UJI COBA BERBAGAI MARKA AROMATIK Bradbury Bradbury et
UJI COBA BERBAGAI MARKA AROMATIK Bradbury (Bradbury et al. 2005) ekson 7 m Nonaromatik N C IR F T Aromatik M G RL P PM PK Si Gi w * * FM-E 7 (Shi et al. 2008) ekson 7 Nonaromatik Aromatik N C IR F T M G RL P PM PK Si Gi w * * FM-E 2 A (Shi et al. 2008) ekson 2 Nonaromatik Aromatik N C IR F T M G RL P PM PK Si Gi w BADEX 7 -5 (Sakthivel et al. 2009) ekson 7 Nonaromatik N C IR F T Aromatik M G RL P PM PK Si Gi w 1 1 2 2 1 2 * * • Padi Non-Aromatik : N = Nipponbare, C = Ciherang, IR = IR 64, F = Fatmawati, T = Taipei 309 • Padi Aromatik : M = Mentik Wangi, G = Gunung Perak, RL = Rojo Lele, P = Pandan Wangi, PM = Pulu Mandoti, PK = Pare Kembang, Si = Sintanur, Gi = Gilirang • 2 kelompok tipe mutasi varietas aromatik Indonesia dan mutasi terjadi pada ekson 7 • m = size marker; w = air (kontrol negatif); 1 dan 2 = kelompok 1 dan 2, * = sampel aromatik dengan pola amplifikasi berbeda dibandingkan sampel nonaromatik (kelompok 1)
FORWARD SEQUENCE COMPARISON IFAP badh 2. 7 gene of non -fragrant rices badh 2. 7 gene mutation/deletion IFAP Exon 7 -badh 2 gene of group 1 fragrant rices: Mentik Wangi and Gunung Perak Chr MW PW ESP GGT GT ATAT ATTTCAGCTGCTCCTATG IFAP(blk, kplm) AACCGCCATGGTCACCG TGCT CTATG new IFAP INSP IFAP Exon 7 -badh 2 gene of group 2 fragrant rices: Pandan Wangi, Rojolele, Pulu Mandoti , Gilirang, and Pare Kembang EAP ESP INSP IFAP EAP = = TTGTTTGGAGCTTGCTGAGT CTGGTAAAAAGATTAGGCTTA CATAGGAGCAGCTGAAATATATACC AGTGCTTTACAAAGTCCCGC
REVERSE SEQUENCE COMPARISON INSP badh 2. 7 gene mutation/deletion INSP badh 2. 7 gene of non -fragrant rices INSP IFAP Exon 7 -badh 2 gene of group 2 fragrant Exon 7 -badh 2 gene of group 1 fragrant rices: Pandan Wangi, Rojolele, Pulu rices: Mentik Wangi and Gunung Perak Mandoti , Gilirang, and Pare Kembang G originally T in Bradbury marker GAAGCCATAATCTTTTTACCAG INSP, blk, kplt Chr MW PW ESP INSP IFAP EAP = = TTGTTTGGAGCTTGCTGAGT CTGGTAAAAAGATTAGGCTTA CATAGGAGCAGCTGAAATATATACC AGTGCTTTACAAAGTCCCGC
SISTEM MARKA MULTIPLEK DAN DUPLEK MULTIPLEK (4 PRIMER) DUPLEK (2 PRIMER) Aromatik In. Del Nonaromatik
TARGET PEMULIAAN TANAMAN PADI Pra Panen E Toleransi biotik (hama EProduktivitas dan penyakit): tinggi Serangga ERatoon tinggi Jamur EWaktu tanam Pasca Panen ERasa (pulen/pera) EAromatik: -Nilai Ekonomi Peningkatan produktivitas Mikroorganisme (bakteri dan virus) E Toleransi abiotik : ENontransgenik (GMO) Kekeringan Salinitas tinggi Genangan/banjir Lokasi (kondisi tanah, temperatur, dsb. ) Resiko kegagalan panen Kuantitas panen Kualitas panen/aspek komersial
PERBANDINGAN METODA PEMULIAAN TANAMAN PADI Uraian Persilangan konvensional/acak (Random crossing) Persilangan terarah (Sitedirected crosing) Rekayasa Genetik Produk Non. GMO GMO Stabilitas Puluhan tahun Belum teruji untuk waktu lama Introduksi sifat Non. Spesifik/Selektif Tidak terarah Terarah Waktu pengerjaan 4 -5 bulan hingga 8 – 10 bulan • 2 – 3 tahun bila mulai dari awal • 4 -5 bulan hingga 8 – 10 bulan bila tersedia BC 4 F 1 2 – 3 tahun Tidak ada Efek negatif Pemasaran produk Tidak bermasalah Tidak ada Tidak bermasalah ? Terhambat regulasi GMO
- Slides: 7