Trypanosomy v lidsk krvi Kinetoplastids Diplonemids Euglenozoans are

  • Slides: 25
Download presentation
Trypanosomy v lidské krvi

Trypanosomy v lidské krvi

Kinetoplastids Diplonemids Euglenozoans are unicellular flagellates that include free-living, commensalic and parasitic species

Kinetoplastids Diplonemids Euglenozoans are unicellular flagellates that include free-living, commensalic and parasitic species

the sampling of trypanosomatids in Neotropical Heteroptera

the sampling of trypanosomatids in Neotropical Heteroptera

trypanosomes • Kinetoplastid flagellates causing disease: >300. 000 patients worldwide Leishmaniasis Chagas’ disease Sleeping

trypanosomes • Kinetoplastid flagellates causing disease: >300. 000 patients worldwide Leishmaniasis Chagas’ disease Sleeping sickness Trypanosoma brucei

Trypanosoma brucei T. brucei gambiense T. brucei rhodesiense T. brucei tse-tse fly vector distribution

Trypanosoma brucei T. brucei gambiense T. brucei rhodesiense T. brucei tse-tse fly vector distribution life cycle

k. DNA is organized as a disc with minicircles stretched taut and aligned parallel

k. DNA is organized as a disc with minicircles stretched taut and aligned parallel to the axis of the k. DNA disc k. DNA mitochondrion

Kinetoplast (or k. DNA) genome of kinetoplastid flagellates Trypanosoma brucei ND 8 ND 7

Kinetoplast (or k. DNA) genome of kinetoplastid flagellates Trypanosoma brucei ND 8 ND 7 COIII ND 9 CYb A 6 22 kb CR 5 CR 4 RPS 12 CR 3 COII MURF 2 g. RNA 1 ~1 kb g. RNA 3 g. RNA 2

The kinetoplast DNA replication model Pol b-PAK Topo II Pol b Antipodal site SSE

The kinetoplast DNA replication model Pol b-PAK Topo II Pol b Antipodal site SSE 1 (RNase H) Primase Kinetoflagellar Zone UMSBP Pol 1 B Pol 1 C +

Zájmové mitochondriální proteiny 1. Fe-S klastery 2. RNA editing a RNA procesing 3. proteiny

Zájmové mitochondriální proteiny 1. Fe-S klastery 2. RNA editing a RNA procesing 3. proteiny konzervované mezi člověkem, kvasinkou a trypanosomou o nichž se nic neví 4. Podjednotky respiračního řetězce 5. Import a modifikace t. RNA Isc. S 1 Frataxin (komplex ? ) Isc. A Ferredoxin 1 Ferredoxin 2

GAP 1 and 2 are lethal also in the bloodstream stage Northern and Western

GAP 1 and 2 are lethal also in the bloodstream stage Northern and Western analysis showing downregulation of the GAP proteins Growth curves of GAP knock-downs g. RNAs disappear in the absence of GAP proteins

ISC machinery Cfd 1 s. S Nbp 35 mitochondrion Fe WD 40 s. S

ISC machinery Cfd 1 s. S Nbp 35 mitochondrion Fe WD 40 s. S Fe s S Fe Narf apoprotein Atm 1? Fe S s S X? Erv 1, GSH Complex I Fe Ind Fe Grx 5 S Fe S ATP Hsp 70 Frataxin Dna. J Mge apoprotein Isc. U S S 0 e 2+ Fdx FOR-NADH Fe Fe Isc. A Iba 57? Mrs 3/4 alanine Nfu Isc. S Isd 11 cysteine TCA substrate

Central Dogma of Molecular Biology

Central Dogma of Molecular Biology

T. brucei ATPase 6 m. RNA edited editing in progress. . . pre-edited AAAAAUAAGUAUUUUGAUAUUAUUAAAGUAAAAGAGGAAUUUUGGGCGGAAGAGAAGGA

T. brucei ATPase 6 m. RNA edited editing in progress. . . pre-edited AAAAAUAAGUAUUUUGAUAUUAUUAAAGUAAAAGAGGAAUUUUGGGCGGAAGAGAAGGA AAAAAUAAGUAUUUUGAUAUUAUUAAAGUAAAAGuuuuu. Auuuuu. Gu. GAuuu. AU AAAAAUAAGUAUUUUGAUAUUAUUAAAGUAAAu. Guuuuu. Auuuuu. Gu. GAuuu M F L F F F C D GACAGGAGAGGAAAUGAAGGAGAAAGGUUUUGAGAGGGGGGUUUUUUGAGGGGAGGAAA GACAGGAGAGGAAAUGAAGGAGAAAGGUUUUGAGAGGGGGGUUUUUUGAGuu. GGuuu GACAGGAGAGGAuuuu. AAu. UGuuu. AAu. Guu. GAuuuuuu. Auuuu. G* UUUGGuu. GCGuuu. Guu. Au. Gu. Auu. Gu. Au. GAu. Cu. AGGuu. Au. Guuuu. Auu AUUUUGGuu. GCGuuu. Guu. Au. Gu. Auu. Gu. Au. GAu. Cu. AGGuu. Au. Guuuu. A L F W L R L M L K L E C K M G Y F Y E C R V G W V S F R W L G C E F E AAGAAUUUUGAACUAUUUGUUUAAGUUAUGGGAGAGAAGCAAGGAGGAGAAAA AAGAAUUUUGAACUAUUUGUUUAAGUUAUGGGAGAGAu. Auu. GCAuuuuu. Auuu AAGAAUUUUGAACu. UAUUUG***AAuuu. G*UAuu. UGuu. Guuuu. Gu. Auu. Guuuu Au. Guuu. AAuuu. Au. AGuuu. AAUUUUGu. Auu. A*UUGu. Auu. ACu. UAUUUG***AAuu UUUGAuuu. Guu. GGuuu. G***UUUGuuuuu. Auu. Gu. GGuuu. Au. Guu Gu. Auuuu. AAu. UGuuu. AAu. Guu. GAuuuuuu. Auuuu. G*UUUGAuu uu. Gu. Auuuu. AAu. UGuuu. AAu. Guu. GAuuuuuu. Auuuu. G*UUUGA I K V E Y F F W N I C W L T M I L C I L F S D Y F G L R L E F A C R L R RF GUAGGGGAAUUUUGAGGAGAUUCUUGGGGAGAGGCGGGCGACGGCGGUUUUGAAA GUAGGGGAAUUUUGAGGAGuuuu. AUUC**Guuuuuu. Gu. Guuuuuu. AGAGu. Gu uu. Guuuuuu. Au. GAuuuuu. Guuu. AAuuu. Gu. UAGuu. GGu. GAu. A**** uuu. Auu. Gu. Auu. GCAuuuuu. Guuuuuu. Au. GAuuuuu. Guuu. A u. G*UAuu. UGuu. Guuuu. Gu. Auu. Guuuuuuu. Auu. Gu. Auu. GCAuuuuu. Guuuu. G Guuu. AAuuu. Au. AGuuu. AAUUUUGu. Auu. A*UUGu. Auu. ACu. UAUUUG***AAuuu. G*UA u. Gu. Auuu. Guu. GGuuu. G***UUUGuuuuu. Auu. Gu. GGuuu. Au. Guuu. AAu uuu. Gu. Auuu. Guu. GGuuu. G***UUUGuuuuu. Auu. Gu. GGuuu. Au. Guuu. A KD VL GY EL FF WV GG DL SC W GL EF AL GL GL RW RF RM FL ACACCCAUUUUUAGGAGGAUAAGAGGGGAGAAAAGGGGAAAUGGAAUUGCCU ACACCCAUUUUUAGGAGGAUAAGAGGGGAGAAAAGGGGAAAUGGAAu. UUGuu. GGAuuu. A ACACCCAUUUUUAGGAGGAUAAGAGGGGAGAAAAGGGGuuu. Auuuu. AUGu. Guuuuu ACACCCAUUUUUAGGAGGAUAAGAGGGuuuuuu. Guu. Auu. GAuuu. Auuuuu ACACCCAUUUUUAGGAGGAUAuuuuu. Guuuuuu. AGGGuuuuuu. Guu. Au uuuu. Cuuu. Gu. Gu. CGuu. Gu. CGACGuuuuu. GCGuuu. GUUUUGu. AAuuu. Au. C Guuuu. Au. GGAu. Guuuu. AUUC**Guuuuuu. Gu. Guuuuuu. AGAGu. Guuuuu. Cuu Au. AAuuu. Gu. UAGuu. GGu. GAu. A****Guuuu. Au. GGAu. Guuuu. AUUC**Guuuuuu. G uuuuuu. Au. GAuuuuu. Guuu. AAuuu. Gu. UAGuu. GGu. GAu. A****Guuuu. Au. G uu. UGuu. Guuuu. Gu. Auu. Guuuuuuu. Auu. Gu. Auu. GCAuuuuu. Guuuuu uu. Au. AGuuu. AAUUUUGu. Auu. A*UUGu. Auu. ACu. UAUUUG***AAuuu. G*UAuu. UGuu. G Auuu. Au. AGuuu. AAUUUUGu. Auu. A*UUGu. Auu. ACu. UAUUUG***AAuuu. G*UAuu. UGu WF KN HL PY FS LL GI GL ter Y EY G C R I K T G Y E L M E N L L G Y I UUGCCAAACUUUUAGAAGAGCAGGAAAGGUUAGGGGGAGGAGAGAAGAAAGGGAA UUGCCAAACUUUUAGAAGAGCAGGAAAGGUUAGGGGGAGGAGAGAAGAAAGuu. Gu UUGCCAAACUUUUAGAAGAGCAGGAAAGGUUAGGGGGuuu. AGuuuu. Gu. Auuu. GAu UUGCCAAACUUUUAGAAGAGCAGGAAAGG**Auuuuuu. Guuu. G UUu. GCC***GCCAu. Auu. AC****AGuu. Auuuuuu. Gu. AAu. GAuuuu. GCAGuu. GA Au. UUGuu. GGAuuu. AUUu. GCC***GCCAu. Auu. AC****AGuu. Auuuuuu. Gu. AAu Gu. Guuuuu. Guuu. Auuuu. AUGu. Guuuuu. Au. UUGuu. GGAuuu. AUUu. GCC** u. GAuuu. Auuuuu. Guuuu. Guuu. Auuuu. AUGu. Guuuuu. A Au. CCCAu. UUUUUAuu. GAu. Guuuuuu. GAuuuuuuu. UAuuuuu. Guuuuu u. Gu. Gu. CGuu. Gu. CGACGuuuuu. GCGuuu. GUUUUGu. AAuuu. Au. CAu. CCCAu uu. Guuuuuu. AGAGu. Guuuuu. Cuuu. Gu. Gu. CGuu. Gu. CGACGuuuuu. GCGuuu GAu. Guuuu. AUUC**Guuuuuu. Gu. Guuuuuu. AGAGu. Guuuuu. Cuuu. Gu. Gu u. Au. GAuuuuu. Guuu. AAuuu. Gu. UAGuu. GGu. GAu. A****Guuuu. Au. GGAu. Gu uuuu. Gu. Auu. Guuuuuuu. Auu. Gu. Auu. GCAuuuuu. Guuuuuu. Au. GA u. Guuuu. Gu. Auu. Guuuuuuu. Auu. Gu. Auu. GCAuuuuu. Guuuuuu. Au. Gu L A L F F A C K I L V L F E L R Y A I G A K F V L R F G L R F R C E F E AGUUGUGAUUUUGGAGUUAUAGAAUAAGAUCAAAUAAGUUAAUAAUA AGUUGUGA**UUGGAGUUAUAGAAUAAGAUCAAAUAAGUUAAUAAUA AGUUGuu. A**UUGGAGUUAUAGAAUAAGAUCAAAUAAGUUAAUAAUA u. GAAAuuu. G**Guu. UGuu. A**UUGGAGUUAUAGAAUAAGAUCAAAUAAGUUAAUAAUA uuuu. GAu. AGuu. Au. Auu. Guu. GAAAuuu. G**Guu. UGuu. A**UUGGAGUUAUAGAA uuu. AGuuuu. Gu. Auuu. GAuuuuu. GAu. AGuu. Au. Auu. Guu. GAAAuuu. G**Guu. UGu u. AAu. GG**Auuuuuu. Guuu. AGuuuu. Gu. Auuu. GAuuuuu. GAu. AG Au. GAuuuu. GCAGuu. GAu. AAu. GG**Auuuuuu. Guuu. AGuuuu. Gu *GCCAu. Auu. AC****AGuu. Auuuuuu. Gu. AAu. GAuuuu. GCAGuu. GAu. AAu. GG** u. UUGuu. GGAuuu. AUUu. GCC***GCCAu. Auu. AC****AGuu. Auuuuuu. Gu. AAu. G uuu. AGGGuuuuuu. Guu. Auu. GAuuu. Auuuuu. Guuuu. Guuu. Auu UUUUUAuu. GAu. Guuuuuu. GAuuuuuuu. UAuuuuu. Guuuuuu. AGGG GUUUUGu. AAuuu. Au. CAu. CCCAu. UUUUUAuu. GAu. Guuuuuu. GAuuuuuuu. UAuu CGuu. Gu. CGACGuuuuu. GCGuuu. GUUUUGu. AAuuu. Au. CAu. CCCAu. UUUUUAuu uuuuuuu. AUUC**Guuuuuu. Gu. Guuuuuu. AGAGu. Guuuuu. Cuuu. Gu. Gu. CGuu. G uuuuu. Guuu. AAuuu. Gu. UAGuu. GGu. GAu. A****Guuuu. Au. GGAu. Guuuu GAuuuuu. Guuu. AAuuu. Gu. UAGuu. GGu. GAu. A****Guuuu. Au. GGAu. Guuuuuu L R C E D S F C F D L F F G N V N I L E ter L V D G Q D I S terter S F M D UAAGAUCAAAUAAGUUAAUAAUA u. A**UUGGAGUUAUAGAAUAAGAUCAAAUAAGUUAAUAAUA uu. Au. Auu. Guu. GAAAuuu. G**Guu. UGuu. A**UUGGAGUUAUAGAAUAAGAUCAA Auuu. GAuuuuu. GAu. AGuu. Au. Auu. Guu. GAAAuuu. G**Guu. UGuu. A**UUGGAGU Auuuuuu. Guuu. AGuuuu. Gu. Auuu. GAuuuuu. GAu. AGuu. Au. A Auuuu. GCAGuu. GAu. AAu. GG**Auuuuuu. Guuu. AGuuuu. Gu. Auuuu. AUGu. Guuuuu. Au. UUGuu. GGAuuu. AUUu. GCC***GCCAu. Auu. AC****AGuu. A uuuuuu. Guu. Auu. GAuuu. Auuuuu. Guuuu. Guuu. Auuuu. AU uu. Auuuuu. Guuuuuu. AGGGuuuuuu. Guu. Auu. GAuuu. Auuuuu. Gu Guu. GAu. Guuuuuu. GAuuuuuuu. UAuuuuu. Guuuuuu. AGGGuuuuuu. Gu. CGACGuuuuu. GCGuuu. GUUUUGu. AAuuu. Au. CAu. CCCAu. UUUUUAuu. GA AUUC**Guuuuuu. Gu. Guuuuuu. AGAGu. Guuuuu. Cuuu. Gu. Gu. CGuu. Gu. CG uu. AUUC**Guuuuuu. Gu. Guuuuuu. AGAGu. Guuuuu. Cuuu. Gu. Gu. CGuu. Gu V F F I R F L L C F L E C F S L L C R AUAAGUUAAUAAUA UAUAGAAUAAGAUCAAAUAAGUUAAUAAUA uu. Guu. GAAAuuu. G**Guu. UGuu. A**UUGGAGUUAUAGAAUAAGAUCAAAUAAGUUA u. GAuuuuu. GAu. AGuu. Au. Auu. Guu. GAAAuuu. G**Guu. UGuu. A**UUGGAGUUAU uuu. Auuuuuu. Gu. AAu. GAuuuu. GCAGuu. GAu. AAu. GG**Auuuuuu. Guu. G Gu. Guuuuu. Au. UUGuu. GGAuuu. AUUu. GCC***GCCAu. Auu. AC****AGuu. Auuu Guuuu. Guuu. Auuuu. AUGu. Guuuuu. Au. UUGuu. GGAuuu. AUUu. GCC***G u. Auu. GAuuu. Auuuuu. Guuuu. Guuu. Auuuu. AUGu. Guuuuuu. GAuuuuuuu. UAuuuuu. Guuuuuu. AGGGuuuuuu. Guu. Auu. G ACGuuuuu. GCGuuu. GUUUUGu. AAuuu. Au. CAu. CCCAu. UUUUUAuu. GAu. Guuuuu CGACGuuuuu. GCGuuu. GUUUUGu. AAuuu. Au. CAu. CCCAu. UUUUUAuu. GAu. Guuu C L S T F L R L F C N L L S S H F L L AUAAUA AGAAUAAGAUCAAAUAAGUUAAUAAUA uuu. Guuu. AGuuuu. Gu. Auuu. GAuuuuu. GAu. AGuu. Au. Auu. Guu. GAAAuuu. G**Gu uuu. Gu. AAu. GAuuuu. GCAGuu. GAu. AAu. GG**Auuuuuu. Guuu CCAu. Auu. AC****AGuu. Auuuuuu. Gu. AAu. GAuuuu. GCAGuu. GAu. AAu. GG**Au Au. UUGuu. GGAuuu. AUUu. GCC***GCCAu. Auu. AC****AGuu. Auuuuuu. Gu. AAu Auuuuu. Guuuu. Guuu. Auuuu. AUGu. Guuuuu. Au. U u. GAuuuuuuu. UAuuuuu. Guuuuuu. AGGGuuuuuu. Guu. Auu. GAuuu. Auu uuu. GAuuuuuuu. UAuuuuu. Guuuuuu. AGGGuuuuuu. Guu. Auu. GAuuu. A L M F F D F F Y F I F V F F F W C F L u. UGuu. A**UUGGAGUUAUAGAAUAAGAUCAAAUAAGUUAAUAAUA AGuuuu. Gu. Auuu. GAuuuuu. GAu. AGuu. Au. Auu. Guu. GAAAuuu. G**Guu. UGuu. A* uuuuu. Guuu. AGuuuu. Gu. Auuu. GAuuuuu. GAu. AGuu. Au. Auu Au. GAuuuu. GCAGuu. GAu. AAu. GG**Auuuuuu. Guuu. AGuuuu. Gu UGuu. GGAuuu. AUUu. GCC***GCCAu. Auu. AC****AGuu. Auuuuuu. Gu. AAu. GAu uu. Auuuuu. Guuuu. Guuu. Auuuu. AUGu. Guuuuu. Au. UUGuu. GGA uuuu. Auuuuu. Guuuu. Guuu. Auuuu. AUGu. Guuuuu. Au. UUGuu. G L L I Y F C V L F I I L C V F *UUGGAGUUAUAGAAUAAGAUCAAAUAAGUUAAUAAUA Guu. GAAAuuu. G**Guu. UGuu. A**UUGGAGUUAUAGAAUAAGAUCAAAUAAGUUAAU Auuu. GAuuuuu. GAu. AGuu. Au. Auu. Guu. GAAAuuu. G**Guu. UGuu. A**UUGGAGU uuu. GCAGuu. GAu. AAu. GG**Auuuuuu. Guuu. AGuuuu. Gu. Auuu. G uuu. AUUu. GCC***GCCAu. Auu. AC****AGuu. Auuuuuu. Gu. AAu. GAuuuu. GCAG GAuuu. AUUu. GCC***GCCAu. Auu. AC****AGuu. Auuuuuu. Gu. AAu. GAuuuu. GC I F V G F I C R H I T V I Y F L ter AAUA UAUAGAAUAAGAUCAAAUAAGUUAAUAAUA Auuuuu. GAu. AGuu. Au. Auu. Guu. GAAAuuu. G**Guu. UGuu. A**UUGGAGUUAUAG uu. GAu. AAu. GG**Auuuuuu. Guuu. AGuuuu. Gu. Auuu. GAuuuuu. G AGuu. GAu. AAu. GG**Auuuuuu. Guuu. AGuuuu. Gu. Auuu. GAuuuu AAUAAGAUCAAAUAAGUUAAUAAUA Au. AGuu. Au. Auu. Guu. GAAAuuu. G**Guu. UGuu. A**UUGGAGUUAUAGAAUAAGA u. GAu. AGuu. Au. Auu. Guu. GAAAuuu. G**Guu. UGuu. A**UUGGAGUUAUAGAAUAA UCAAAUAAGUUAAUAAUA GAUCAAAUAAGUUAAUAAUA

In T. brucei, extensive RNA editing is the rule: 9 of 18 m. RNAs

In T. brucei, extensive RNA editing is the rule: 9 of 18 m. RNAs are extensively edited 12 S 9 S ND 8 ND 7 cox 3 cytb ATP 6 ND 9 MURF 5 G 3 cox 2 MURF 1 ND 1 edited m. RNAs ND 4 RPS 12 ND 5 cox 1 G 4 ND 3

Most edited m. RNAs encode subunits of the Ox. Phos system Complex III Complex

Most edited m. RNAs encode subunits of the Ox. Phos system Complex III Complex IV Complex V Succinate reductase 7 8 II CYb III 6 (a) 9 3 Subunits encoded by mitochondrial m. RNAs that require editing

RNA editing is directed by guide RNAs Editing Block. . . UUAGGGGGAGGAGAGAu. AGuu. Au.

RNA editing is directed by guide RNAs Editing Block. . . UUAGGGGGAGGAGAGAu. AGuu. Au. Auu. Guu. GAAAuuu. GGuu. UGuu. AUUGGAGUUAUAG. . . AAAGAGCAGGAAAGGUUAGGGGGAGGAGAGAAGAAAGGGAAAGUUGUGAUUUUGGAGUUAUAG. . . AAAGAGCAGGAAAGGUUAGGGGGAGGAGAGAAGAAAGGGAAAGUUGUGuu. AUUGGAGUUAUAG. . . AGAGCAGGAAAGGUUAGGGGGAGGAGAGAAGAAAGGGAAAGUUGuu. AUUGGAGUUAUAG. . . AAAGAGCAGGAAAGGUUAGGGGGAGGAGAGAAGAAAGGuu. UGuu. AUUGGAGUUAUAG. . . GAGCAGGAAAGGUUAGGGGGAGGAGAGAAGAAAGGGAAAuuu. GGuu. UGuu. AUUGGAGUUAUAG. . . GCAGGAAAGGUUAGGGGGAGGAGAGAAGAAAGGuu. GAAAuuu. GGuu. UGuu. AUUGGAGUUAUAG. . . AGGAAAGGUUAGGGGGAGGAGAGAAGAAAGuu. GAAAuuu. GGuu. UGuu. AUUGGAGUUAUAG. . . GAAAGGUUAGGGGGAGGAGAGAAGAAAuu. Guu. GAAAuuu. GGuu. UGuu. AUUGGAGUUAUAG. . . AAAGGUUAGGGGGAGGAGAGAAGAAu. Auu. Guu. GAAAuuu. GGuu. UGuu. AUUGGAGUUAUAG. . . AGGUUAGGGGGAGGAGAGAAGAuu. Guu. GAAAuuu. GGuu. UGuu. AUUGGAGUUAUAG. . . GUUAGGGGGAGGAGAGAAGuu. Au. Auu. Guu. GAAAuuu. GGuu. UGuu. AUUGGAGUUAUAG. . . AAAGAGCAGGAAAGGUUAGGGGGAGGAGAGAAGAAAGGGAAAGUUGUGAUUGGAGUUAUAG. . . ····|··|·|·||||·||||···||||·||·||·|||||||||| ||·||||···|||··||||·||·||·|||||·|||||||||| ||··||||·||·||·|||||·|||||||||| ·|||||||||| ||·|||||||||| UUUUUUAUUAAUAGUAUAGUGACAGUUUUAGACUAAGCAAUAGCCUCAAUAUC. . . CUAAGCAAUAGCCUCAAUAUC. . . UUUUUUAUUAAUAGUGACAGUUUUAGACUAAGCAAU UUUUUUAUUAAUAGUGACAGUUUUAGACUAAGCAA UUUUUUAUUAAUAGUGACAGUUUUAGACUAA UUUUUUAUUAAUAGUGACAGUUUUAGAC UUUUUUAUUAAUAGUGACAGUUUUAGA UUUUUUAUUAAUAGUGACAG UUUUUUAUUAAUAGUGA UUUUUUAUUAAUAGUAUAG UUUUUUAUUAAUAGUA UUUUUUAUUAAUAG UUUUUUAUUAA UUUUUUA U Tail Information Anchor

RNA editing of one m. RNA requires several g. RNAs VIII u VI IV

RNA editing of one m. RNA requires several g. RNAs VIII u VI IV u u g. RNAs II u A cox 3 m. RNA u u VII edited unedited Direction of editing u V 5' u III I n g. RNAs 3'

Editosome Model p 24 p 42 upstream binding 8 p 1 p 63 p

Editosome Model p 24 p 42 upstream binding 8 p 1 p 63 p 90 p 81 p 99 p 52 p 102 p 48 p 108 p 46 p 69 catalytic p 57 hel 61 p 67 p 61 p 10 1 EM p 33 3 p 10 p 41 Insertion editing p 44 p 10 5 Deletion editing anchor binding

RNA editing The core machinery: the 20 S editosome Stuart et al. , Trends

RNA editing The core machinery: the 20 S editosome Stuart et al. , Trends Genet. 2005

Crystal structure of the MRP 1/MRP 2 complex Ribbon diagram with MRP 1 in

Crystal structure of the MRP 1/MRP 2 complex Ribbon diagram with MRP 1 in red (subunits A and C) and MRP 2 in cyan (subunits B and D) Schumacher et al. , Cell 2006

The GAP proteins are localized in punctuate loci along the reticulated mitochondrion Immunolocalization using

The GAP proteins are localized in punctuate loci along the reticulated mitochondrion Immunolocalization using anti-GAP 1 antibody Immunolocalization of the HA 3 -tagged versions of GAP 1 and GAP 2 Hashimi et al. , RNA, 2009

Kinetoplast DNA network of trypanosomatids

Kinetoplast DNA network of trypanosomatids

Gradual loss of kinetoplast DNA Without k. DNA they cannot survive in tse-tse fly

Gradual loss of kinetoplast DNA Without k. DNA they cannot survive in tse-tse fly but can in mammals (after some compensatory mutations)

Figure 5 Trypanosoma brucei with k. DNA Trypanosoma evansi without k. DNA (akinetoplastic; “petite

Figure 5 Trypanosoma brucei with k. DNA Trypanosoma evansi without k. DNA (akinetoplastic; “petite mutant”) Editosome and accessory proteins are present even in trypanosomes that have completely lost their mitochondrial DNA (+ RNA) Lai et al. , PNAS, 2008