Pklad mezimolekulrnch interakc transkripn faktory Transkripn faktor je

Příklad mezimolekulárních interakcí: transkripční faktory Transkripční faktor je protein, který má schopnost spouštět či jinak regulovat transkripci DNA Zahrnuje proto jak specializované proteiny spouštějící transkripci u konkrétních genů, tak i obecné faktory nutné pro správný průběh procesu transkripce. (Wikipedia) Příklad transkripční faktor NF-Y váže se specificky na sekvenci CCAAT, přítomnou v mnohých promoterech (sekvencích DNA na začátku genu). NF-Y má 3 části: NF-YB a NF-YC, tvoří dimer, který rozpoznává povrch DNA bez specificity pro určitou sekvenci NF-YA, část tvořící specifické kontakty se sekvencí CCAAT

specifické kontakty zóna nespecifických kontaktů

V tomto obrázku je protein znázorněn „Conollyho povrchem“ vybarveným podle elektrostatického potenciálu. Modrá: pozitivní potenciál. Červená: negativní potenciál. Nespecifické kontakty jsou převážně elektrostatické, mezi pozitivně nabitými aminokyselinami a negativně nabitými fosfáty.

nespecifické kontakty

specifické kontakty Hydrofobní kontakt Phe 289 Deoxyribóza A 10 vodíkový můstek (Arg)NH 2…. O 5‘(Cytidin 8) vodíkový můstek (Arg)NH 2…. N 3(Adenin 10)

DNA-mimic proteins: některé organizmy, např. viry, vyvinuly proteiny, které napodobují svým povrchem povrch DNA. Např. bakteriofág T 7 po infekci bakterie exprimuje protein Ocr (Overcome classical restriction). Ten „napodobuje“ dvojitou šroubovici DNA, přičemž fosfátová páteř je napodobená negativně nabitými aminokyselinami (Asp, Glu). Endonukleáza-enzym hostitele (bakterie), který rozpozná cizí DNA a rozštěpí ji na fragmenty, je zablokována Ocr, který se na ni váže s ještě větší afinitou než DNA, a stane se neúčinnou. Modrá: pozitivní potenciál. Červená: negativní potenciál.

Diskuse k cvičení z 25. 9. 2014 Double bonds decrease intermolecular adhesion lower the melting point

Cvičení 1. The characteristic odor of pineapple is due to ethyl butyrate, a compound containing carbon, hydrogen, and oxygen. Combustion of 2. 78 g of ethyl butyrate leads to formation of 6. 32 g of CO 2 and 2. 58 g of H 2 O. The properties of the compound suggest that the molar mass should be between 120 and 130. What is the molecular formula? 2. Napište rovnice pro spalování n-oktanu a) v podmínkách dokonalého spalování (na CO 2 a H 2 O) b) v podmínkách nedokonalého spalování, při kterých vzniká stejný počet molů CO 2 a CO