Programa do curso BMP 5748 Parasitologia molecular 2007

Programa do curso BMP 5748 Parasitologia molecular 2007 12. 9. 1. Introdução na replicação de DNA (Genes 8, capitulo 14, 387 -414) em eucariotos Unidades de replicação extracromossomais em protozoários 2. Minicircles do kinetoplastideo (Int. J. for Parasitol. (2001) 31, 453 -458) 3. Mitocôndrios (EMBO J. (1996), 15(3) 684 f. ) 4. Apicoplasto de apicomplexa (Mol Bioch. Parasitol. 139, 99 -106) 17. 9. Telômeros e Telomerase em protozoarios 1. Telomerase in Leishmania (Cano et al. PNAS 1999, 96, 3616 f) 2. Atividade Telomerase in Plasmodium (NAR (2005) 33, 1111 f) 3. Recombinação de Telômeros (Nature (2000) 407, 1018 f) aqui tem um review legal: Review 19. 9. Genomics Genomas: Prerequisitos e procedimento de um projeto genoma 1. Plasmodium falciparum 2. Leishmania major genome 3. Data mining: procura de fatores de transcrição em genomas difíceis: Coulson et al. 2004/Callebaut et al. 2005

24. 9. Splicing em eucariotos (Genes 8 capitulo 24, 697 -725) Aspectos da transcrição em protozoários Trans-splicing em trypanosomatideos 2 Murphy et al. (Cell 47, 517 -525) 3 RNA editing Rob Benne (Cell 46, 819 -826) Estes volumes tem que ser retirados na biblioteca do IB/Química, não tem no ICB) 4 RNA editing review K. Stuart et al. (Phil Trans R. Soc Lond B 357, 71 -79) 26. 9. Transcrição Promtores e fatores em eucariotos (genes 8, cap 21, 597 -626) 1. Transcricao em Trypanosomatideos (Palenchar & Bellofatto 2006) 2. Transcriptoma Schistosoma mansoni 3. Transcriptoma P. falciparum 4. Os sites: Plasmo. DB/Leishmania e Trypanosoma. DB (www. plasmo. DB. org, http: //www. genedb. org/genedb/leish/index. jsp e http: //www. tigr. org/tdb/mdb/tcdb/

1. 10. Transcrição de famílias multigénicas I 1. Transcrição em procariotos e eucariotos (genes 8 cap. 9) 2. Transcrição de genes var em P falciparum (Scherf et al. 1998) 3. Transcrição de genes var em P falciparum - update (Kyes et al. 2007) 4. Transcrição de VSP de Giardia lamblia (Mol. Microbiol. (1998), 30, 979 -989) 3. 10. Transcrição de familias multigenicas II 1. Modo de transcrição de genes vir (Fernandez-Becerra et al. 2005) 2. Transcrição de genes VSG in T. brucei (Navarro, Nature (2001) 414, 759 f) 3. Controle pós-transcripcional: P-bodies em Plasmodium (Mair et al. 2006) 8. 10. Manipulando parasitas: Transfecção 1. Review Christine Clayton (Parasitology Today 1999) 2. Tecnologia e princípios da transfecção em Plasmodium (Waterkeyn et al. 1999), Acelerando transfecção (O'Donnell et al. ) 3. Transfecção por double crossover em Plasmodium (Duraisingh et al. 2002)/Novo sistema de vetores (Tonkin et al. 2004) 10. Manipulando a expressão gênica: RNAi em parasitas 1. O início: O modelo de C. elegans (Fire et al. 1998) 2. T. brucei (Wang/Englund 2001) 3. RNAi em Schistosoma japonicum

15. 10. Manipulando parasitas: transcrição condicional por sistemas induzíveis 1. Toxoplasma gondii (Meissner et al. , Science 2002) 2. P. falciparum (Meissner et al. 2005, PNAS) 3. Subramaniam et al. (genome wide RNAi em T. brucei) 17. 10. Epigenetics: Controle génica e estrutura de cromatina. Introdução Genes 8 capitulo 23 p 657 -683 1. P. falciparum: Duraisingh et al. 2005 Cell/6/7. abril 2. O link com RNAi: modelo Schizosaccharomyces pombe Hall et al. 2002 3. Epigenetics in apicomplexan parasites T. gondii: Gissot et al. 2007 Discussão sobre o desempenho do curso 22. 10. Exame, 14. 00 na sala Samuel Pessoa

Estrutura das apresentações: - Vista a camisa do autor do estudo - Mencione o objetivo (o “por que” do estudo) - Entre em detalhes da metodologia conforme necessário (checar feedback do curso) - aponta no slide quando mais esclarecimentos são necessários (discussão de um ponto especifico, informação background) - utilize as imagens do artigo em questão, mas adicione slides com modelos/procedimentos caso necessário

-Descobrir o mecanismo da exclusão alelica na transcrição de genes var em P. falciparum - mediante analise da transcrição de genes var em nivel subnuclear

Metodos Plasmideos de transfecção Real time PCR FISH RNA-FISH Cy 5 núcleo Microscopia confocal