Souasn monosti studia na MU se zamenm na

Současné možnosti studia na MU se zaměřením na biologii a představení moderního studijního oboru Matematická biologie Bc. Renata Chloupková Brno 2. dubna 2014

Obsah prezentace 1. Zázemí na PřF MU 2. Obory se zaměřením na biologii 3. Matematická biologie 2. 4. 2014 Studium biologie na MU; Matematická biologie 2

Přírodovědecká fakulta • Univerzitní kampus – moderní prostory – studium, výzkum, volnočasové aktivity • areál Kotlářská – botanická zahrada 2. 4. 2014 Studium biologie na MU; Matematická biologie 3

BIOLOGIE: programy a obory • Biologie – Lékařská genetika a molekulární diagnostika • Ekologická a evoluční biologie – Ekologická a evoluční biologie • Experimentální biologie – Matematická biologie – Molekulární biologie a genetika – Speciální biologie • Biologie se zaměřením na vzdělávání 2. 4. 2014 Studium biologie na MU; Matematická biologie 4

• prezenční forma studia bc. n. Mgr. povinná TV (2 semestry) odborná AJ (úroveň B 1) + • zahraniční studium • moderní pracoviště UKB • brigáda/praxe na škole • příjemné studijní oddělení • prominutí přijímací zkoušky – • stipendia • „zbytečná košatost“ oborů • praxe X teorie • jazyky • přijetí na n. Mgr. studium 2. 4. 2014 Ph. D. , RNDr. odborný jazyk (AJ, F, N, RJ, Šp) – úroveň B 2 Studium biologie na MU; Matematická biologie 5

• přijímací řízení: – TSP + odborný test – prominutí přijímacího řízení: regionální (krajské) kolo vědní disciplína související s oborem Biologie Experimentální biologie obor Matematická biologie Ekologická a evoluční biologie do 1, 5 Bi + Ch + 2 profilové předměty 2. 4. 2014 nelze prominout prospěch a současně olympiáda nebo SOČ prospěch a současně maturita z matematiky a biologie nebo z matematiky a chemie prospěch a současně olympiáda nebo SOČ regionální (krajské) kolo vědní disciplína související s oborem Studium biologie na MU; Matematická biologie 6

Lekářská genetika a molekulární diagnostika • LF + PřF (=biomedicína) • důraz na praktické zaměření oboru • uplatnění v klinických laboratořích – genetika, cytogenetika, DNA diagnostika • předměty: Bi, Ch, F + M • 2013: uchazeči přijato úspěšnost 613 2. 4. 2014 36 6 % Studium biologie na MU; Matematická biologie 7

Speciální biologie • 1. rok studia: společný základ (důraz na Ch) – Experimentální biologie rostlin • předměty v AJ, Antarktida – Experimentální biologie živočichů a imunologie – Mikrobiologie a molekulární biotechnologie • velký důraz na bioinformatiku – Ekotoxikologie • Recetox: – moderní pracoviště, inovace výuky • 2013: uchazeči 275 2. 4. 2014 přijato úspěšnost 143 52 % Studium biologie na MU; Matematická biologie 8

Molekulární biologie a genetika • moderní oblast biologie → velký zájem – 2013: uchazeči 432 přijato úspěšnost 117 27 % • důraz na chemii (i praktická cvičení) • 2 směry, 1. rok studia společný: – Molekulární biologie a genetika – Antropogenetika 2. 4. 2014 obtížná SZZ přijetí na n. Mgr. Studium biologie na MU; Matematická biologie 9

Ekologická a evoluční biologie • nejvíce „popisná“ biologie – podrobná taxonomie i s cvičeními – terénní cvičení, exkurze (i zahraničí) – méně chemie oproti ostatním oborům • směry v n. Mgr: botanika a zoologie – uplatnění: Akademie věd, muzea, CHKO, Zoo, … • modernizace výuky, UKB • Ústav botaniky a zoologie • 2013: uchazeči přijato úspěšnost 253 2. 4. 2014 94 37 % Studium biologie na MU; Matematická biologie 10

Biologie se zaměřením na vzdělávání • pedagogicko-psychologický základ + obecné odborné předměty napříč oborem • dvouobor: Bi + Fyzika, Matematika, Geografie nebo Informatika a druhý obor uchazeči přijato úspěšnost • 2013: Bi+F 15 10 67 % 2. 4. 2014 Bi+Geo 52 27 52 % Bi+I 4 2 50 % Bi+M 30 23 77 % Studium biologie na MU; Matematická biologie 11

Matematická biologie • založeno 1999, od 2003 pod IBA*, 2004 nové osnovy • aplikace matematických postupů a nástrojů pro řešení biologických a medicínských problémů * IBA = Institut biostatistiky a analýz • • • 2. 4. 2014 Lékařské a Přírodovědecké fakulty MU vědeckovýzkumná činnost, řešení vědeckých projektů a poskytování souvisejících služeb zejména v oblasti analýzy biologických a klinických dat, organizace a managementu klinických studií, vývoje softwaru a aplikace ICT Studium biologie na MU; Matematická biologie 12

• Biologie a medicína bez analýzy dat dnes již není možná. – obor vznikl ze současné potřeby trhu – obor zaměřený na matematickou analýzu biologických a medicínských dat – cíl oboru: produkce odborníků se znalostí biologické i matematické podstaty problému 2. 4. 2014 informatika biologie Studium biologie na MU; Matematická biologie matematika 13

Matematická biologie environmentální vědy 2. 4. 2014 genomika, proteomika, bioinformatika Studium biologie na MU; Matematická biologie, fyziologie, medicína 14

Matematická biologie environmentální vědy genomika, proteomika, bioinformatika biologie, fyziologie, medicína • Modelování dynamiky a vzájemných vztahů populací. • Modelování interakcí mezi chemickým látkami, prostředím a živými systémy. 2. 4. 2014 Studium biologie na MU; Matematická biologie 15

Matematická biologie environmentální vědy genomika, proteomika, bioinformatika biologie, fyziologie, medicína • Sledování aktivity genů, analýza buněčných drah, sledování epigenetických změn • Sledování a srovnávání sekvence proteinů a nukleových kyselin • Studium strukturálních vztahů nukleových kyselin a proteinů 2. 4. 2014 Studium biologie na MU; Matematická biologie 16

Lucie Brožová: Metody hodnocení genetických asociačních studií (ukázka části práce) • zhodnocení asociace mezi výsledkem přímé mikroskopie a genetickou výbavou koně přítomnost parazitů přítomnost SNP • testováno 101 Murgeských koní 2. 4. 2014 Studium biologie na MU; Matematická biologie 17

• kontrola kvality dat: 1. hodnocení vazebné nerovnováhy: maximální hodnota r 2=0, 44 2. hodnocení Hardyho- Weinbergovy rovnováhy • hodnocení asociace pro více SNP současně (MDR): o datový soubor pro koně starší 2, 5 let včetně (N=76) Model MDR SNP 1 wtwt SNP 21 Mwt MM wtwt 3/30 Mwt 8/6 (0, 10) (1, 33) 6/6 1/12 2/0 (1, 00) (0, 08) (-) - 0/2 (0, 00) MM - - Rizikový genotyp Genotyp bez rizika Ø Koně pozitivní v DM/koně negativní v DM=20/56=0, 263 DM – přímá mikroskopie, M – minoritní alela, wt – obvyklá alela 2. 4. 2014 Studium biologie na MU; Matematická biologie 18

Matematická biologie environmentální vědy genomika, proteomika, bioinformatika biologie, fyziologie, medicína • Aplikovaná analýza dat klinických experimentů • Hodnocení klinických studií • Hodnocení biologických společenstev 2. 4. 2014 Studium biologie na MU; Matematická biologie 19

Lucie Panáčková: Statistické modely pro hodnocení ekologického stavu stojatých vod pomocí fytobentosu (ukázka části práce) • data z povodí Moravy, 21 nádrží • cíl: Pilotní analýza ekologického stavu nadrží s využitím statistických metod. 2. 4. 2014 Studium biologie na MU; Matematická biologie 20

• rozdělení nádrží podle chemických parametrů: III. 2. 4. 2014 I. II. • Obsah chemických látek se odráží na výskytu rozsivek v nádržích, jejich počtu i diverzitě. • S kvalitnější vodou počet rozsivek i jejich diverzita roste • Na vliv chemického složení nádrží má značný vliv také geografické charakteristiky nádrží (zejména nadmořská výška). • Nelze jednoznačně prokázat, zda rozsivky mají určitá specifika na trofický stav nádrže nebo je jejich přítomnost ovlivněna i jinými vlastnostmi nádrže. Studium biologie na MU; Matematická biologie 21

Zita Macháčková: Hodnocení nákladové efektivity programů prevence zhoubných nádorů (ukázka části práce) • program mamografického screeningu – od 2002, prevence rakoviny prsu poznámka: webový portál http: //www. svod. cz/ 2. 4. 2014 Studium biologie na MU; Matematická biologie 22

2. 4. 2014 Studium biologie na MU; Matematická biologie 23

Možnosti uplatnění Státní správa Komerční sféra Česká informační agentura ŽP Agentura ochrany přírody a krajiny Zdravotní pojišťovny Farmaceutické firmy Firmy vedoucí a hodnotící klinické studie Společnosti pro marketingové průzkumy 10% 60% 20% Zdravotnictví Státní i soukromá zdravotnická zařízení Akademická sféra (Výzkum a vývoj) Mezinárodní centra klinického výzkumu Zahraniční univerzity IBA MU 2. 4. 2014 Studium biologie na MU; Matematická biologie 24

Zhodnocení oboru + • • praxe/brigáda v oboru znalost programů nesvázané osnovy týmové projekty moderní, potřebný obor předměty v AJ letní školy přijímací řízení • • ? ? přejíždění stále v režimu „testování“ přijímací řízení na n. Mgr. polovina studia Bc. – neprovázanost Bi a M neprogramujeme „syndrom gymnázia“ matematika • • • 2. 4. 2014 Studium biologie na MU; Matematická biologie málo studentů neúčastníme se sběru dat absence „praktické“ výuky 25

Skripta zdarma 2. 4. 2014 Studium biologie na MU; Matematická biologie 26

Letní školy • setkání v rámci oboru • každý rok jiné téma • přednášky domácích i zahraničních odborníků 2. 4. 2014 Studium biologie na MU; Matematická biologie 27

Možnost práce se špičkovými programy 2. 4. 2014 Studium biologie na MU; Matematická biologie 28

Předpoklady pro studium • Nebát se matematiky – vhodná znalost diferenciálního a integrálního počtu • Zajímat se o biologii • Mít vztah i k dalším oborům (medicína, chemie, ekologie, informatika) Komplexní pojetí = mezioborové zaměření → obtížné, ale s obrovským potenciálem. 2. 4. 2014 Studium biologie na MU; Matematická biologie 29

Přijímací řízení • Test studijních předpokladů • bez přijímací zkoušky: – studijní průměr do 1, 5 z matematiky, biologie a chemie + jednoho dalšího profilového předmětu ∧ maturita z M+Bi nebo M+Ch • 2013: 2. 4. 2014 uchazeči 43 přijato úspěšnost 36 84 % Studium biologie na MU; Matematická biologie 30

Děkuji za pozornost. renata. chloupkova@mail. muni. cz 2. 4. 2014 Studium biologie na MU; Matematická biologie 31

Zdroje, doporučené odkazy: • • www. muni. cz www. sci. muni. cz www. iba. muni. cz www. matematickabiologie. cz • • • Studijní katalog BIOLOGIE, 2013: http: //www. sci. muni. cz/katalog 2013/katalog. B. pdf Aktuální informace pro přijímací řízení (bc studium): http: //www. sci. muni. cz/cz/Pri. Bc/ Prominutí přijímací zkoušky (bc studium): http: //www. sci. muni. cz/cz/Pri. Bc/Prijimaci-zkousky Přehled otevíraných oborů na PřF MU: http: //www. sci. muni. cz/cz/Pri. Bc/Otevirane-obory Statistiky z přijímacího řízení na MU (2013): • http: //is. muni. cz/do/1499/metodika/stud/prijriz/zpravy/posledni/Prijimaci_rizeni_Pri. F-Bc_-_zprava. pdf • http: //is. muni. cz/do/1499/metodika/stud/prijriz/zpravy/posledni/Prijimaci_rizeni_Pri. F-NMgr__zprava. pdf • Ukázky závěrečných prací: • BROŽOVÁ, Lucie. Metody hodnocení genetických asociačních studií [online]. 2012 [cit. 2014 -03 -26]. Bakalářská práce. Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta. Vedoucí práce Michaela Cvanová. Dostupné z: <http: //is. muni. cz/th/357561/prif_b/>. • PANÁČKOVÁ, Lucie. Statistické modely pro hodnocení ekologického stavu stojatých vod pomocí fytobentosu [online]. 2012 [cit. 2014 -03 -26]. Bakalářská práce. Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta. Vedoucí práce Simona Littnerová. Dostupné z: <http: //is. muni. cz/th/356971/prif_b/>. • MACHÁČKOVÁ, Zita. Hodnocení nákladové efektivity programů prevence zhoubných nádorů [online]. 2012 [cit. 2014 -03 -26]. Bakalářská práce. Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta. Vedoucí práce Ondřej Májek. Dostupné z: <http: //is. muni. cz/th/356966/prif_b/>. 2. 4. 2014 Studium biologie na MU; Matematická biologie 32

Obrázky v prezentaci • • • • • http: //www. muni. cz/sci/general/mu_presentation/logos http: //www. muni. cz/history/artworks/1205/1 http: //www. ukb. muni. cz/index. php/fotogalerie. html http: //www. muni. cz/history/events_gallery/1187/ http: //www. muni. cz/general/events/p 233332/gallery/ http: //www. molekulara. cz/odborne-aktivity/ http: //polar. sci. muni. cz/cs/fotogalerie http: //www. recetox. muni. cz/index. php? pg=aktuality&aid=385 http: //www. sci. muni. cz/ueb/studium/bakalarske-studium/lekarska-genetika-a-molekularni-diagnostika/ http: //www. sci. muni. cz/zoolecol/verteb/gallery/pc 020023. jpg http: //www. sci. muni. cz/botany/systemgr/fotoarchiv. php? dir=Laboratories%20 and%20 Field&show=02. jpg&lang= http: //pipz. webnode. cz/vtipy-o-skole-/ http: //www. matematickabiologie. cz/res/image/layout/studenti 03 -680 -170. jpg http: //www. iba. muni. cz/res/image/homepage/matematicka-biologie. gif http: //www. matematickabiologie. cz/res/image/layout/priroda 03 -680 -170. jpg http: //en. wikipedia. org/wiki/Single-nucleotide_polymorphism http: //www. linkos. cz/files/pro_odborniky/nop/registry/NOR. jpg • loga programů: – http: //www. itbiz. cz/images/upload/s/sas. jpg – http: //www. vscht. cz/ext/haimg/11/Matlab/matlab. png – http: //pixhost. me/avaxhome/4 a/2 c/00102 c 4 a_medium. jpeg – http: //rhrv. r-forge. r-project. org/css/images/R. png – http: //upload. wikimedia. org/wikipedia/en/b/b 8/Ibm-spss-statistics-17. png – https: //ui. pefka. mendelu. cz/files/image/Technika/statistica. jpeg – https: //ui. pefka. mendelu. cz/files/image/Technika/arcgis. gif 2. 4. 2014 Studium biologie na MU; Matematická biologie 33