Transcription DNA RNA Transcription polymerase factors 1. 가장 중요한 것인 active site의 확보이다. 2. 다양한 유전자들에서 hypersenstive site가 activated되기 전에 나타난다.
Produced by Huh Jae-Won
RT-PCR의 m. RNA pool 과 5’LTR의 promoter activity는 상관관계가 없다. 3 1 2
In vitro 실험 메틸레이션된 정도와 promoter activity와는 negatively correlation을 보여준다.
Cp. G 메틸레이션이 HERV-K의 provirus가 germ line에 integration 한 뒤에 silencing 시켰다.
Discussion 1. Cp. G methylation이 직접적으로 HERV-K 의 전사를 조절한다. (Tera-1 cell line) 2. 하지만 T 47 D cell line에서는 Cp. G methylation이외에 다른 factor가 HERV-K의 전사를 조절 할 것이다. 3. 1의 결과는 GCT(HERV-K up regulation과 hypomethylation)에 적용 가능하다. 즉 Cp. G가 hypomethylation으로 진행이 되면 HERV-K 5’LTR의 activity에 영향 을 준다. (seminoma tumor, ovarian carcinoma에서 hypomethylation이 관찰되 었다. ) 4. GCT(germ cell tumor) : seminoma, choriocarcinoma, yolk sac tumor, embryonal carcinoma, teratocarcinoma의 종류가 있다.
HERV-K related gene for experiments Produced by Huh jae-won
1 -SIPL: alternative start 제공 재원 BQ 016934: lung(cystic fibrosis-섬유증) : start뿐만 아니라 단백질도 바뀜
Alternative splicing: CB 121278(cervix), BE 397752(lymph node), BM 782895(carcinoma) 앞부분은 다양하지만 결국 번역되어서 단백질은 똑 같다.