Uso del Codice in E coli e in
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Uso del Codice in E. coli e in H. sapiens Terza Posizione Prima Posizione Seconda Posizione
Componenti e regolatori del flusso d'informazione genetica • DNA, m. RNA, proteine • polimerasi • t. RNA e ribosomi • proteine regolatrici
L’RNA è l’intermediario tra il DNA e le proteine Autoradiografa di una cellula esposta a uridina radioattiva per 15 min e successivamente a uridina non radioattiva per 80 min
Definizioni: • genoma • trascrittoma • proteoma
Dimensioni di genomi:
Composizione del genoma eucariotico
Paradosso del valore C • Eccesso di DNA rispetto alla complessità • Variazioni di valore C per complessità simili
Struttura del genoma eucariotico • Sequenze ripetute • Altri DNA non codificanti • Introni • DNA codificante
Composizione del genoma umano
Sequenze ripetute nel genoma umano • Uniche (1 -10 volte) circa 40% • Mediamente ripetute (da centinaia a migliaia di volte) 40 -50% • Altamente ripetute (da decine di migliaia a milioni di volte) 5 -10% Maggior parte dei geni in tandem intersperse Geni reiterati (r. RNA, 5 S RNA, t. RNA, Istoni etc. ) Alcune sequenze regolative Alcune sequenze a funzione speciale (centromeri, origini, etc. ) DNA satelliti, sequenze semplici
geni per: r. RNA (300) t. RNA (1300) 5 S RNA (2000) istoni (20) sequenze ripetute intersperse sequenza Alu: 300 nt (x 1. 000) sequenze semplici o satelliti: 2 -10 nt (x 2 -100 copie in tandem x 1 -100 blocchi interspersi)
Il DNA non ripetitivo è solo una parte del genoma
Composizione del genoma • Le proporzioni relative delle componenti del DNA variano nei diversi genomi eucariotici • Il contenuto assoluto di DNA non ripetitivo aumenta con le dimensioni del genoma, ma raggiunge un plateau a circa 2 x 109 bp.
La percentuale di DNA non ripetitivo tende a diminuire con l'aumentare della grandezza del genoma
Relazione tra DNA e m. RNA: procarioti Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006
Relazione tra DNA e m. RNA: eucarioti
Gene per il collagene 1 a 2 di pollo
Definizioni • Esoni: maturo sequenze rappresentate nell'RNA • Introni: sequenze rimosse dal trascritto primario
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006