Strutture alternative del DNA Gli acidi nucleici possono
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Strutture alternative del DNA
Gli acidi nucleici possono formare vari tipi di doppia elica
Gli acidi nucleici possono formare vari tipi di doppia elica Elica Coppie di basi per giro Rotazione tra due basi Diametro B 10 (10, 4) 36 (34, 6) 20 (19) A 11 32, 7 23 Z 12 -30 18
Strutture superiori del DNA
Superavvolgimento del DNA
Il superavvolgimento negativo può convertirsi nella separazione locale dei due filamenti DNA superavvolto negativamente
struttura Z (in corrispondenza di regioni di alternanza Pu/Py) separazione dei filamenti (denaturazione di regioni ricche in A+T) strutture cruciformi (in corrispondenza di palindromi)
Superavvolgimento del DNA Positivo = DNA superspiralizzato Negativo = DNA sottospiralizzato
Enzimi che alterano la topologia del DNA Topoisomerasi: tipo II
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006
Topoisomerasi
Enzimi che agiscono sugli acidi nucleici • Polimerasi: DNA polimerasi RNA polimerasi • Ligasi • Nucleasi: esonucleasi endonucleasi
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006
Proprietà del DNA Appaiamento (associazione) Denaturazione Rinaturazione
Fattori che influenzano la denaturazione • Temperatura • Forza ionica • p. H
Spettro di assorbimento del DNA 1. 5 Assorbanza effetto ipercromico 1. 0 0. 5 220 240 260 280 300 lunghezza d’onda (nm) 320
Fusione (melting) della doppia elica e misura del Tm (Temperature of melting = Temperatura di fusione) Assorbanza relativa 1. 4 1. 3 1. 2 1. 1 1. 0 80 70 T ( °C) 90 Tm = 83°C 100
Dipendenza della denaturazione del DNA dal contenuto in G+C (moli %) Tm (°C)
B. LEWIN, IL GENE - Edizione compatta, Zanichelli Editore S. p. A. Copyright © 2007
Riassociazione del DNA
Riassociazione del DNA
Appaiamento su filtro (ibridazione)
Sequenze palindromiche
Strutture a "forcina"
Struttura cruciforme
Strutture dell'RNA
Struttura "pseudonodo"
Alterazione della sequenza: le mutazioni • Una modificazione chimica di una base • Incorporazione di una base sbagliata • Alterazione dell’informazione • Alterazione della struttura
Il "Dogma centrale"
Il "Dogma centrale" Replicazione DNA Replicazione Trascrizione inversa Trascrizione RNA Traduzione Proteina