RVOLUTION NUMRIQUE DONNES PARTAGES ET OPEN DATA Lintelligence

RÉVOLUTION NUMÉRIQUE DONNÉES PARTAGÉES ET OPEN DATA L’intelligence des données: besoins et perspectives Anita BURGUN Université Paris Descartes AP-HP – Hôpital Européen Georges Pompidou et Hôpital Necker Enfants Malades INSERM Centre de Recherche des Cordeliers

RÉVOLUTION NUMÉRIQUE DONNÉES PARTAGÉES ET OPEN DATA Phenotype Thiopurine Low activity Intermediate activity Normal activity Very High activity 10 % dose 30 – 70 % dose 100 % dose > 100 % Dose ?

RÉVOLUTION NUMÉRIQUE DONNÉES PARTAGÉES ET OPEN DATA 3 Cell -> mice -> retrospective data text-based research algorithm to identify all carcinoma patients who, between 1981 and 2009, received digitalin during conventional carcinoma therapies compared the overall survival of 145 patients treated with CGs with that of 290 patients who did not receive CGs.

RÉVOLUTION NUMÉRIQUE DONNÉES PARTAGÉES ET OPEN DATA Evidence-Based Medicine in the EMR Era J. Frankovich, C. A. Longhurst, S M. Sutherland. Stanford, publication NEJM 9 Nov 2011 Les patients similaires à un patient non diagnostiqué

RÉVOLUTION NUMÉRIQUE DONNÉES PARTAGÉES ET OPEN DATA Qualité/ Parcours de soin

RÉVOLUTION NUMÉRIQUE DONNÉES PARTAGÉES ET OPEN DATA Financer des plateformes de données patients Articulées avec les plateformes de génomique et les données de recherche Articulées avec l’infrastructure SNDS autant que de besoin Rôle: organiseront les versants techniques, algorithmiques, règlementaires, et éthiques de l’accès aux données (infrastructure BI, logiciels d’extraction et d’analyse, règles de gouvernance, CNIL, etc. ). Têtes de pont du partage de données au niveau des GHT. Lever les obstacles règlementaires et organiser le partage Articulation avec les biobanques

RÉVOLUTION NUMÉRIQUE DONNÉES PARTAGÉES ET OPEN DATA Financer des centres d’excellence en traitement des données de santé à l’image des IHU ou des SIRIC, à gouvernance et financement partagés entre les producteurs de données et les organismes d’enseignement et de recherche. Structures hospitalo-universitaires associant mathématiques, informatique biomédicale, etc. Appel d’offre avec (i) des financements permettant d’accompagner la création, et la réalisation d’un programme sur 5 ans et (ii) un suivi par un comité scientifique international. Selon le modèle des « sites de recherche intégrée » et des « learning health systems » Insérés dans le milieu hospitalier et associés aux plateformes de données patients, aux plateformes de données génomiques, et aux biobanques.

RÉVOLUTION NUMÉRIQUE DONNÉES PARTAGÉES ET OPEN DATA Financer des centres d’excellence en traitement des données de santé Vanderbilt Department 75 faculty members + staff, TOUS biomedical informatics Collaborations avec recherche en info/ biomath et médicale Réseau e. Merge Intégration avec l'hôpital : (applications « en réel » ) Intégration avec Bio. VU (200, 000 échantillons) Intégration avec la Recherche Clinique (Red. Cap) Financements Big Data to Knowledge (BD 2 K Oxford

RÉVOLUTION NUMÉRIQUE DONNÉES PARTAGÉES ET OPEN DATA Analyse de la prise en charge Mathématiques appliquées Bioinformatique Heathcare Data Nouveaux designs d’essais Research Data Learning health systems Aide à la décision Dose finding Biostatistique Informatique médicale

RÉVOLUTION NUMÉRIQUE DONNÉES PARTAGÉES ET OPEN DATA Les centres de données cliniques Modèles hospitalo-universitaires pour l’exploitation des données massives en santé Pr Marc CUGGIA Spécialiste en informatique médicale et biostatistiques au CHU de Rennes

RÉVOLUTION NUMÉRIQUE DONNÉES PARTAGÉES ET OPEN DATA Des usages multiples en plein essor L’individu • Médecine 4 P, recherche de biomarqueurs Les collectivités • Vigilances, veille sanitaire La recherche • Épidémiologie : Détection et alimentation de cohortes et de registres • Recherche clinique : Études de faisabilité, recherche de patients éligibles L’organisation raisonnée des soins • L’analyse des trajectoires de santé L’enseignement • Simulation et patients virtuels

RÉVOLUTION NUMÉRIQUE DONNÉES PARTAGÉES ET OPEN DATA Les Centres de Données Cliniques (CDC) Organisation intra-hospitalière « guichet unique » : • offre l’expertise et des services d’exploitation des DMS • s’appuyant sur une plateforme technique : entrepôt de données biomédicales Principe de proximité : • les professionnels de santé et les équipes de recherche et les patients Rassemble des compétences multidisciplinaires : • Informatique médicale, biostatistiques, bioinformatique • méthodologique et réglementaire

RÉVOLUTION NUMÉRIQUE DONNÉES PARTAGÉES ET OPEN DATA Les centre de Données Cliniques (CDC) Une structure de confiance : • sous responsabilité et expertise médicale • réalise les traitements et en assure la traçabilité • en respectant un cadre éthique, déontologique et réglementaire Un centre d’accueil et de formation : • pour les chercheurs spécialistes dans le traitement de l’information • adossé à des unités de recherche labélisées

RÉVOLUTION NUMÉRIQUE DONNÉES PARTAGÉES ET OPEN DATA Exemple du CDC de Rennes Sources de données Données identité/séjour/structure Entrepôt de données Comptes-rendus hospitaliers 14 Prescription/administration Biobanque (CRB) Dossiers urgences Données de laboratoires Dossiers infirmiers (projet) PMSI Anatomo-pathologie Imagerie 60 études cliniques et 10 projets de recherche (depuis la MEP)

RÉVOLUTION NUMÉRIQUE DONNÉES PARTAGÉES ET OPEN DATA Extension en réseau des CDC Sur les 6 CHU du Grand Ouest • Rennes, Brest, Angers, Tours, Nantes et Poitiers Financement GCS HUGO-GIRCI GO Comité scientifique et de pilotage interrégional Coordination et animation • Déploiement des 6 plateformes • Mutualisation des compétences • Exploitation multicentrique Intégration à d’autres réseaux, infrastructures et sources de données Ø Biobanque, CIC-IT, Réseau RECAP, European RDA, Flag-ERA

RÉVOLUTION NUMÉRIQUE DONNÉES PARTAGÉES ET OPEN DATA Les besoins Accéder aux données des patients : • chantier technique dans les CHU, extension au GHT • intégrer les autres sources de données – Génome, SNIIR-AM (DCIR), registres, objets connectés Disposer d’infrastructures techniques hautement performantes : • stockage et traitements massifs • Sécurisées Consolider des équipes pluridisciplinaires : • former et recruter du personnel qualifié

RÉVOLUTION NUMÉRIQUE DONNÉES PARTAGÉES ET OPEN DATA Au total Rôle clef des CHU dans l’exploitation des DMS : • premier producteur de données de santé • rassemble les expertises multidisciplinaires Construction des infrastructures de demain : • fonctionnement en réseau • indispensable pour affronter une compétition internationale Pour un usage raisonné et éthique des DMS : • au service des patients • en lien avec les missions de soins, d’enseignement et de recherche