Standardisierte Terminologien in der Medizin zwischen Begriffssemantik und
Standardisierte Terminologien in der Medizin zwischen Begriffssemantik und Anwendungspragmatik GMDS-Jahrestagung 2005, Freiburg Mittwoch, 14. September 2005 Dr. Josef Ingenerf Institut für Medizinische Informatik Universität zu Lübeck
Vortragsinhalte Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint? n Typisierung von Terminologien n Ordnungssystem für n u u u n Begriffe => Begriffsorientierte Terminologien Klassen => Statistische Klassifikationen Themen => Kontrollierte Thesauren Zusammenfassung Ingenerf, Lübeck 2
Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint? Ingenerf, Lübeck 3
Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint? Ingenerf, Lübeck 4
Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint? ISO/TC 215/WG 3 "Semantic content" (vorher "Health concept representation“) Ingenerf, Lübeck 5
Vortragsinhalte Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint? n Typisierung von Terminologien n Ordnungssystem für n u u u n Begriffe => Begriffsorientierte Terminologien Klassen => Statistische Klassifikationen Themen => Kontrollierte Thesauren Zusammenfassung Ingenerf, Lübeck 6
Typisierung von Terminologien Bildungsprinzipien Präkoordination, Identifikation System von Begriffen (Worten) System von Klassen/Themen Enumerative Begriffsliste, z. B. Alpha-ID, LOINC Hierarchisierung Einfache Postkoordination Formale Postkoordination Abstract-Band, S. 80 Ingenerf, Lübeck 7
LOINC-Terminologie (RELMA) Ingenerf, Lübeck 8
Alpha-ID (“Entry Terms” der ICD-10) Ingenerf, Lübeck 9
Vortragsinhalte Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint? n Typisierung von Terminologien i. w. S. n Ordnungssystem für n u u u n Begriffe => Begriffsorientierte Terminologien Klassen => Statistische Klassifikationen Themen => Kontrollierte Thesauren Zusammenfassung Ingenerf, Lübeck 10
Unterscheidung von Begriff, Thema, Klasse Thema (Deskriptor, Schlagwort, Topic) Wüster, E (1971). Begriffs- und Themaklassifikation: Unterschiede in ihrem Wesen und in ihrer Anwendung. Nachrichten für Dokumentation 22 (3 & 4): 98 -104 & 143 -150. Ingenerf, Lübeck 11
Me. SH-Thesaurus Ingenerf, Lübeck 12
Me. SH-Thesaurus Themenhierarchie versus logische Begriffshierarchie Soualmia, LF, Golbreich, C, Darmoni, SJ (2004). Representing the Me. SH in OWL: Towards a Semi-Automatic Migration. In: Hahn, U (ed. ). Proc. of the First Int. Workshop on Formal Biomedical Knowledge Representation (KR-MED 2004) in Whistler (BC), Canada, 1 June, 2004. Online-Publikation (CEUR-Workshop Proceedings), siehe http: //CEUR-WS. org/Vol-102/, 81 -87. Ingenerf, Lübeck 13
Me. SH-Thesaurus Nelson, SJ, Johnston, D, Humphreys, BL (2001). Relationships in Medical Subject Headings (Me. SH), chapter 11. In: Bean, CA, Green, R (eds. ). Relationships in the Organization of Knowledge. New York: Kluwer Academic Publishers, 171 -184. Ingenerf, Lübeck 14
Me. SH-Thesaurus: Deskriptor- und Konzeptebene desc 2005. dtd Ingenerf, Lübeck 15
Typisierung von Terminologien Bildungsprinzipien Präkoordination, Identifikation Hierarchisierung Einfache Postkoordination Formale Postkoordination System von Begriffen (Worten) Enumerative Begriffsliste, z. B. Alpha-ID, LOINC System von Klassen/Themen - Einfache Themenliste Einfache Themenhierarchie, z. B. Gelbe Seiten Thesaurus oder multiaxiale Themenklassifikation, z. B. Me. SH, Colon-Klass. Abstract-Band, S. 80 Ingenerf, Lübeck 16
ICD-Klassifikation: Systematik Statistische Klassifikation versus Formales Begriffssystem Ingenerf, J, Giere, W (1998). Concept oriented Standardization and Statistics oriented Classification: Continuing the Classification versus Nomenclature Controversy. Meth. Inform. Med. 37 (4 -5): 527 -539. Ingenerf, Lübeck 17
Alpha-ID: Nummerierter alphabetischer Index der ICD-10 Alpha-ID ICD-10 Text der ICD I 5051 I 5057 I 5052 I 19021 I 11881 I 32930 K 25. 9 (B 96. 81!) I 85926 … K 25. 9 (F 54) … Ulcus ventriculi Magenulkus Magengeschwür Magenschleimhautdefekt Ulcus pyloricum Infektion durch Helicobacter pylori bei Ulcus ventriculi Psychogenes Magenulkus … Synonymie? Ingenerf, Lübeck 18
Alpha-ID: Nummerierter alphabetischer Index der ICD-10 Alpha-ID ICD-10 Text der ICD SNOMED-CT I 5051 I 5057 I 5052 I 19021 I 11881 I 32930 K 25. 9 (B 96. 81!) 14532008 6296006 253740007 9660004 5565008 42666000 I 85926 … K 25. 9 (F 54) … Ulcus ventriculi Magenulkus Magengeschwür Magenschleimhautdefekt Ulcus pyloricum Infektion durch Helicobacter pylori bei Ulcus ventriculi Psychogenes Magenulkus … 53189005 … Ingenerf, Lübeck 19
Typisierung von Terminologien i. w. S. Bildungsprinzipien Präkoordination, Identifikation Hierarchisierung System von Begriffen (Worten) Enumerative Begriffsliste, z. B. Alpha-ID, LOINC System von Klassen/Themen - Einfache Themenliste - Klassierter Wertebereich Einfache Themenhierarchie, z. B. Gelbe Seiten Statistische Klassifikation, z. B. ICD-10, NLM-Klass. Einfache Postkoordination Formale Postkoordination Thesaurus oder multiaxiale Themenklassifikation, z. B. Me. SH, Colon-Klass. Abstract-Band, S. 80 Ingenerf, Lübeck 20
Begriffsorientierte Terminologie SNOMED-CT Formales Begriffssystem Þ Deduktion von Begriffswissen Þ Beachtung von ontologischen Prinzipien Smith, B, Ceusters, W, Temmermann, R (2005). Wüsteria. In: Geissbuhler, A, Baud, R, Lovis, C (eds. ). Proc. of the MIE 2005 conference, Geneva (Switzerland), 6 pages. Ingenerf, Lübeck 21
Begriffsorientierte Terminologie „SNOMED-CT“ 89662003 Helicobacter-assoziiertes pylorisches Ulkus (Störung) Fully defined by. . . - ist ein/e - 128070006 infektiöse Krankheiten des Abdomens - 312121001 bakterielle Infektionskrankheit des Magen-Darm-Trakts - 39204006 pylorusnahes Magengeschwür - 6185008 in Verbindung mit Helicobacter stehende Krankheit - verursachendes Agens 80774000 Helicobacter pylori - Group - assoziierte Morphologie 56208002 Geschwür - Befundlokalisation 280119005 Struktur des Magenpförtners Ingenerf, Lübeck 22
Typisierung von Terminologien Bildungsprinzipien Präkoordination, Identifikation Hierarchisierung System von Begriffen (Worten) Enumerative Begriffsliste, z. B. Alpha-ID, LOINC Monoaxiales Begriffssystem (Taxonomie) Einfache Postkoordination Multiaxiales Begriffssystem, z. B. SNOMED II/III Formale Postkoordination Formales Begriffssystem, z. B. SNOMED CT System von Klassen/Themen - Einfache Themenliste - Klassierter Wertebereich Einfache Themenhierarchie, z. B. Gelbe Seiten Statistische Klassifikation, z. B. ICD-10, NLM-Klass. Thesaurus oder multiaxiale Themenklassifikation, z. B. Me. SH, Colon-Klass. Abstract-Band, S. 80 Ingenerf, Lübeck 23
Zusammenfassung Bildungsprinzipien Präkoordination, Identifikation Hierarchisierung System von Begriffen (Worten) Enumerative Begriffsliste, z. B. Alpha-ID, LOINC Monoaxiales Begriffssystem (Taxonomie) Einfache Postkoordination Multiaxiales Begriffssystem, z. B. SNOMED II/III Formale Postkoordination Formales Begriffssystem, z. B. SNOMED CT System von Klassen/Themen - Einfache Themenliste - Klassierter Wertebereich Einfache Themenhierarchie, z. B. Gelbe Seiten Statistische Klassifikation, z. B. ICD-10, NLM-Klass. Thesaurus oder multiaxiale Themenklassifikation, z. B. Me. SH, Colon-Klass. Abstract-Band, S. 80 Ingenerf, Lübeck 24
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