Quanti geni sono espressi 10 15 mila geni

Quanto sono espressi i geni? • Un centinaio di m. RNA sono abbondanti: 1000

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006

Più della metà dei geni di lievito non sono indispensabili • Geni ridondanti (famiglie

Le famiglie geniche contengono più geni di quanto prevedibile dall’analisi delle proteine

Pseudogeni = geni non funzionali • Con introni (duplicati) • Maturati (processati)

I geni delle globine hanno stessa struttura

Famiglia dei geni della globina nell’uomo

Siti di sostituzione e siti silenti. Val. Cys. Leu. Ala. Pro. . GTG. TGT.

Divergenza di due geni (rp. L 4) separati da 30 milioni di anni (solo

Evoluzione della famiglia genica delle globine

Organizzazione delle unità di ripetizione dei geni per gli istoni in diverse specie

Tutti i genomi contengono copie multiple dei geni per l’r. RNA e per i

I geni per gli r. RNA sono ripetuti in tandem nei genomi eucariotici RNA

I precursori degli r. RNA sono più lunghi della somma dei due r. RNA

I precursori degli r. RNA subiscono maturazione

I geni per gli r. RNA sono ripetuti in tandem nei genomi eucariotici NTS

Genomi degli organelli • DNA circolare • Dimensioni variabili • Copie multiple del genoma

Caratteristiche dei genomi mitocondriali

Il DNA è altamente compattato in tutti gli organismi mm= Lewin, IL GENE VIII,

Quoziente di compattamento (rapporto di impacchettamento) rapporto tra la lunghezza del DNA e la

Concentrazione del DNA negli organismi • Fago T 4 = 500 mg/ml • Batteri

Costruzione di un capside • Il rivestimento proteico si assembla intorno all’acido nucleico •

E. coli contiene varie proteine che legano il DNA

Cromatina • Eucromatina: geni espressi (non tutti) • Eterocromatina: costitutiva (satellite) facoltativa (cromosoma X)

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Quanti geni sono espressi? • 10 -15 mila geni sono espressi in ciascuna cellula • 90% in comune tra i vari tessuti

Quanto sono espressi i geni? • Un centinaio di m. RNA sono abbondanti: 1000 -10000 copie/cellula (50% dell’m. RNA totale) • Il resto (10 000) sono m. RNA scarsi: meno di 10 copie/cellula

Quanti geni sono indispensabili?

Più della metà dei geni di lievito non sono indispensabili • Geni ridondanti (famiglie geniche) • Funzioni accessorie

Le famiglie geniche contengono più geni di quanto prevedibile dall’analisi delle proteine

Numero di geni nelle famiglie geniche

Pseudogeni = geni non funzionali • Con introni (duplicati) • Maturati (processati)

Origine degli pseudogeni

I geni delle globine hanno stessa struttura

Famiglia dei geni della globina nell’uomo

Siti di sostituzione e siti silenti. Val. Cys. Leu. Ala. Pro. . GTG. TGT. CTA. GCT. CCA. . GTG. TGT. CGA. GCT. CCA. . Val. Cys. Arg. Ala. Pro. . Val. Cys. Leu. Ala. Pro. . GTG. TGT. CTA. GCT. CCA. . GTG. TGT. CTT. GCT. CCA. . Val. Cys. Leu. Ala. Pro.

Divergenza di due geni (rp. L 4) separati da 30 milioni di anni (solo regione codificante)

Evoluzione della famiglia genica delle globine

Famiglia genica dei geni Hox

Organizzazione delle unità di ripetizione dei geni per gli istoni in diverse specie

Tutti i genomi contengono copie multiple dei geni per l’r. RNA e per i t. RNA

I geni per gli r. RNA sono ripetuti in tandem nei genomi eucariotici RNA DNA DNA other repetitive elements 60/81 bp repeats spacer promoter gene promoter

I precursori degli r. RNA sono più lunghi della somma dei due r. RNA maturi

I precursori degli r. RNA subiscono maturazione

I geni per gli r. RNA sono ripetuti in tandem nei genomi eucariotici NTS ETS 18 S 28 S ITS RNA DNA DNA other repetitive elements 60/81 bp repeats spacer promoter gene promoter

Genomi degli organelli • DNA circolare • Dimensioni variabili • Copie multiple del genoma in ogni organello (5 -10) • Numero variabile (1000 -100000)

Caratteristiche dei genomi mitocondriali

Genoma mitocondriale di mammifero

Quoziente di compattamento (rapporto di impacchettamento) rapporto tra la lunghezza del DNA e la lunghezza dell’unità che lo contiene. per es. il più piccolo cromosoma umano: cromosoma mitotico = 2 mm DNA 4, 6 x 107 bp = 1, 4 cm quoziente di compattamento = 7000

Concentrazione del DNA negli organismi • Fago T 4 = 500 mg/ml • Batteri = 10 mg/ml • Nucleo eucarioti = 100 mg/ml

Costruzione di un capside • Il rivestimento proteico si assembla intorno all’acido nucleico • L’acido nucleico viene inserito dopo che il capside si è formato

Assemblaggio del fago lambda

E. coli contiene varie proteine che legano il DNA

Cromatina • Eucromatina: geni espressi (non tutti) • Eterocromatina: costitutiva (satellite) facoltativa (cromosoma X)