Sequenze IRES virali IRES negli m RNA cellulari

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Sequenze IRES virali

Sequenze IRES virali

IRES negli m. RNA cellulari

IRES negli m. RNA cellulari

Strutture secondarie delle IRES

Strutture secondarie delle IRES

Fattori trans-agenti delle IRES

Fattori trans-agenti delle IRES

Ruolo delle IRES

Ruolo delle IRES

Meccanismi di traduzione negli eucarioti

Meccanismi di traduzione negli eucarioti

Regolazione della traduzione • generale • specifica

Regolazione della traduzione • generale • specifica

Initiation Factors prokaryotes Activity eukaryotes IF 3 e. IF-1 Fidelity of AUG codon recognition

Initiation Factors prokaryotes Activity eukaryotes IF 3 e. IF-1 Fidelity of AUG codon recognition IF 1 e. IF-1 A Facilitate Met-t. RNAi. Met binding to small subunit e. IF-2 Ternary complex formation e. IF-2 B (GEF) GTP/GDP exchange during e. IF-2 recycling e. IF-3 (12 subunits) Ribosome antiassociation, binding to 40 S e. IF-4 F (4 E, 4 A, 4 G) m. RNA binding to 40 S, RNA helicase activity IF 2 e. IF-4 A ATPase-dependent RNA helicase e. IF-4 E 5' cap recognition e. IF-4 G Scaffold for of e. IF-4 E and -4 A e. IF-4 B Stimulates helicase, binds with e. IF-4 F e. IF-4 H Similar to e. IF 4 B e. IF-5 Release of e. IF-2 and e. IF-3, GTPase e. IF 5 B Subunit joining e. IF-6 Ribosome subunit antiassociation

Via delle MAP chinasi

Via delle MAP chinasi

stress

stress

Chinasi di e. IF 2 a

Chinasi di e. IF 2 a

Azione delle chinasi di e. IF 2 a

Azione delle chinasi di e. IF 2 a

Risposta UPR (Unfolded Protein Response)

Risposta UPR (Unfolded Protein Response)

Risposta UPR (Unfolded Protein Response)

Risposta UPR (Unfolded Protein Response)

Interferenza dei virus nella traduzione negli eucarioti

Interferenza dei virus nella traduzione negli eucarioti

Meccanismi virali d'inibizione della fosforilazione di e. IF 2 a

Meccanismi virali d'inibizione della fosforilazione di e. IF 2 a

Regolazione di e. IF 2 a § Fosforilazione su ser 51 in risposta a

Regolazione di e. IF 2 a § Fosforilazione su ser 51 in risposta a stress da parte di 4 chinasi: PKR, GCN 2, PERK, HRI § La fosforilazione impedisce il riciclo da parte di e. IF 2 B § La traduzione di alcuni m. RNA è stimolata da bassi livelli di e. IF 2 a attivo § Molti virus hanno sistemi per impedire la fosforilazione di e. IF 2 a

e. IF 4 F

e. IF 4 F

Fosforilazione di 4 E-BP

Fosforilazione di 4 E-BP

Regolazione di e. IF 4 E

Regolazione di e. IF 4 E

Regolazione e. IF 4 E § Fosforilazione su ser 209 da parte di Mnk

Regolazione e. IF 4 E § Fosforilazione su ser 209 da parte di Mnk 1 (e Mnk 2) correlata con attivazione § Mnk interagiscono con e. IF 4 G e sono attivate dalla via delle MAP chinasi § Doppio KO per Mnk 1 e 2 è normale § e. IF 4 E è inibito dall’interazione con 4 E-BP (1, 2 e 3) § 4 E-BP sono inibite da fosforilazione dipendente dalla via di m. TOR

Alterazione della traduzione da parte dei virus

Alterazione della traduzione da parte dei virus

m. TOR è un regolatore centrale

m. TOR è un regolatore centrale

Struttura di m. TOR

Struttura di m. TOR

Inibizione della rapamicina

Inibizione della rapamicina

m. TOR è un regolatore centrale

m. TOR è un regolatore centrale

Complessi formati da m. TOR

Complessi formati da m. TOR

Bersagli di m. TOR

Bersagli di m. TOR

m. TOR regola l'inizio e l'allungamento

m. TOR regola l'inizio e l'allungamento

Translation and oncogenesis • Hypertrophic nucleoli were a prominent feature of malignant cell •

Translation and oncogenesis • Hypertrophic nucleoli were a prominent feature of malignant cell • Ribosome alterations are associated with malignancies • Common cancer-related mutations are found in pathways feeding into the translation machinery • Translation initiation factors are frequently amplified or dysregulated in tumours

Alterazione della traduzione e tumori

Alterazione della traduzione e tumori

Role of ribosome in tumorigenesis defective ribosome QUANTITATIVE/QUALITATIVE ALTERATIONOF TRANSLATION tumorigenesis

Role of ribosome in tumorigenesis defective ribosome QUANTITATIVE/QUALITATIVE ALTERATIONOF TRANSLATION tumorigenesis

Translation initiation factors and cancers

Translation initiation factors and cancers

Traduzione e cancro

Traduzione e cancro

Regolazione della traduzione • generale • specifica

Regolazione della traduzione • generale • specifica

Transcriptional control Translational control gene m. RNA protein • Slow • Lasting • Transcription-dependent

Transcriptional control Translational control gene m. RNA protein • Slow • Lasting • Transcription-dependent • Rapid • Short-lived • Transcription-independent

Indicazione di controllo traduzionale northern -Fe m. RNA ferritina western +Fe -Fe ferritina actina

Indicazione di controllo traduzionale northern -Fe m. RNA ferritina western +Fe -Fe ferritina actina m. RNA actina +Fe

METODI PER STUDIARE IL CONTROLLO TRADUZIONALE • Confronto tra la variazione della quantità di

METODI PER STUDIARE IL CONTROLLO TRADUZIONALE • Confronto tra la variazione della quantità di m. RNA e quella del prodotto proteico Øgel poliacrilammide 2 D (DIGE) Øwestern blot • Analisi della stabilità delle proteine mediante l'uso di inibitori della traduzione • Analisi della quantità di m. RNA sui polisomi (distribuzione)

Polysome analysis

Polysome analysis

TOP m. RNA translational control in cultured cells

TOP m. RNA translational control in cultured cells

Meccanismi di regolazione traduzionale

Meccanismi di regolazione traduzionale

Meccanismi di regolazione traduzionale

Meccanismi di regolazione traduzionale