UCI Spocsvm RBF Spocsvm Poly Csvm RBF Csvm
UCIデータセット:テスト誤差 Spoc-svm: RBF Spoc-svm: Poly C-svm: RBF C-svm: Poly Proposed: RBF Proposed: Poly Ann-thyroid 0. 05076 0. 04142 0. 05309 0. 03384 0. 03501 0. 03355 Satimage 0. 11750 0. 16400 0. 12050 0. 14050 0. 12150 0. 14550 Segmentation 0. 16400 0. 07381 0. 17048 0. 05810 0. 15143 0. 07619 Iris 0. 04293± 0. 00896 0. 03600± 0. 00858 0. 03967± 0. 00784 0. 03667± 0. 00790 0. 04027± 0. 00715 0. 03380± 0. 00859 Wine 0. 01834± 0. 00817 0. 03286± 0. 00793 0. 01331± 0. 00488 0. 03794± 0. 00914 0. 01291± 0. 00419 0. 03360± 0. 00996 Glass 0. 14862± 0. 01241 0. 07595± 0. 01323 0. 16400± 0. 01278 0. 06805± 0. 01000 0. 13424± 0. 01178 0. 04852± 0. 00715
UCIデータセットの概要 Dataset #Total #Training #Test #Attributes #Classes Ann-thyroid 7200 3772 3428 21 3 Satimage 6435 4435 2000 36 6 Segmentation 2310 2100 19 7 Iris 150 4 3 Wine 178 3 3 Glass 214 9 6 5 -fold cross-validationを 100回行い、平均挙動を見る
UCIデータセット:訓練誤差 Spoc-svm: RBF Spoc-svm: Poly C-svm: RBF C-svm: Poly Proposed: RBF Proposed: Poly Ann-thyroid 0. 04348 0. 02572 0. 04745 0. 02333 0. 02519 0. 02386 Satimage 0. 09515 0. 12469 0. 10688 0. 10485 0. 10462 0. 11995 Segmentation 0. 11429 0. 02857 0. 17143 0. 00952 0. 12381 0. 03333 Iris 0. 02248± 0. 00241 0. 02422± 0. 00239 0. 02478± 0. 00266 0. 02408± 0. 00283 0. 02290± 0. 00253 0. 02343± 0. 00248 Wine 0. 00063± 0. 00078 0. 00000± 0. 00000 0. 00476± 0. 00123 0. 00000± 0. 00000 0. 00445± 0. 00106 0. 00000± 0. 00000 Glass 0. 06481± 0. 00620 0. 00931± 0. 00204 0. 08886± 0. 00781 0. 00581± 0. 00119 0. 04509± 0. 00310 0. 00676± 0. 00143
有意遺伝子選択の問題 class 1 (tumor samples) class 2 (non-tumor samples) si 対立仮説 H 1: 対立モデル尤度: 帰無仮説 H 0: 帰無モデル尤度: mi 1 mi 2 mi 1 = mi 2 gene i is active mi 1 = mi 2 gene i is inactive 遺伝子 i の 発現レベル xi
潜在変数モデルを対立仮説とした 遺伝子選択 • 各サンプル j の所属クラス k が必ずしも観測さ れない場合 expression level of gene i at sample j center of class k class label for gene i prior of class k intra-class variance of gene i (common among classes k=1, 2) • 教師無し遺伝子選択・準教師付き遺伝子選択
準教師ありスコアの比較 Observation tumor non-tumor unknown samples inactive genes
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