RESULTADOS DE LA OPERACIN DEL CLSTER HBRIDO DE

RESULTADOS DE LA OPERACIÓN DEL CLÚSTER HÍBRIDO DE SUPERCÓMPUTO “XIUHCOATL“

LANCAD Nodo Cinvestav: CLÚSTER HÍBRIDO DE SUPERCÓMPUTO “XIUHCOATL” • El pasado 25 de enero del 2012 la Coordinación General de Servicios de Tecnologías de la Información y Comunicaciones (CGSTIC) del CINVESTAV a cargo del Dr. Marino Gamboa Zúñiga, realizó el lanzamiento del Clúster Xiuhcoatl. • El nombre “XIUHCOATL” significa Serpiente de Fuego y su característica de ser Híbrido se debe a que incorpora tres diferentes tecnologías de procesamiento, las cuales son: – Tecnología de CPU INTEL Xeon X 5675 (six-core). – Tecnología de CPU AMD Opteron 6274 (16 -core). – Tecnología de GPGPU NVIDA Fermi (448 -cudacores).

LANCAD Clúster XIUHCOATL: “Serpiente de Fuego”

LANCAD Nodos Robustos. NODO ROBUSTO CINVESTAV CLÚSTER TECNOLOGÍA Xiuhcoatl HIBRIDA CORES CPU CUDA CORES • 3480 (CPU) 2304 (AMD) 1056 (INTEL) • 8960 (GPGPU‐FERMI) [20 Tarjetas] PERFORMANCE REAL (CPU) 24. 97 TF PERFORMANCE TEORICO AMD (20. 28 TF) INTEL (12. 93 TF) GPU (10. 3 TF) Total 43. 50 TF UAM Aitzaloa INTEL 2160 CPU 18. 49 TF 25. 44 TF UNAM Kanbalam AMD 1368 CPU 5. 09 TF 7. 07 TF 1 TERAFLOP = 10 12 OPERACIÓNes de punto flotante por segundo Nodo Cinvestav Nodo UNAM Nodo UAM Cada institución aporta 1000 cores de procesamiento sobre una red de fibra óptica de 10 Gb/s de mas de 100 km de

LANCAD Nodo Cinvestav: Misión Ofrecer y desarrollar servicios de cómputo de alto desempeño a las comunidades de usuarios de Supercómputo del CINVESTAV, UNAM, UAM y en general al sector académico, empresarial y gobierno, con el fin de impulsar el desarrollo científico, la formación de recursos humanos especializados en cómputo de alto desempeño así como el desarrollo tecnológico para realizar proyectos de alto impacto social y económico.

LANCAD Nodo Cinvestav: Capacidad de cómputo HORAS DE PROCESAMIENTO (Cores/Cuda‐C EN EL CLÚSTER XIUHCOATL AL AÑO. INTEL AMD 9, 250, 560 20, 183, 040 GPG 78, 48

LANCAD Nodo Cinvestav: Distribución LFS (OSS) (MDS/OSS) ABREVIATURA N. C. G SIGNIFICADO N. M. N. L. SW Infini. Band N. C. A. ABREVIATURA N. C. I. SIGNIFICADO N. C. I. Nodo de Computo INTEL N. C. A Nodo de Computo AMD N. C. G Nodo de Computo GPGPU LFS Lustre File System (Intel) N. M. Nodo Maestro (Intel) OSS Object Storage Server (Intel) N. L. Nodo de Login (Intel) MDS Meta Data Server (Intel)

LANCAD Nodo Cinvestav: Tecnologías GNU (gcc, fortran) COMPILADORES Intel Clúster Studio XE Open 64 ACML (AMD) 2012 CUDA SDK 4. 1. SISTEMA OPERATIVO Linux x 86_64 Cent. OS ver. 6. 2. HARDWARE CPU 3480 Cores *AMD (Interlagos 6274) (2304) *INTEL (Xeon® Processor X 5675) (1056) GPGPU 10 servidores INTEL • 120 Cores. • 20 Tarjetas NVIDIA • (Fermi 2070/2075) Capacidad de crecimiento 20 Tarjetas más. INTERCOMUNICACION Una red Giga bit Ethernet (Administración shell). Una red Giga bit Ethernet (Administración de Escritorio remoto). Una Red Infini. Band 40 Gb/s (Full-non-Blocking) SISTEMA DE ALMACENAMIENTO Dos sistemas 44 TB y 22 TB (Usables) Lustre File System • Discos duros de 600 GB, tecnología SAS 2. 0 de 15000 RPM en RAID 6. Capacidad de crecimiento para 120 TB.

TO TA LE S LANCAD Nodo Cinvestav: Numeralia No. De Tipo de Tecnología de Servidores Servidor Procesamiento 88 9 N. C. CPU INTEL N. C. G. CPU/GPU *4 GPU INTEL/NVIDIA Tarjetas GPUs #Cores CPU Memória Cuda-Cores RAM GPU (GB) STORAGE Local STORAGE Lustre (GB) (TB) 0 1056 0 2112 22000 36 108 *16128 432 4650 1 N. V. CPU/GPU INTEL /AMD 4 12 0 48 1200 72 N. C. CPU AMD 0 2304 0 4608 18000 170 36 3480 *16128 7200 65 Comunicaciones (Gb/s) 1 1 Performance Rmax Consumo eléctrico estimado (TF) (KW) Peso Total (Ton) 40 Ethernet Infini. Band (USABLES) (admón. ) QDR Escritorio Remoto 24. 97 70 4. 5 45350 *=Capacidad Máxima Soportada. N. C. = Nodos de Cómputo. N. C. G = Nodos de Cómputo GPU. N. V. = Nodo de Visualización.

LANCAD Nodo Cinvestav: Servicios ACADEMICO • Cómputo en Paralelo • Administración • Seguridad • Soporte • Capacitación en Supercómputo GUBERNAMENTA L • Hospedaje de Aplicaciones. • Almacenamiento de Datos. • Desarrollo de Aplicaciones • Capacitación Virtual. • Cloud. EMPRESARIAL • Renta de Servidores • Desarrollo de Aplicaciones • Capacitación Virtual. • Cloud.

RESULTADOS DE LA OPERACIÓN DEL CLÚSTER HÍBRIDO DE SUPERCÓMPUTO “XIUHCOATL“ PRIMERA CONVOCATORIA

LANCAD Nodo Cinvestav: Primera Convocatoria REQUISITOS PARA SOLICITUD DE RECURSOS • • Ser investigador del Cinvestav. Tener un proyecto que requiera de Supercómputo. Se da preferencia a proyectos donde se involucren alumnos del Cinvestav. Mandar Formato y Anexos firmados con los datos solicitados a: xiuhcoatl@cinvestav. mx FORMATOS ANEXOS • Datos del solicitante • Requerimientos de procesamiento ØHoras de CPU. ØHoras de GPU. ØNúmero de JOBS. • Requerimientos de hardware ØRam. ØEspacio en home. ØEspacio en scratch. • Requerimientos de software. ANEXO A: DESCRIPCION DEL PROYECTO • Nombre del proyecto • Objetivos • Resumen del proyecto • Lista de participantes: ØOtros investigadores ØEstudiantes ØAuxiliares ØEtc. • Plataformas y recursos utilizadas anteriormente para correr la aplicación • Beneficios esperados: ØPublicaciones ØParticipaciones en congresos ØFormación de recursos humanos ØOtros: patentes, etc. ANEXO B: EXPERIENCIA DEL SOLICITANTE • El solicitante deberá anexar su Currículum Vitae en el que al menos incluya: ØDescripción breve de su línea de trabajo ØProducción académica ØExperiencia en el uso de equipos de supercómputo.

LANCAD n e m i t i d o CUENTAS/SUBCUENTAS CREADAS p • 44 o r e l S HORAS TOTALES USADAS O C Lo • CPU m (AMD) I • 1, 419, 248 i • 982, 855 (INTEL) C t • GPU Té • 10, 549 (FERMI) Nodo Cinvestav: Primera Convocatoria U M D u. S El O t. SL i d. I HORAS TOTALES APROBADAS P i. C s. RI • 3, 060, 000 (APROBADAS en CPU) c. O T i • 13, 910, 400 (APROBADAS en GPU) V p. U E

LANCAD Nodo Cinvestav: Primera Convocatoria (Proyectos) INVESTIGADOR DEPARTAMENTO UNIDAD ALBERTO MARCIAL VELA AMIEVA QUIMICA ZACATENCO ANDREAS KÖSTER PATRIZIA CLAMINICI QUIMICA ZACATENCO LILIANA QUINTANAR VERA QUIMICA ZACATENCO FELIÚ DAVINO SAGOLS TRONCOSO MATEMATICAS ZACATENCO GABRIEL GUARNEROS PEÑA GENETICA Y BIOLOGIA MOLECULAR ZACATENCO JAIME GARCIA MENA GENETICA Y BIOLOGIA MOLECULAR ZACATENCO LANGEBIO NOMBRE DEL PROYECTO ESTRUCTURA ELECTRÓNICA Y MOLECULAR DE SISTEMAS DE INTERÉS BIOLÓGICO Y DESARROLLO, IMPLEMENTACIÓN Y VALIDACIÓN DE FUNCIONALES DE INTERCAMBIO‐CORRELACIÓN. DEVELOPMENT OF THE LCGTO‐DFT CODE DEMON 2 K MOLECULAR DYNAMIC SIMULATION OF COMPLEX SYSTEMS ESTUDIO DE LA QUÍMICA REDOX DE LOS COMPLEJOS DE COBRE CON EL FRAGMENTO 106‐‐‐ 115 DE LA PROTEÍNA PRION HUMANA CONSTRUCCIÓN DE DISEÑOS COMBINATORIOS, EVALUACIÓN DEL POLINOMIO TUTTE Y EL PROBLEMA DEL CUADRADO INSCRITO. GENÓMICA ESTRUCTURAL DE BACTERIÓFAGOS DE PSEUDOMONAS LABORATORIO DE REFERENCIA Y APOYO PARA LA CARACTERIZACIÓN DE GENOMAS, TRANSCRIPTOMAS Y MICROBIOMAS. ENSAMBLADO Y ANÁLISIS DE GENOMAS EUCARIOTES Y PROCARIOTES ANTIGUOS Y CONTEMPORÁNEOS RAFAEL MONTIEL DUARTE LANGEBIO JOSE TORRES JIMENEZ LAB. TECNOLOGIAS DE LA INFORMACION TAMAULIPAS CÁLCULO DE COVERING ARRAYS ARTURO DIAZ PEREZ LAB. TECNOLOGIAS DE LA INFORMACION TAMAULIPAS ESTRATEGIAS DE CÓMPUTO PARALELO EN MULTI/MANY‐CORES PARA EL PROCESAMIENTO EFICIENTE DE REDES COMPLEJAS. FELIPE ALEJANDRO CRUZ PEREZ INGENIERIA ELECTRICA ZACATENCO ANÁLISIS DE ESTRATEGIAS DE MANEJO DE RECURSOS ENSISTEMAS CON TRÁFICO DE VOIP TONATIUH MATOS FISICA ZACATENCO OBJETOS COMPACTOS Y MATERIA OBSCURA JESÚS CARLOS RUIZ SUAREZ FISICA MONTERREY SIMULACIÓN DE DINÁMICA MOLECULAR DE UNA MEMBRANA CELULAR MODELO EN PRESENCIA DE FÁRMACOS POLARES Y NO POLARES EN DIVERSAS CONDICIONES FISIOLÓGICAS. CRISTIAN FERNANDO MOUKARZEL FISICA MÉRIDA DISCOS GRANULARES SUAVEMENTE VIBRADOS CRISTIAN FERNANDO MOUKARZEL FISICA MÉRIDA DINÁMICA DE SISTEMAS ECONÓMICOS INTERACTUANTES RITO DANIEL OLGUIN MELO FISICA ZACATENCO JAIME SANTOYO SALAZAR FISICA ZACATENCO GABRIEL GUILLERMO PEREZ ANGEL FISICA MÉRIDA SIMULACIÓN COMPUTACIONAL DE FUERZAS DE VACIAMIENTO ENTRÓPICO EN MEZCLAS COLOIDALES. MARÍA CRISTINA VARGAS GONZALEZ FISICA MÉRIDA PARAMETRIZACIÓN DE UN CAMPO DE FUERZAS PARA EL ANTIFÚNGICO ANFOTERICINA B POR MÉTODOS ABINITIO MARÍA CRISTINA VARGAS GONZALEZ FISICA MÉRIDA RAFAEL BAQUERO PARRA FISICA ZACATENCO MAURICIO DEMETRIO CARBAJAL TINOCO FISICA ZACATENCO ESTUDIO DE LAS PROPIEDADES ÓPTICAS, ESTRUCTURALES Y ELECTRÓNICAS DE LOS COMPUESTOS SEMICONDUCTORES III‐VI ESTUDIO DE PROPIEDADES GEOMÉTRICAS, ENERGÉTICAS Y MAGNÉTICAS DE NANOPARTÍCULAS METÁLICAS UTILIZADAS PARA EL TRATAMIENTO DE CÁNCER SELECTIVIDAD IÓNICA DE NANOPOROS Y CANALES EN MEMBRANAS BIOLÓGICAS ESTUDIO DE PROPIEDADES ESTRUCTURALES, ELECTRÓNICAS Y MAGNÉTICAS EN COMPUESTOS, SUPERFICIES E INTERFACES DE ESTRUCTURAS METÁLICAS, SEMICONDUCTORAS Y SUPERCONDUCTORAS. ESTUDIO DE MATERIALES BIOLÓGICOS Y POLIMÉRICOS POR MEDIO DE SIMULACIONES NUMÉRICAS

LANCAD Nodo Cinvestav: Primera Convocatoria (USO) USO DE GPU POR DEPARTAMENTO LABORATORIO DE TECNLOGIAS DE INFORMACION QUIMICA Chart Title LABORATORIO DE TECNLOGIAS DE INFORMACION QUIMICA 2% FISICA MATEMATICA INGENIERIA ELECTRICA 28% 40% INGENIERIA ELECTRICA 98% LANGEBIO 0% 32% LANGEBIO GENETICA Y BIOLOGIA MOLECULAR USO DE GPU POR UNIDAD USO DE CPU POR UNIDAD 2% CIUDAD VICTORIA LANGEBIO MERIDA MONTERREY ZACATENCO 31% 61% 0% 98% 8% 1%

LANCAD Nodo Cinvestav: SISTEMA DE ALMACENAMIENTO LUSTRE USO DEL HOME LIBRE 96% USO DEL SCRATCH USADO 4% LIBRE 4% 81% 19% USADO 19%

LANCAD Nodo Cinvestav: MUESTRA REPRESENTATIVA DE USO DE CPU. USO CPU XIUHCOATL (SEM 14 -SEM 21) 1600 1400 1200 1000 800 600 400 200 0 14 15 16 17 18 19 20 21

RESULTADOS DE LA OPERACIÓN DEL CLÚSTER HÍBRIDO DE SUPERCÓMPUTO “XIUHCOATL“ SEGUNDA CONVOCATORIA

LANCAD Nodo Cinvestav: Segunda Convocatoria REQUISITOS PARA SOLICITUD DE RECURSOS • Requisitos adicionales a la primera convocatoria: FORMATOS • Datos de hasta dos cuentas adicionales • Requerimientos de procesamiento para todo el proyecto ØSe agregó el modo de calcular el tiempo solicitado.

LANCAD Nodo Cinvestav: Segunda Convocatoria LANZAMIENTO DE LA 2 da CONVOCATORIA EN XIUHCOATL SOLICITUDES/PROYECTOS ‐ 27 RECIBIDAS ‐ 27 ACEPTADAS El día 5 de Junio. SOLICTUDES PROVENIENTES DE 4 UNIDADES • ZACATENCO • MERIDA • TAMAULIPAS • IRAPUATO SOLICTUDES POR DEPARTAMENTOS DICTAMEN • FISICA ‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐ (16) • QUIMICA ‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐ (4) • L. T. I. ‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐ (2) • GENETICA Y BIOLOGIA MOLECULAR ‐‐‐‐‐‐ (1) • LANGEBIO ‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐ (1) • LABORATORIO DE GEOMICA EVOLUTIVA ‐ (1) • FISIOLOGIA , BIOFISICA Y NEUROCIENCIAS (1) • CGSTIC ‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐ (1) • El 16 de Julio se dio a conocer a los solicitantes, el resultado del dictamen. (12) (11) (2) CUENTAS/SUBCUENTAS CREADAS • 35 HORAS TOTALES 5, 200, 000. 00 (APROBADAS)

LANCAD Nodo Cinvestav: Segunda Convocatoria (Proyectos) INVESTIGADOR DEPARTAMENTO UNIDAD RAFAEL BAQUERO PARRA FISICA ZACATENCO PATRIZIA CALAMINICI CASTRO HERNANDEZ ROMERO DE COSS GÓMEZ QUIMICA FISICA APLICADA ROMERO DE COSS GÓMEZ MAURICIO DEMETRIO CARBAJAL TINOCO FISICA APLICADA LUIS JOSÉ DELAYE ARREDONDO ARTURO DÍAZ PÉREZ ANGELINA FLORES PARRA GABRIEL GUARNEROS PEÑA GERARDO HERRERA CORRAL MARIANO GAMBOA ZUÑIGA TONATIUH MATOS FISICA MERIDA FISICA MERIDA LUCIEN PETROVA VELEVA FISICA MERIDA GEONEL RODRIGUEZ GATTORNO FISICA MERIDA PABLO RUDOMIN JOSE TORRES JIMENEZ MAURICIO CARRILLO TRIPP MARIA CRISTINA VARGAS ALBERTO VELA AMIEVA ESTUDIO DE PROPIEDADES ESTRUCTURALES, ELECTRÓNICAS Y MAGNÉTICAS EN COMPUESTOS, SUPERFICIALES E INTERFACES DE ESTRUCTURAS METÁLICAS, SEMICONDUCTORAS Y SUPERCONDUCTORAS. ZACATENCO GEOMETRY OPTIMIZATION AND PROPERTY CALCULATIONS OF COMPLEX SYSTEMS. ZACATENCO NANOESTRUCTURAS Y SUS PROPIEDADES FISICAS EN PROCESOS AMBIENTALES. MERIDA ESTUDIO DE PRIMEROS PRINCIPIOS DEL MAGNETISMO DE BORDE Y DE VACANCIAS EN NANOFLAKES DE GRAFENO. ESTUDIO DE PRIMEROS PRINCIPIOS DE SOBRE PROPIEDADES ELECTRÓNICAS Y ÓPTICAS DE NANOESTRUCTURAS DE GRAFENO Y MERIDA NITRURO DE BORO. MERIDA ESTRUCTURA ELECTRÓNICA DE LA TRICAPA BN/GRAFENO/BN BAJO PRESIÓN. ZACATENCO ESTUDIO DE MATERIALES BIOLÓGICOS Y POLIMÉRICOS POR MEDIO DE SIMULACIONES NUMÉRICAS. LABORATORIO DE GENÓMICA DISEÑO E IMPLEMENTACIÓN DE UN MÉTODO PARA ALINEAMIENTO MÚLTIPLE DE SECUENCIAS GENÉTICAS A TRAVÉS DEL USO TAMAULIPAS EVOLUTIVA DE TÉCNICAS DE PROGRAMACIÓN PARALELA, MÉTODOS HEURÍSTICOS Y PROGRAMACIÓN DINAMICA. L. . T. I TAMAULIPAS ESTRATEGIAS DE CÓMPUTO PARALELO EN MULTI/MANY‐CORES PARA EL PROCESAMIENTO EFICIENTE DE REDES COMPLEJAS ESTUDIO TEÓRICO DE LA NATURALEZA DE ENLACES DÉBILES EN MOLÉCULAS DE INTERÉS BIOLÓGICO Y COMPLEJOS METÁLICOS QUIMICA ZACATENCO DEL GRUPO REPRESENTATIVO. GENÉTICA Y BIOLOGÍA ZACATENCO GENÓMICA ESTRUCTURAL DE BACTERIÓFAGOS DE PSEUDOMONAS AERUGINOSA. MOLECULAR ZACATENCO RECONOCIMIENTO Y CLASIFICACIÓN DE MICRO CALCIFICACIONES, EN MAMOGRAFÍAS MEDIANTE TÉCNICAS DE RP Y FISICA PROCESAMIENTO DIGITAL DE IMÁGENES. CGSTIC ZACATENCO COMPUTO DE ALTO DESEMPEÑO Y CALCULO DE ESTRUCTURA ELECTRONICA DE NANOTUBOS DE CARBONO GABRIEL MERINO CRISTIAN MOUKARZEL LILIANA QUINTANAR VERA NOMBRE DEL PROYECTO QUIMICA NEUROFISIOLOGIA NEOROCOMPUTACION L. T. I. LANGEBIO FISICA MERIDA QUIMICA ZACATENCO COSMOLOGÍA Y ASTROFISICA RELATIVISTA: OBJETOS COMPACTOS Y MATERIA OBSCURA_2. MERIDA AROMATICIDAD Y EL DISEÑO DE NUEVOS CÚMULOS METÁLICOS. DINAMICA DE SISTEMAS ECONOMICOS INTERACTUANTES. DISCOS GRANULARES SUAVEMENTE VIBRADOS. ASPECTOS FISICOQUIMICOS DE PROTECCION DE METALES CON AZOLES COMO INHIBIDORES VOLATILES DE CORROSION ‐ MERIDA SILUACION MOLECULAR COMPUTACIONAL. MERIDA CATALIZADORES PARA GENERACION DE HIDROGENO POR FOSILES DE AGUA. ESTUDIO DE LA INTERACCION DE COBRE CON PROTEINAS AMILOIDOGENICAS ASOCIADAS A ENFERMEDADES ZACATENCO NEURODEGERATIVAS. ZACATENCO TALLER MULTIDISCIPLARION EN EL CINVESTAV No. ORD. 4/2011 Conacyt. TAMAULIPAS CALCULO DE COVERINGS ARRAYS. IRAPUATO ANALISIS MOLECULAR DE LOS MECANISMOS DE ACCION DE ANTIBIOTICOS MERIDA TIEMPOS DE CRISTALIZACION Y POLIDISPERSIDAD EN UN FLUIDO DE ESFERAS DURAS. MERIDA PARAMETRIZACION DE UN CAMPO DE FUERZAS PARA EL ANTIFUNGICO ANFOTERICINA B POR METODOS AB‐INITIO. MERIDA SELECTIVIDAD IONICA DE NANOPOROS Y CANALES EN MEMBRANAS BIOLOGICAS. ESTRUCTURA ELECTRONICA Y MOLECULAR DE SISTEMAS DE INTERES BIOLOGICO Y DESARROLLO, IMPLEMENTACION Y ZACATENCO VALIDACION DE FUNCIONALES DE INTERCAMBIO‐CORRELACION

LANCAD Nodo Cinvestav: Segunda Convocatoria (USO) USO DE CPU POR UNIDAD 10% USO DE CPU POR DEPARTAMENTO TAMAULIPAS 7% 0% 30% 59% ZACATENCO MERIDA 34% 60% LABORATORIO DE TECNLOGIAS DE INFORMACION FISICA GENETICA y BIOLOGIA MOLECULAR QUIMICA

LANCAD Nodo Cinvestav: MUESTRA REPRESENTATIVA DE USO DE CPU EN XIUHCOATL SEM (32 -34) 2000 1800 1600 1400 1200 1000 800 600 400 200 41138 41137 41136 41135 41134 41133 41132 41131 41130 41129 0

LANCAD Nodo Cinvestav: SISTEMA DE ALMACENAMIENTO LUSTRE USO DEL HOME LIBRE 95% USO DEL SCRATCH USADO 4% LIBRE 5% 80% 19% USADO 20%

RESULTADOS DE LA OPERACIÓN DEL CLÚSTER HÍBRIDO DE SUPERCÓMPUTO “XIUHCOATL“ RESUMEN DE LAS CONVOCATORIAS 1 Y 2

LANCAD Nodo Cinvestav: Resumen de Convocatorias SOLICITUDES/PROYECTOS -49 -50 (APROBADAS) (RECIBIDAS) SOLICTUDES PROVENIENTES DE 5 UNIDADES • ZACATENCO • MERIDA • TAMAULIPAS • IRAPUATO • MONTERREY (25) (16) (4) (3) (1) SOLICTUDES POR DEPARTAMENTOS • FISICA ‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐ (27) • QUIMICA ‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐ (8) • L. T. I. ‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐ (4) • GENETICA Y BIOLOGIA MOLECULAR ‐‐‐‐‐‐ (3) • LANGEBIO ‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐ (2) • LABORATORIO DE GEOMICA EVOLUTIVA ‐ (1) • FISIOLOGIA , BIOFISICA Y NEUROCIENCIAS (1) • CGSTIC ‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐ (1) • MATEMATICAS ‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐ (1) • INGENIERIA ELECTRICA ‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐‐ (1) DICTAMEN • El 16 de Julio se dio a conocer a los solicitantes , el resultado del dictamen. CUENTAS/SUBCUENTAS CREADAS • 79 HORAS TOTALES 8, 260, 000 (APROBADAS) 2, 934, 709 (UTILIZADAS AL 16 DE AGOSTO)

LANCAD Nodo Cinvestav: (USO TOTAL DE CPU Y GPU) USO TOTAL DE CPU AL DIA 16 de AGOSTO DE 2012 POR DEPARTAMENTO USO TOTAL DE GPU AL DIA 16 de AGOSTO DE 2012 POR DEPARTAMENTO LABORATORIO DE TECNLOGIAS 0% 2% DE INFORMACION 0% 0% QUIMICA FISICA 29% 43% MATEMATICA 98% INGENIERIA ELECTRICA MATEMATICA INGENIERIA ELECTRICA 28% LANGEBIO GENETICA Y BIOLOGIA MOLECULAR USO TOTAL DE GPU AL DIA 16 DE AGOSTO DE 2012 POR 2% UNIDAD 98% LABORATORIO DE TECNLOGIAS DE INFORMACION 0% QUIMICA TAMAULIPAS IRAPUATO MERIDA MONTERREY ZACATENCO USO TOTAL DE CPU AL DIA 16 DE AGOSTO DE 2012 POR UNIDAD 36% 55% 1% 8% 0% TAMAULIPAS IRAPUATO MERIDA MONTERREY ZACATENCO

LANCAD Nodo Cinvestav: Aplicaciones Instaladas APLICACIONES abinit bwa clisp clustalw‐ 2. 0. 10 de. Mon Espresso g 03 Gadget‐ 2 Games Gromacs I‐TASSER igraph MAXIMA Muscle‐ 3. 7 NAMD_2. 8‐GPU Newbler nwchem OACTAVE orca_x 86_64_exe_r 2360 Parallel‐TCoffee Polybori TCOFFE velvet Wien 2 k Yambo Zeusmp 7 APLICACIONES PROPIAS ADF Cactus‐Codes SIESTA Terachem VASP (En proceso) (En Proceso) (En proceso)

LABORATORIO NACIONAL DE COMPUTO DE ALTO DESEMPEÑO (LANCAD) “NODO CINVESTAV” CONVOCATORIA EXTERNA

LANCAD Nodo Cinvestav: Primera Convocatoria para instituciones externas. REQUISITOS PARA SOLICITUD DE RECURSOS • Requisitos similares a la segunda convocatoria + CONVENIO • Se firmará un convenio que efectuarán las dos partes, el CINVESTAV y la institución interesada en usar tiempo de CPU. http: //clusterhibrido. cinvestav. mx/

LABORATORIO NACIONAL DE COMPUTO DE ALTO DESEMPEÑO (LANCAD) SEGUNDA PARTE

LANCAD Objetivo General La consolidación y mantenimiento al día, a través del tiempo, de un Laboratorio Nacional de Cómputo de Alto Desempeño, que permita resolver en primera instancia los problemas científicos más demandantes mediante una GRID de capacidades excepcionales en la zona metropolitana de la Ciudad de México conformada por las tres instituciones académicas de mayor importancia en el cómputo científico de alto desempeño. Nodo Cinvestav Xiuhcoatl (24. 97 TF) Nodo UNAM Kanbalam (5. 07 TF) Nodo UAM Aitzaloa (18. 49 TF)

LANCAD La red de FO dentro del Metro. Rack con empalme por fusión Rack con empalme mecánico Longitud total de la red de fibra óptica 108. 4 km

LANCAD Segunda Parte: Desarrollo Científico El Cómputo de Alto Desempeño es indispensable, en la actualidad, para la realización de proyectos científicos y tecnológicos en temas relacionados con, entre otros: Ingeniería molecular Biomedicina Imagenología médica Materiales Astronomía Robótica Modelación matemática Energía Diseño y automatización de procesos Contaminación ambiental Nanotecnología Aeronáutica Estudios climáticos Genómica Sísmica

LANCAD Segunda Parte: Desarrollo Científico Cadena de valor Educación superior Investigación científica Desarrollo tecnológico Innovación Una plataforma competitiva de Cómputo de Alto Desempeño posibilita el desarrollo de esta cadena de valor. Una plataforma no competitiva de Cómputo de Alto Desempeño, compromete, fuertemente, las posibilidades de desarrollo de esta cadena de valor.

LANCAD Segunda parte: evolución del TOP 500

LANCAD Segunda parte: Escenarios de inversión anual EL PROYECTO FUE PRESENTADO Y APROBADO POR EL CONACy. T

XIUHCOATL PROYECCION DE CRECIMIENTO

LANCAD Nodo Cinvestav: Proyección de Crecimiento OBJETIVO: • Lograr alcanzar un performance real de al menos 90 TF, incrementando la capacidad: – De procesamiento CPU. – Del número de tarjetas GPGPU. – De puertos Infiniband QDR/FDR. • Incrementar la capacidad del Sistema de Almacenamiento Lustre. • Incrementar la capacidad de memoria RAM en algunos servidores.

LANCAD Nodo Cinvestav: Proyección de Crecimiento EL PERFORMANCE ACTUAL DE XIUHCOATL ES DE 24. 74 TF REALES SE REQUIERE AUMENTAR LA CAPACIDAD DE PROCESAMIENT O PARA LOGRAR ALMENOS 90 TF REALES ESTE CRECIMIENTO SE PUEDE ALCANZAR USANDO: -TECNOLOGÍA AMD. -TECNOLOGÍA NTEL. La nueva tecnología de procesadores Intel, es capaz de realizar hasta 8 OPERACIÓNes de punto flotante por ciclo de reloj. UN SERVIDOR EN LA ULTIMA TECNOLOGÍA DE CPU INTEL CON UN TOTAL DE 16 CORES A 2. 6 GHz PROVEE UN PERFORMANCE: -TEÓRICO DE 332. 8 GFLOP/S. UN SERVIDOR EN LA ULTIMA TECNOLOGÍA DE AMD CON UN TOTAL DE 16 CORES A 2. 5 GHz PROVEE UN PERFORMANCE: -TEÓRICO DE 320 GFLOP/S. -REAL DE 300 GFLOP/S. -REAL DE 256 GFLOP/S. La nueva tecnología de procesadores AMD, es capaz de realizar hasta 4 OPERACIÓNes de punto flotante por ciclo de reloj.

LANCAD Nodo Cinvestav: Proyección de Crecimiento PASOS A REALIZAR PARA LA ACTUALIZACIÓN DE AL MENOS 90 TF Se requiere de Para abatir la disipación un nuevo SW alrededor de de calor se requiere de Definir la Evaluar las IB para 10 Racks de aproximadamente 90 TR Instalar un tecnología con modalidades interconectar footprint extras. la que se que beneficien nuevo Centro con el actual e adicional, para realizará el el consumo Ó de Datos. incrementar el el alojamiento crecimiento. energético. (Una combinación con número de del nuevo sistemas In‐Row, etc. ). puertos. equipo. La arquitectura y diseño con que se proyectó el CLÚSTER Xiuhcoatl, permite incrementar el número de puertos Infini. Band hasta en 1296 puertos (actualmente hay 324 puertos), y en esta primera etapa de crecimiento, en términos de núcleos de procesamiento se podrá crecer hasta más de una decena de Miles de núcleos con el mismo CLÚSTER.

Chi…. . que • La palabra chocolate viene del náhuatl: Xocolatl( se debería pronunciar como shocolatl, que es el sonido sh de la x ) • Xiuhcoatl, se pronuncia entonces shiuhcoatl o de plano Chiuhcoatl!

RESULTADOS DE LA OPERACIÓN DEL CLÚSTER HÍBRIDO DE SUPERCÓMPUTO “XIUHCOATL“