TRANSKRIPCIJA RNK nukleotidi RNK polimeraza 3 pravac transkripcije

TRANSKRIPCIJA

RNK nukleotidi RNK polimeraza 3’ pravac transkripcije sintetisana RNK matrični lanac DNK

rastući RNK lanac RNK polimeraza formiranje fosfodiestarske veze ribonukleozid trifosfat 5’-3’ pravac polimerizacije matrični lanac DNK

PROKARIOTSKI G E N DNK 5’ promotor RNK kodirajuća sekvenca 3’ terminator nematrični lanac 3’ 5’ matrični lanac mesto otpočinjanja transkripcije mesto završetka transkripcije

OSNOVNE FAZE TRANSKRIPCIJE PROMOTOR 1. Prepoznavanje promotora 5’ 3’ 3’ 5’ RNK polimeraza 2. I n i c i j a 5’ 3’ 3’ 5’ DNK matrica RNK transkript

3. E l o n g a c i j a 5’ 3’ 3’ 5’ 4. Terminacija 5’ 3’ RNK transkript

STARTNI SIGNAL DNK start matrični DNK lanac transkripcija RNK

Inicija transkripcije kod prokariota RNK polimeraza DNK promotor - 35 - 10 s faktor DNK s faktor inicijalni ribonukleotid

smer transkripcije DNK s faktor oslobadjanje s faktora RNK DNK/RNK hibrid

segment sa dvostrukom simetrijom DNK RNK transkript formiranje terminalne petlje

EUKARIOTSKI G E N 5’ promotor egzon 1 intron egzon 2 DNK intron egzon 3 nematrični lanac 3’ 5’ 3’ matrični lanac mesto otpočinjanja transkripcije poly (A) mesto

RNK polimeraze u eukariotskoj ćeliji lokalizacija produkti RNK pol I nukleolus 28 S , 18 S , 5. 8 S r. RNK pol II nukleus i. RNK i neke sn. RNK nukleus t. RNK , 5 S r. RNK i neke sn. RNK pol III

promotor GC -90 CAAT -75 DNK II D početak transkripcije TATA box - 30 RNK polimeraza II TF IIB II D II B + TF II F TATA box TF IIE + TF IIH II D II B II F II E II H kompletni preinicijalni kompleks (PIK)

PROKARIOTE EUKARIOTE DNK transkripcija i. RNK polipeptid translacija pre-i. RNK obrada i. RNK translacija polipeptid

metil grupa g u a n i n početak i. RNK CAP (7’ metil-guanozin) metil grupe baza

SINTEZA poly (A) REPA pre-i. RNK polimeraza sinteza RNK

jedinica transkripcije 5’ egzon 1 intron egzon 2 intron egzon 3 3’ DNK 3’ promotor 5’ transkripcija 5’ egzon 1 intron egzon 2 egzon 1 (Cap) intron egzon 2 5’ Cap 5’ 5’ egzon 2 zrela i. RNK intron OH 3’ egzon 3 3’ isecanje introna egzon 1 Cap intron egzon 3 pre-i RNK obrada egzon 1 3’ hn RNK (primarni transkript) obrada m 7 Gppp. N 1 intron egzon 3 AAAAA…. poly(A) rep 3’

RNK transkript (pre-i. RNK) Egzon 2 Egzon 1 protein sn. RNK drugi proteini sn. RNK splajsozom komponente splajsozoma isečeni intron i. RNK Egzon 1 Egzon 2

pre-i. RNK zasecanje na 5’ egzon-intron granici zasecanje na 3’ egzon -intron granici 2’ - 5’

PROKARIOTSKI RIBOZOM EUKARIOTSKI RIBOZOM 70 s 30 s 5 S RNK 80 s 40 s 60 s 23 S RNK 16 S RNK 5, 8 S RNK 18 S RNK 28 S RNK 34 proteina 21 protein 49 proteina 33 proteina

repetitivna jedinica ribozomske DNK transkripciona jedinica ribozomske DNK gen za 18 S gen za 5, 8 S 28 S 45 S pre-r. RNK transkripcija 41 S pre-r. RNK 20 S pre-r. RNK 32 S pre-r. RNK 28 S r. RNK 18 S r. RNK 5. 8 S r. RNK

3’ A C C 5’ antikodon mesto vezivanja aminokiseline

petlja IV A petlja III antikodon C C 3’ kraj za koji se vezuje AMK

TRANSLACIJA

DNK matrični lanac A C C A A A C C G A G T 3’ 5’ kod TRANSKRIPCIJA kodon i. RNK 5’ 3’ U t. RNK G G U U U G G C U C Trp ACC TRANSLACIJA antikodon polipeptid Trp Phe Gly Ser A

5’ 3’ II nukleotid U C A G U Phe Leu Ser Ser Tyr STOP Cys STOP Trp U C A G C Leu Leu Pro Pro His Gln Arg Arg U C A G A Ile Ile Met Thr Thr Asn Lys Ser Arg U C A G Val Val Ala Ala Asp Glu Gly Gly U C A G G

5’ 1. CUC AGC Leu 5’ 2. C Ser UCA Ser 5’ 3. CU GUU ACC CAG Gln Val Thr G C GU U A Ala CGU Arg AU 3’ CCA Leu UAC Tyr U Pro CAU His 3’ 3’

AMK t. RNK AMK antikodonska petlja antikodon i. RNK

kodoni za leucin kodoni za glicin i. RNK I = inozin

AMK (triptofan) t. RNKTrp aminoacilt. RNK sintetaza (specifična za triptofan) antikodon i. RNK

aminoacil-t. RNK sintetaza aminokiselina pirofosfat t. RNK c. AMP aminoacil t. RNK

SHINE-DALGARNO SEKVENCA startni kodon 3’ kraj 16 S r. RNK

INICIJA TRANSLACIJE KOD E. coli SHINE-DALGARNO SEKVENCA AUG 5’ i. RNK 3’ f Met inicijator t. RNK 2 1 UAC 3 f Met GTP 5’ 30 S faktori inicijacije 3 UAC AUG 3’ 30 S inicijalni kompleks

INICIJA TRANSLACIJE KOD E. coli 50 S f Met 5’ UAC AUG 5’ 3’ f Met UAC AUG P 1 2 3’ A GDP + P 70 S inicijalni kompleks

peptidna veza

ELONGACIJA KOD E. coli f Met Ser UAC AUG UCC AAG P + AGG GTP EF Ser GDP A EF-Tu AGG f Met Ser UAC AGG AUG UCC AAG P A

ELONGACIJA KOD E. coli peptidna veza f Met Ser UAC AGG AUG UCC AAG P A

ELONGACIJA KOD E. coli f Met Ser EF-G AGG AUG UCC AAG P GDP + P A GTP EF-G f Met Ser AGG AUG UCC AAG P A

INICIJA kod eukariota Met inicijator t. RNKMet UAC 5’ AUGCUGUUU i. RNK + 3’ UAC AUGCUGUUU P mala subjedinica ribozoma velika subjedinica ribozoma A

ELONGACIJA peptidna veza Met Leu UAC GAC AUG CUG UUU P A

ELONGACIJA pomeranje za jedan kodon Met Leu UAC GAC AUG CUG UUU P A Met Leu GAC AUG CUG UUU GAC P A

ELONGACIJA Met Leu Phe GAC AAA AUG CUG UUU GAC P A

ELONGACIJA pomeranje za jedan kodon Met Leu Phe GAC AAA AUG CUG UUU GAC P A Met Leu Phe AAA AUG CUG UUU GAC P A

TERMINACIJA Ala Tyr Asp Cys Val Phe Leu Met Gly Ala Tyr Asp Phe Gly Ala Cys Leu Met faktor terminacije Val CAA GUU UAG P A G GUUUA GUUU AUGCU

DNK transkripcija RNK transkript RNK obrada egzon RNK polimeraza pre-i. RNK intron aminoacil-t. RNK -sintetaza nukleus AMK citoplazma t. RNK m RNK ribozomske subjedinice polipeptid aktivacija AMK translacija antikodon m RNK

RNK polimeraza transkripcija DNK poliribozomi m RNK polipeptid

sintetisani polipeptid 60 S 40 S stop kodon startni kodon i. RNK polipeptid 100 nm

ribozom m RNK signalni peptid SRP odvajanje signalnog peptida membrana ER citosol SRP receptori lumen cisterne ER

ANTIBIOTICI KOJI DELUJU SAMO NA PROKARIOTE Deluju na translaciju Tetraciklin blokira vezivanje aminoacil-t. RNK za A mesto Streptomic in blokira prelazak sa inicijacije na elongaciju Hloramfenikol blokira peptidil-transferaznu aktivnost Eritromicin blokira translociranje duž ribozoma Deluju na transkripciju Rifamicin blokira inicijaciju kompetitivnim vezivanjem za RNK polimerazu

ANTIBIOTICI KOJI DELUJU I NA PROKARIOTE I NA EUKARIOTE Deluju na translaciju Piromic in dovodi do prerane terminacije translacije Deluju na transkripciju Aktinomicin D blokira kretanje RNK polimeraze

K r a j