Tipi di splicing meccanismo simile Splicing nucleare spliceosoma

Tipi di splicing meccanismo simile • Splicing nucleare spliceosoma • Splicing di introni di tipo II transesterificazioni autosplicing • Splicing di introni di tipo I • Splicing di t. RNA di lievito nucleasi e ligasi

RNA catalitico • RNAsi P • Viroidi e virusoidi • Introni di gruppo I e II

La “testa di martello” (hammerhead) A G CU CG C GC G GA C 5'ppp 3'OH GUA GU loop 2 loop 1 CG AA UN A G NN N GN C NN NN N CN G C AG NAGU ribozima loop 3

Ribozima “hammerhead”

Autosplicing introni gruppo I

Struttura dell’introne dell’r. RNA di Tetrahymena

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006

Autosplicing gruppo II

Splicing mediante transesterificazioni

Trans-splicing in C. elegans

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Splicing alternativo

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Regolazione dello splicing

Traduzione o Sintesi proteica

COMPONENTI DELLA SINTESI PROTEICA RNA Proteine che legano l’m. RNA Amminoacil-t. RNA sintetasi Fattori di traduzione Proteine ribosomali

RNA transfer (t. RNA)

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Struttura dei t. RNA

Il t. RNA è ripiegato in una struttura terziaria compatta

Ansa TYC 5’ 3’ Braccio accettore Ansa D Anticodone

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Il t. RNA è un adattatore

Il t. RNA ha le proprietà di un adattatore che riconosce sia l’amminoacido che il codone

Esempi di basi modificate

“Wobble” Tentennamento Vacillamento Oscillazione

Appaiamenti non canonici nella terza posizione (wobble) U G

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I Ao. Co. U

Il caricamento dei t. RNA Le amminoacil-t. RNA sintetasi

L'amminoacil-t. RNA sintetasi ha tre siti di legame

Attivazione dell'amminoacido

Caricamento del t. RNA

La reazione di caricamento avviene in due passaggi

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Le sintetasi usano il meccanismo di “correzione di bozze” un cambiamento conformazionale può causare l’idrolisi dell’a. a. -adenilato

il trasferimento dell’a. a. sul t. RNA può essere seguito da idrolisi

Ile

L'inserimento del t. RNA nel sito A è controllato mediante “correzione di bozze”

Soppressione

Mutazioni non-senso possono essere “soppresse” da un t. RNA mutato

Mutazioni non-senso possono essere “soppresse” da un t. RNA mutato

I soppressori non-senso continuano la lettura attraverso i codoni di terminazione

Soppressione “di senso”

Ricodifica

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