Universidade Federal de Pelotas Centro de Desenvolvimento Tecnolgico

Universidade Federal de Pelotas Centro de Desenvolvimento Tecnológico Pós-Graduação em Biotecnologia Introdução a proteômica Dr. Luciano da Silva Pinto

Introdução Estrutural Seres vivos Enzimática Transporte Hormonal Proteínas Imunológica

Introdução: Conceitos PROTEOMA é a coleção de proteínas expressas por um tipo de célula ou tecido sob determinadas condições e a um dado tempo. Representa a população total de PROTEina expressa por um gen. OMA. PROTEÔMICA é a ciência que estuda o conjunto de proteínas contidas numa célula, que são determinadas pelo genoma da mesma. (Wasinger et al. 1995)

Dinâmica do proteoma Fatores epigenéticos Temperatura Estresse Doenças Alimentação Estático Transcrição DNA Splicing pré-RNAm Dinâmico RNAm Modificações Tradução WITZMANN & LI (2002) Proteínas Degradações

Alguns objetivos da análise Proteômica • Separar, identificar e catalogar todas as proteínas existente em uma amostra biológica analisada. • Identificar diferenças protéicas específicas que diferem duas ou mais condições que estão sendo comparadas. Nível de expressão de proteínas Modificações Póstraducionais Interações entre proteínas Identificação de Biomarcadores

Abordagens Proteômica Coleta Amostra Separação Identificação ZHOU et al. , (2005)

Abordagens Proteômica • Eletroforese Bidimensional (2 D) • Espectrometria de Massa (EM) – Estudos fisiológicos ou patológicos comparativos; » Quantitativos » Qualitativos • Cromatografia líquida (CL) • Espectrometria de massa (EM) – Recuperação de ptns na forma nativa » Análises funcionais, estruturais e bioquímicas

Proteoma Comparativo ou Diferencial condição Sobreposição permite identificar diferenças nos padrões de bandas