Rseau Tela Botanica Le Rseau Tela Botanica ses
Réseau Tela Botanica • Le Réseau Tela Botanica, ses principes • Un réseau coopératif… • où la libre contribution de chacun profite à tous • La langue française et la botanique comme dénominateur commun • Internet, un outil de communication et d’échange privilégié… • au service des personnes, des associations et des institutions Présentation : Jean-Pascal Milcent Atelier de travail ECOFOR « Base de données »
Projet e. Flore Constat Les membres du réseau Tela Botanica possédant des données botaniques : • Ils veulent les mettre en commun • Ils souhaitent en faire profiter les autres • Ils n’ont pas d’outils collectifs pour les gérer Atelier de travail ECOFOR « Base de données »
Projet e. Flore Problématique à résoudre • Comment collecter et interconnecter les données botaniques des membres du réseau Tela Botanica ? • Comment faciliter la consultation et la gestion de ces données via le Web ? Atelier de travail ECOFOR « Base de données »
Projet e. Flore Solution : le projet e. Flore • Une base de données unique Une interface de consultation en libre accès pour • Des outils pour collecter l’information en retour • • Des possibilités d’exportation en masse des données Une interface d’administration pour gérer • Des logiciels « libres » pour travailler en commun • permettre à tous d’accéder à l’information via Internet provenant du réseau l’interconnexion des données Atelier de travail ECOFOR « Base de données »
Projet e. Flore • Le projet e. Flore, ses outils : • Un forum de discussion propre au projet et des forums thématiques (nomenclature, noms vernaculaires…) • Des outils pour le travail collaboratif via le Web : • • • outils de gestion de projets espace pour déposer et télécharger des fichiers éditeur collaboratif en ligne (Wikini) Atelier de travail ECOFOR « Base de données »
Projet e. Flore Types de données intégrées dans e. Flore • • Données nomenclaturales Données taxinomiques (plusieurs projets) Données sur les auteurs (commun avec base herbiers) Noms vernaculaires (7 langues) Chorologie départementale Photos et illustrations Description des taxons et clés de détermination Atelier de travail ECOFOR « Base de données »
Projet e. Flore Couverture géographique du projet • • • La flore métropolitaine (Kerguélen, Bock…) Ile de la Réunion (CBN Mascarin) Guyane (IRD) Antilles (Jacques Fournet) Autres ? Couverture systématique : • • • Embryophytes Bryophytes Lichens ? Atelier de travail ECOFOR « Base de données »
Modèle e. Flore Les bases du modèle d’e. Flore : • Euro+Med • Modèles de Berendsohn (Muséum de Berlin) Les standards respectés par e. Flore : • Code International de Nomenclature Botanique • TDWG (pour chorologie, zones géo) • ISO (pour langues, pays) • INSEE (pour communes, départements, régions) Atelier de travail ECOFOR « Base de données »
Modèle e. Flore Les solutions techniques d’e. Flore : • • Conception du modèle : Dia et Te. Dia 2 SQL Base de données : My. SQL ou Postgre. SQL Intégration des données : Perl Interface de consultation : • • - en php, html et css (le minimum de Javascript) - abstraction des bases de données (PEAR) - export des données (Text, XML…) Interface d’administration : • • 1 er solution : idem interface consultation 2 eme solution : XUL (XML) Atelier de travail ECOFOR « Base de données »
Modèle e. Flore Le cœur du modèle : Un référentiel nomenclatural, mais des référentiels taxonomiques… - Gestion des relations entre les noms des taxons : référentiel nomenclatural - Attribution des noms et de leurs statuts aux taxons relatifs à un projet - Gestion des relations entre taxons relatifs à un projet : référentiels taxonomiques Atelier de travail ECOFOR « Base de données »
Modèle e. Flore Aperçu des relations entre modules du modèle Relations entre noms cœur Botanistes Nomenclature Publications Projets Sélection des noms Textes et images Personnes Chorologie Taxons relatifs Relations entre taxons Droits Zones géo Protections Noms vernaculaires Atelier de travail ECOFOR « Base de données » Langues
Projet e. Flore État d’avancement du projet • • • 1 : Définir les objectifs et besoins 2 : Analyser et référencer l’existant 3 : Réaliser le modèle et sa documentation 4 : Intégrer les données 5 : Développer une interface de consultation 6 : Développer une interface de gestion Atelier de travail ECOFOR « Base de données »
Projet e. Flore Autres bases Tela Botanica • • Base sur les herbiers de France : métadonnées, dans le cadre du projet Bio. CASE (MNHN) Base bibliographique : • • • Articles des revues botaniques (22 000 références) Livres et médias (avec la Garance Voyageuse) Fichier d’adresses : organismes, associations, etc. Atelier de travail ECOFOR « Base de données »
Projet e. Flore Pour participez au projet e. Flore, les liens utiles Documentation en ligne : http: //wiki. tela-botanica. org/eflore Fichiers : http: //www. tela-botanica. org/projets puis «Flore électronique» Forum : http: //fr. groups. yahoo. com/group/tb-eflore Atelier de travail ECOFOR « Base de données »
Projet e. Flore Organisation Coordinateurs du projet e. Flore Assurent le suivi et la cohérence Membres du projet e. Flore Utilisateurs Consultent et proposent des améliorations Aide à la mise en base de données Administration de la base Développement des interfaces Coordinateurs du projet nomenclature Données nomenclaturales Coordinateurs du projet phytosociologie Coordinateurs du projet X … Données phytosociologiques Autres projets… Atelier de travail ECOFOR « Base de données »
Projet e. Flore Qualification des données Référentiel nomenclatural • • Données objectives extraites de la littérature Validation par l’usage grâce aux retours des utilisateurs Référentiels taxinomiques • • • Pas de validation globale a priori : trop lourd, aspects subjectifs Validations ponctuelles de certaines familles par des spécialistes Qualification dans le cadre de projets : REFTAX (MNHN), « flore de France » , etc. Autres référentiels • Validation par l’usage grâce au réseau Dans tous les cas : une gestion rigoureuse des versions Atelier de travail ECOFOR « Base de données »
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