 Intel MKL • Intel 2018 ifort • Intel MPI • Intel MKL 加载编译环境 $ module purge $ module load intel/2018. update 3 $ module load intelmpi/2018. update 3 $ module load mkl/2018. update 3 $ module load fftw/2. 1. 5/intel/2018. update 3 $ module load boost/1. 64. 0/intel/2017. update 4 可执行文件：$Your. Path/ABACUS. 1. 0. 1_2016 -12 -19/bin/ABACUS. mpi. 1. 0. 1

ABACUS: Atomic-orbital Based Ab-initio Computation at UStc 输出文件：标准输出，文件夹OUT. ABACUS/ 从输出文件获取信息： l 总能量 $ grep ‘!FINAL_ETOT_IS’ OUT. ABACUS/running_scf. log 更多信息可进入到文件查看