Tipi di splicing meccanismo simile Splicing nucleare spliceosoma
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Tipi di splicing meccanismo simile • Splicing nucleare spliceosoma • Splicing di introni di tipo II transesterificazioni autosplicing • Splicing di introni di tipo I • Splicing di t. RNA di lievito nucleasi e ligasi
RNA catalitico • RNAsi P • Viroidi e virusoidi • Introni di gruppo I e II
La “testa di martello” (hammerhead) A G CU CG C GC G GA C 5'ppp 3'OH GUA GU loop 2 loop 1 CG AA UN A G NN N GN C NN NN N CN G C AG NAGU ribozima loop 3
Ribozima “hammerhead”
Autosplicing introni gruppo I
Struttura dell’introne dell’r. RNA di Tetrahymena
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006
Autosplicing gruppo II
Splicing mediante transesterificazioni
Trans-splicing in C. elegans
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006
Splicing alternativo
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006
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Regolazione dello splicing
Traduzione o Sintesi proteica
COMPONENTI DELLA SINTESI PROTEICA RNA Proteine che legano l’m. RNA Amminoacil-t. RNA sintetasi Fattori di traduzione Proteine ribosomali
RNA transfer (t. RNA)
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Struttura dei t. RNA
Il t. RNA è ripiegato in una struttura terziaria compatta
Ansa TYC 5’ 3’ Braccio accettore Ansa D Anticodone
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006
Il t. RNA è un adattatore
Il t. RNA ha le proprietà di un adattatore che riconosce sia l’amminoacido che il codone
Esempi di basi modificate
“Wobble” Tentennamento Vacillamento Oscillazione
Appaiamenti non canonici nella terza posizione (wobble) U G
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I Ao. Co. U
Il caricamento dei t. RNA Le amminoacil-t. RNA sintetasi
L'amminoacil-t. RNA sintetasi ha tre siti di legame
Attivazione dell'amminoacido
Caricamento del t. RNA
La reazione di caricamento avviene in due passaggi
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Le sintetasi usano il meccanismo di “correzione di bozze” un cambiamento conformazionale può causare l’idrolisi dell’a. a. -adenilato
il trasferimento dell’a. a. sul t. RNA può essere seguito da idrolisi
Ile
L'inserimento del t. RNA nel sito A è controllato mediante “correzione di bozze”
Soppressione
Mutazioni non-senso possono essere “soppresse” da un t. RNA mutato
Mutazioni non-senso possono essere “soppresse” da un t. RNA mutato
I soppressori non-senso continuano la lettura attraverso i codoni di terminazione
Soppressione “di senso”
Ricodifica
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