Strukturen af transkriptionsaktivatorer 1 DNA bindende domne 2

Strukturen af transkriptionsaktivatorer 1) DNA bindende domæne 2) Transkriptionsaktiverende domæne 3) Eventuelt et dimeriseringsdomæne

DNA bindende domæner 1) Zink indeholdende faktorer 2) Homeodomæner 3) basiske leucin zippers 4) basiske helix-loop-helix Transkriptionsaktiverende domæne 1) Sure aminosyrer 2) Glutamin rigt domæne 3) Prolin rigt domæne

Zink finger struktur a-helix-loop-b-strand to histidiner i a-helix to cysteiner i b-sheet

aminosyrer i a-helix kontakter DNA i major groove

Gal 4 p eksempel på en zink holdig transkriptionsfaktor uden fingerstruktur zink koordineres af 6 cysteiner kort helix genkender DNA target binder i major groove

Kernereceptorer har zinkioner, der er koordineret af fire cysteiner

Homeodomæner indeholder helix-turn-helix strukturer

Homeobox domæner helix turn helix Den ene helix genkender major groove i DNAet

b. ZIP, basisk leucin zipper dimeriserer via leucin resterne og binde DNA i major groove via basiske aminosyrer

Basisk helix-loop-helix protein

Rekrutering af RNA polymerase holoenzymet til promotoren

Eukaryote transkriptionsfaktorer stimulerer binding af generelle transkriptionsfaktorer og RNA polymerasen til promotorer. Hvordan ?

Hvilke dele af det generelle transkriptionsapparat der interagerer med en transkriptionsaktivator kan bestemmes ved et pull-down eksperiment eller 2 -hybrid analyse

Assay til bestemmelse af generelle transkriptionsfaktorer, der interagerer med det sure transkriptionsaktiverende domæne af GAL 4