Struttura modulare degli attivatori legame al DNA transattivazione

Struttura "modulare" degli attivatori • legame al DNA • transattivazione • dimerizzazione • legame al ligando

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006

Struttura degli attivatori

Scambio di domini di attivatori

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006

Dominio Dito di Zinco

Omeodominio (HTH, Elica-giro-Elica)

Dominio Elica-Ansa-Elica (b. HLH)

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006

Famiglie di fattori di trascrizione • Dito di zinco (zinc finger) • Omeodominio (elica-giro-elica, HTH) • Elica-ansa-elica (helix loop helix, b. HLH) • Cerniera di leucina (leucine zipper, b. ZIP)

Dimerizzazione degli attivatori

Combinazioni di omodimeri ed eterodimeri

Struttura dell’ “Enhanceosoma”

Attivazione della trascrizione mediante reclutamento

Attivazione della trascrizione

Modificazioni della cromatina mediate dagli attivatori

Acetilazione e deacetilazione della cromatina Corepressore

Gli attivatori sono "bersaglio" di vie di trasduzione

Terminazione della trascrizione nei procarioti

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006

Un terminatore intrinseco è costituito da due regioni palindromiche formano una forcina di 7 -20 bp. Lo stelo include una regione ricca in GC ed è seguito da un tratto di U. Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006

Terminatori intrinseci (terminazione rho indipendente) . . . A G U UA U G A A A UG CG GC C G G CA C U U A GC A G C G A U A U GC C G C G U A AU A U GC C U U A- OH . . . CCCAGC CCG CC UA AU G A GCGGGCUUU-0 H 3' GGGTCGGGCGGATTACT CGCCCGAAAACT TGTTTT 5' 5' CCCAGCCCGCCTAATGAGCGGGCTTTTGAACAAAA 3' A UC A U GA CC GC CG CG CG GC. . . C U C CA UUUUUUU -OH AAAAAA A CT TGTTTT 5' 3' GGGTCGGGCGGATTACTCGCCCG A TT TTTTTT GAACAAAA 3' 5' CCCAGCCCGCCTAATGAGCGGGC AAU C A CG GC CG CG CG GC. . . CCCAUUUU -OH 5' 3' GGGTCGGGCGGATTACTCGCCCGAAAACTTGTTTT CCCAGCCCGCCTAATGAGCGGGCTTTTGAACAAAA 3' 5'

Terminatore rho dipendente Il sito di terminazione è preceduto da una sequenza ricca di C e povera di G Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006

Terminazione Rhodipendente

Antiterminazione

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006

Attenuazione

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006

Nei batteri la trascrizione e la traduzione sono accoppiate

Operone triptofano

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006

Il ribosoma determina la formazione delle strutture

Peptidi "leader" degli operoni "attenuati" codificanti i geni per la sintesi degli amminoacidi

Terminazione negli eucarioti

pol I e pol III pol II

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006

La poliadenilazione degli m. RNA eucariotici

CPSF riconosce seq. AAUAAA Cst. F lega GU, stimola CFI, CFII endonucleasi PAP Poli(A) Polimerasi PABP Poly(A) Binding Protein