VAKGROEP VOEDING GENETICA EN ETHOLOGIE ONDERZOEKSGROEP LABORATORIUM VOOR

VAKGROEP VOEDING, GENETICA EN ETHOLOGIE ONDERZOEKSGROEP LABORATORIUM VOOR DIERLIJKE GENETICA EPILEPSIE BIJ DE DRENTSCHE PATRIJSHOND Evy Beckers – 11 april 2017

INHOUD Basisbegrippen Primaire epilepsie Onderzoek o GWAS o Genotyperen o Analyse En verder? 3

BASISBEGRIPPEN 4

DEFINITIES 5

DNA genetische informatie van de cel o 4 bouwstenen DNA: A, C, G, T 6

2 exemplaren van elk chromosoom (2 n) Genen informatie erfelijke eigenschappen 7

2 exemplaren van elk chromosoom (2 n) Allelen = verschillende varianten van een gen o ABO-bloedgroep 3 allelen 8

MUTATIES Bouwstenen DNA Mutatie = verandering opeenvolging bouwstenen 9

OVERERVING Dominant en recessief v. Von Willebrand ziekte Recessieve aandoening N = normaal • N/N • N/m • m/m m = mutant (ziek) gezond ziek (drager) 10

KRUISING DRAGER X DRAGER N m N NN Nm mm 11

ANDERE KRUISINGEN N NN NN N m N NN Nm m m N Nm Nm N NN Nm mm m m N Nm Nm m mm mm 12

Codominantie o ABO A=B Onvolledige dominantie 13

Multigenisch o Meerdere genen Multifactorieel o Milieu o Heupdysplasie o Epilepsie? 14

PRIMAIRE EPILEPSIE 15

EPILEPSIE Een van de meest voorkomende neurologische aandoeningen bij de hond Abnormale elektrische activiteiten in de hersenen 16

SYMPTOMEN Voorspellen aanval Spiertrekkingen Autonome symptomen Tot 5 min Post-ictaal 17

18

KENMERKEN EN DIAGNOSE 6 m – 6 j Rust Tussendoor volledig normaal Klinisch-, neurologisch- en bloedonderzoek Achterliggende oorzaken Hersenscan Hersenvocht 19

ONDERZOEK 20

GWAS Genome Wide Association Study Single Nucleotide Polymorfisme 21

Principe: Sterk signaal voor SNP 2 zoeken in die buurt 22

2 varianten van een SNP Variant A ( ) Variant B ( ) 2 exemplaren van een chromosoom 23

GENOTYPEREN Bead. Chip > 172. 000 SNP’s 24

Invriezen Data 25

ANALYSE DATA RESULTAAT 26

MANHATTAN PLOT Wolf et al. , PLo. S Genetics, 2015 27

MUTATIE 28

EN VERDER? 29

STAND VAN ZAKEN 48 stalen gegenotypeerd + geanalyseerd Extra 24 stalen Beste resultaten familiestalen 30

FASE 1 FASE 2 Mutatie zoeken Mutatie bevestigen Epilepsie + Alle stalen testen Vrije nestgenoot Frequentie mutatie Beide ouders FOKADVIES 31

VRAGENLIJST 32

VRAGEN? 33

Evy Beckers Assistent VAKGROEP VOEDING, GENETICA EN ETHOLOGIE E T Evy. Beckers@ugent. be +32 9 264 78 07 www. ugent. be Ghent University @ugent Ghent University