Spektrometria mas ZNACZCE POSTACIE SPEKTROMETRII MAS Ion Chemistry
- Slides: 43
Spektrometria mas
ZNACZĄCE POSTACIE SPEKTROMETRII MAS Ion Chemistry Francis William Aston (1877 - 1945) Cambridge University, Great Britain; Nobel Prize in Chemistry 1922 1 st MS Joseph John Thomson (1856 1940) Cambridge University, Great Britain; Nobel Prize in Physics 1906 Peptide Sequencing using MS Klaus Biemann (1926) MIT, Cambridge, Massachusetts Ion Trap Technique Wolfgang Paul (1913 - 1993) University of Bonn, Germany; Nobel Prize in Physics 1989 MALDI Franz Hillenkamp (1936) University of Münster, Germany ESI of Biomolecules John B. Fenn (1917) Virginia Commonwealth University, Richmond, Virginia Mechanisms and Applications R. Graham Cooks (1941) Department of Chemistry, Purdue University West Lafayette, Indiana Fragmentation Mechanisms Fred W. Mc. Lafferty (1923) Cornell University Ithaca, New York Mechanism of MALDI & ESI Michael Karas (1952) University of Frankfurt, Germany
Joseph Thompson: IZOTOPY HELU 1911
ZASADA POWSTAWANIA WIDMA MAS Droga jonów w polu elektrycznym i magnetycznym: rezultat działających sił: • • • Siła pola magnetycznego (Fm) Siła odśrodkowa (Fc) Energia kinetyczna w polu elektrycznym (E) Fm = Bev Fc = mv 2/r Ek = e. U = ½ mv 2 B = natężenie pola magnetycznego v = prędkość cząstki e = ładunek jonu m = masa cząstki r = promień toru U = natężenie pola elektrycznego Ek = energia kinetyczna cząstki
ZASADA POWSTAWANIA WIDMA MAS Fm = F c Bev = mv 2/r v = Ber/m
WIDMO MASOWE Intensywność Stosunek masy jonu do jego ładunku w funkcji intensywności sygnału m/z 1 Th = 1 Dalton/liczbę ładunków
MASY ATOMOWE - IZOTOPY Węgiel Chlor Symbol Masa atomowa Zawartość izotopu, % 12 C 12. 0000* 98. 89 13 C 13. 0033 1. 11 35 Cl 34. 9689 75. 77 37 Cl 36. 9659 24. 23 * Masa uznana jako dokładnie 12 przez UPAC M(C) = 0. 9889(12. 0000) + 0. 0111(13. 0033) = 12. 011 M(Cl) = 0. 7577(34. 9689) + 0. 2423(36. 9659) = 35. 453
SKŁAD IZOTOPOWY NIEKTÓRYCH PIERWIASTKÓW 1 H 1. 008 1. 00783 2. 01410 12. 011 12. 0000 (std) 98. 89 13. 00336 1. 11 14. 0067 14. 0031 15. 0001 2 H 12 C 13 C 14 N 15 N 16 O 17 O 18 O 15. 9994 15. 9949 16. 9991 17. 9992 99. 99 0. 016 99. 64 0. 36 99. 76 0. 04 0. 20
SKŁAD IZOTOPOWY NIEKTÓRYCH PIERWIASTKÓW 19 F 18. 998 28 Si 28. 0855 29 Si 30 Si 32 S 92. 17 4. 71 3. 12 31. 9721 32. 9715 33. 9679 95. 04 0. 76 4. 20 35. 4527 34. 9689 36. 9659 75. 77 24. 23 34 S 37 Cl 27. 9769 28. 9765 29. 9738 100. 0 32. 066 33 S 35 Cl 18. 9984
SKŁAD IZOTOPOWY NIEKTÓRYCH PIERWIASTKÓW 31 P 30. 9738 100. 0 79 Br 79. 9094 78. 9183 80. 9163 50. 52 49. 48 126. 9045 100. 00 81 Br 126 I M(Br): [% 79 Br x 78. 9183] + [% 81 Br x 80. 9163] [50. 52 x 78. 9183] + [49. 48 x 80. 9163] = 79. 9094
SKŁAD IZOTOPOWY NIEKTÓRYCH PIERWIASTKÓW
SKŁAD IZOTOPOWY – OBWIEDNIA IZOTOPOWA C 100 m/z R. I. X 100 X+1 1. 1 X+1 11. 0 m/z R. I. X 100 X+1 110 X+2 60 X+3 22
MASA CZĄSTECZKOWA MASA MONOIZOTOPOWA Masa cząsteczkowa respiryny C 33 H 40 N 2 O 9 Masy atomowe: Masy izotopów: C: 33 x 12. 011 = 396. 363 C: 33 x 12. 0000 = 396. 000 H: 40 x 1. 0079 = 40. 316 H: 40 x 1. 0078 = 40. 312 N: 2 x 14. 0067 = 28. 013 N: 2 x 14. 0031 = 28. 006 O: 9 x 15. 9994 = 143. 995 O: 9 x 15. 9949 = 143. 954 608. 687 608. 272
PORÓWNANIE PROFILU IZOTOPOWEGO WIDMA ZMIERZONEGO I OBLICZONEGO
WIDMO MAS A STRUKTURA MOLEKUŁY
RODZAJE JONIZACJI Miękka Jonizacja cząsteczek wiązką elektronów Twarda
METODY JONIZACJI
WIDMO EI KWASU OCTOWEGO
ZALEŻNOŚĆ STOPNIA FRAGMENTACJI OD SIŁY POLA ELEKTRYCZNEGO
ESI Orifice Plate 5 k. V LC Desolvation & Fission Nebulizing Gas Droplet Formation To MS Gas Phase Ion Generation Drying Gas Curtain Plate Curtain Gas
REDUKCJA KROPLI I POWSTAWANIE JONÓW
ESI Tryb jonów dodatnich Tryb jonów ujemnych [M+H]+ [M-H]- [M+n. H]n+ i [M+Na+]+ • [M-n. H]n- i [M+I-]-
ESI • Potrójny Kwadrupol (Qq. Q) – 2 kwadrupole filtrujące masy i jedna cela zderzeń. • Pułapka jonowa (IT) – Pojedyncza pułapka działa jako analizator mas i cela zderzeń. • Hybrydy (np. LIT) – Instrument wygląda jaki Qq. Q ale jeden kwadrupol pełni rolę pułapki jonów.
POTRÓJNY KWADRUPOL Akumulacja jonów Q 0 Q 1 Filtrowanie jonów Q 2 Cela zderzeń Q 3 Filtrowanie jonów
POTRÓJNY KWADRUPOL Ion accumulation Q 0 Q 1 Precursor ion selection Q 2 Q 3 Fragmentation N 2 CAD Gas • Q 1 selkcjonuje [M+H]+ • Q 2 fragmentuje wyselkcjonowany jon. • Q 3 filtruje i monitoruje tylko wybrany jon.
WIDMO ESI ZWIĄZKU O NISKIEJ MASIE
WIDMO ESI SYNTETYCZNEGO OLIGONUKLEOTYDU
WIDMO ESI KOMPLEKSÓW 18 -C-6 Z KATIONAMI LITOWCÓW
WIDMO ESI PEPTYDU O MASIE 16952, 20 Da
ROZDZIELCZOŚĆ SPEKTROMETRU MAS
FRAGMENTACJA ŁAŃCUCHA PEPTYDOWEGO
FRAGMENTACJA ŁAŃCUCHA PEPTYDOWEGO b 2 -H 2 O a 2 b 3 - NH 3 b 2 a 3 b 3 HO NH 3+ | | R 1 O R 2 O R 3 O R 4 | || | H -- N --- C --- N --- C -- COOH | | | | H H H H y 3 y 2 y 3 -H 2 O y 1 y 2 - NH 3
FRAGMENTACJA ŁAŃCUCHA PEPTYDOWEGO
IDENTYFIKACJA PEPTYDÓW/BIAŁEK PRZY UŻYCIU MS/MS G V D L K Identyfikacja peptydu Intensity MS/MS mass 00
TANDEM MS
„ODCISK PALCA” W MS Peptide Mass Fingerprinting (PMF)
PROTEOMIKA - MS Trypsin + Gel punch p 53 Trx G 6 PDH
ENZYMATYCZNA HYDROLIZA BIAŁEK DO PEPTYDÓW MPSERGTDIMRPAKID. . . BIAŁKO GTDIMR PAKID HPLC MPSER …… …… PEPTYDY (tryptic peptides) do MS/MS
BIBLIOTEKA PEPTYDÓW TRYPTYCZNYCH Sekwencja >Białko 1 acedfhsakdfqea sdfpkivtmeeewe ndadnfekqwfe >Białko 2 acekdfhsadfqea sdfpkivtmeeewe nkdadnfeqwfe Masa (M+H) 4842. 05 acedfhsak dfgeasdfpk ivtmeeewendadnfek gwfe 4842. 05 acek dfhsadfgeasdfpk ivtmeeewenk dadnfeqwfe >Białko 3 MASMGTLAFD EYGRPFLIIK DQDRKSRLMG LEALKSHIM A AKAVANTMRT SLGPNGLD KMMVDKDGDVTV TNDGAT ILSM MDVDHQIAKL MVELS KSQDD EIGDGTTGVV VLAG ALLEEAEQLLDRGIHP IRIAD Peptydy trypt. 14563. 36 SQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDR 2 DGDVTVTNDGATILSMMDVD HQIAK MASMGTLAFDEYGRPFLIIK 2 TSLGPNGLDK LMGLEALK LMVELSK AVANTMR SHIMAAK GIHPIR MMVDK DQDR
TANDEM MS MS LC collision MS-2 MS-1 cell Ion Source MS/MS
ANALIZA DANYCH S e k w e n c j a MS/MS instrument Analiza przy użyciu baz danych
PMF online • Mascot • www. matrixscience. com • Pro. Found – http: //129. 85. 192/profound_bin/Web. Pro. Found. exe • MOWSE • http: //srs. hgmp. mrc. ac. uk/cgi-bin/mowse • Peptide. Search • http: //www. narrador. emblheidelberg. de/Group. Pages/Homepage. html • Pept. Ident • http: //us. expasy. org/tools/peptident. html
- Interferenty
- Atomowa spektrometria absorpcyjna
- C6h12 fuerza intermolecular
- Fuerzas dipolo dipolo ejemplos
- Qué son las fuerzas intramoleculares
- London forces
- Geneza quo vadis
- Balladyna bohaterowie główni i drugoplanowi
- Narrator reduta ordona
- Gvdlk
- Postacie historyczne z hymnu polskiego
- Postacie funkcji kwadratowej
- Quo vadis postacie
- Gajusz petroniusz aulus plautius
- Ybc postacie imiona
- Opowiadanie fantastyczne o gradzie
- Postacie
- Postacie normalne bazy danych
- Gwni
- Postacie z bajek jana brzechwy
- Polyatomic ion sheet
- Polyatomic compounds
- Polyatomic ions
- Monatomic ion definition chemistry
- Inorganic chemistry vs organic chemistry
- Functional groups ib chemistry
- La persona mas peligrosa la mentirosa
- Convirtio lleva tilde
- Caminaba un dia con mi padre cuando de pronto me pregunto
- El misterioso balsamo curo sus heridas y le infundio animo
- Para que mi amor no sea un sentimiento letra
- Mas o más
- No es mas rico el que mas tiene sino el que menos necesita
- Common ion effect example
- Roger webb surrey
- Concentration cell
- How to do bohr diagram
- Suffixes ion ation ition
- Liviu rebreanu biografie
- Atom molecule and ion
- Polyatomic ionic compound definition
- Oksonijev ion
- Ion ipa145
- Ion exchange chromatography