Restitution runion b TB 19 juin 2019 Rappel

Restitution réunion b. TB 19 juin 2019 Rappel objectifs RFSA 31 mars 2020

Pourquoi une journée de réflexion sur la b. TB entre équipes françaises? q Recenser au niveau national les différentes expertises présentes q Identifier les questions scientifiques clé à résoudre pour atteindre l’objectif d’éradication en France q Coordonner les recherches existantes autour de questions communes v. En France : déjà fait dans le GT du RFSA v. Europe : avec compétences complémentaires à celle présentes en France. RFSA 31 mars 2020

Une première réunion…. . Des acteurs essentiels à inviter pour une prochaine (ministères, dispositifs de surveillance existants etc…)

Déroulé de la réunion q Matinée : présentations v Attentes de l’INRA et de l’ANSES v Dispositifs expérimentaux et plateformes domaine de la TB v Equipes compétences et forces q Après-midi deux ateliers q Livrables v Priorités questions de recherche v Liste des partenaires et incontournables pour le réseau • France • Europe q Voies de « lobbying » et contacts q Propositions d’animation du groupe RFSA 31 mars 2020

« Main Knowledge Gaps » Propositions aux deux ateliers « Du côté de l’hôte » « Du côté du pathogène » RFSA 31 mars 2020

«Hôte » le bovin se nourrir des immunologistes TB humaine q Diagnostic de la b. TB v Spécificité, cross réactions, v Cas index ? Latence versus shedding et contamination v Quels apports de nouvelles méthodologies? (exemple métabolomique) v q Physiopathologie v Rôle de l’immunité innée ? Élimination avant une signature immunitaire (TST positive) est-elle possible ? v Voies de transmission ? v Influence de la génétique de l’hôte sur ces étapes (et voies pour la sélection d’animaux résistants) v Contrôle par la vaccination ? Faune sauvage? v Quel(s) modèle(s) ? RFSA 31 mars 2020

« Le pathogène » les communautés de pathogènes et leur environnement q Souches de Mb v Epidémiologie v Analyse génomique, clusterisation, gènes de virulence v Spécialisation versus multi- hôtes v Facteurs de virulence (phénotypage patho-adaptation évolution) q Environnement v Réservoirs ? Rôle des amibes ? v Rôle de la faune sauvage dans la virulence et la circulation des souches ? v Survie environnementale de M. bovis et évaluation du risque de transmission v Dynamique de transmission intra et inter troupeaux RFSA 31 mars 2020

«Hôte » q Meilleur dépistage (robustesse, sensibilité, spécificité) meilleur diagnostic q Des manques de définition/caractérisation v Latence, v. Différents états cliniques v. Catégorisation des animaux ? • Excréteurs ? Latence ? q Lien de ces états avec la nature de la réponse immunitaire v. Quelles cytokines? Quels autres types de marqueurs ? v. IFN-g: • est-ce utile? • Est-ce le meilleur marqueur?

« Hôte » q Modèles animaux nouveaux pertinents (exemple furet) q Développement de nouveaux outils et nouvelles approches pour aide au diagnostic v Métabolomique v Imagerie médicale (aide à la détection/caractérisation des lésions) v Génétique bovine et immunité innée q Vaccination faune sauvage (dans le but de maitriser la contamination des troupeaux bovins)

« Pathogène » q Séquençage haut débit q Epidémiologie v bases de données v pipeline bioinfo, v outils de diagnostic matrices complexes q Identification des facteurs de virulence et compréhension du niveau de spécificité d’hôte q Ingénierie écologique des mycobactéries v Biodiversité des organismes micro, meso, macrofaune v environnements sols eaux … q Outils de management pour limiter la transmission v environnement faune sauvage (gestion des effluents d’élevage v outils de détection, de quantification et de caractérisation du risque de transmission, dans des matrices complexes

Conclusions q Besoin de coordination v En France v. En Europe q Pérenniser le réseau v. Et inviter les acteurs absents lors de cette premère • Acteurs de la TB humaine: équipes de grande renommée en France : concept One Health à renforcer • Acteurs de terrain, besoin d’actions concrètes pour aider la surveillance (DGAL, ONCF etc…) RFSA 31 mars 2020

Que s’est il passé depuis? q Diffusion au RFSA v Discussion de ce jour q Accord de principe du bureau de la SFM v En plus de « Mycoclub » et « Myco. Med » : créer un « Myco. Vet » vers le « Myc. OH » v Bureau proposé à la SFM (BD, MLB, NW, ) • attente de retour q En préparation : réponse à AAP ICRAD (ERANET) v ANSES, INRAE, FLI, IREC (+ UK/Collab) • Le granulome à Mb • Coordination S. Lesellier RFSA 31 mars 2020

Les poursuite du GT tuberculose du RFSA q Conduite des travaux de recherche dans les différentes équipes bénéficiaires des financement DGAl en 2017 • Suite à appel à projet de 2016 q Restitution périodique au Groupe de suivi de la plateforme ESA • Réuni une à deux fois par an depuis RFSA 31 mars 2020

Travaux conduits et restitués depuis 2016 q q q q Evaluation quantitative des valeurs prédictives (positives et négatives) de la surveillance de la tuberculose dans la faune sauvage en France (article) Elevages foyers de tuberculose bovine ayant fait l’objet d’un assainissement par abattage partiel depuis son autorisation sur tout le territoire national en 2014 : typologie des élevages concernés, étude de l’efficacité du dispositif [Projet : SELECTUB] Analyse des freins épidémiologiques, économiques et sociaux à l’éradication de la tuberculose bovine en France (Projet ERASURV) (3 articles) Identification et évaluation de la performance d’indicateurs de risque de tuberculose en élevage bovin en vue de définir une surveillance basée sur le risque Développement d’un modèle expérimental infectieux TB chez le furet Epidémiologie et pathologie de la TB chez le Renard (article) Pratiques et modèles décisionnels mis en œuvre par les vétérinaires sanitaires lors du dépistage de la TB en élevage (article) Validation d’une méthode alternative de lecture de l’intradermotuberculination comparative à J 3 lors du dépistage de la TB (article) Risque structurel de transmission de la tuberculose par contact sur les pâtures entre bovins d’élevages différents Cartographie des zones de cohabitation entre bovins et espèces sauvages à l’échelle nationale et application à la surveillance de la TB dans la faune sauvage (article) Mise au point d’outils d’épidémiologie génomique pour la reconstitution de chaînes de transmission de M. bovis entre animaux domestiques et sauvages à l’échelle nationale (article) Tuberculose bovine chez les blaireaux Estimation de la taille des groupes de Blaireaux sur différents territoires en France : l'apport des analyses génétiques Recherche des voies d’excrétion de M. bovis chez les blaireaux en France (article et avis) Vaccination des blaireaux contre la tuberculose : premiers tests dedéploiement d’appâts (futurs supports de vaccins oraux) à une échelle opérationnelle (article) Mise au point d’une méthode estimant le risque de fréquentation des pâtures par la faune sauvage (FS) au sein des zones infectées de TB RFSA 31 mars 2020

Conclusion q Poursuite de la coordination et des travaux au plan « one health » et européen v. SFM… vréponse à AAP ICRAD… q Nouvel appel à projet pour les besoins de la DGAL pour la France? v. RFSA? RFSA 31 mars 2020