Nurul wiqoyah Taxonomy dan Klasifikasi Taxonomy Pengaturan spesies

Nurul wiqoyah

• Taxonomy dan Klasifikasi • Taxonomy. Pengaturan spesies ke dalam kelompok tertentu klasifikasi Sistem phenetik: hubungan evolusioner Sequence 16 s r. RNA

• NOMENCLATURE • • Binomial nomenclature Genus & spesies Classification Hierarchy Kingdom Phylum Class Ordo Family Genus Spesies Strain: biovar serovar

Classification Hierarchy • Domain Phylum Class Order Family Genus Spesies Strain Domain: Archae Bacteria Eukarya

• Binomial nomenclature • Binomial Linneaeus • Genus • species • Ex. Staphylococcus aureus

Kingdom • • 5 Kingdoms (1967: Whittaker) Animalia Plantae Protista (Unicellular Eucaryotes) • Monera/ Procaryotae • Fungi (Multicellular Eucaryotes) 3 • • • Domain (1978: Woses) Eubacteria: bacteria Archaebacteria Eucaryotes: Protista, Fungi, Plantae and Animalia

Dasar dasar klasifikasi Karakteristik morfologi Sifat pengecatan Sifat fisiologi Karakteristik ekologi Karakteristik genetik/ molekuler

Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology 2 nded Seq 16 S r. RNA phylogenetik Vol 1: Archae dan bakteri phototropic dengan cabangnya Vol 2: Proteobacteria Vol 3: Bakteri Gram positif dengan G+C rendah Vol 4: Bakteri Gram positif dengan G+C tinggi Vol 5: Planctomycetes, spirochaetes, Fibrobacteria, Bacteroides, Fusobacteria

• 1. Archae dan bakteri phototropic dengan cabangnya Domain: Archae Domain: Bacteria • 2. Proteobacteria (Phyllum Proteobacteria) Kelas I : Alphaproteobacteria Ricketsia, Nitrobacter, rhizobium, Rhodophillum Kelas II : Betaproteobacteria Neisseria, Nitrosomonas, Thibacillus Kelas III : Gammaproteobacteria Legionella, Pseudomonas, Vibrio, Esobacteria Kelas IV : Deltaproteobacteria Bdellovibrio, Myxococcus Kelas V : Epsiloproteobacteria Helicobacter, Camphylobacter

3. Bakteri Gram positif dengan G+C rendah (Phyllum Firmicitus) • Kelas I : Clostridium, Peptostreptococcus, Desulfumaculum • Kelas II : Mollicules • Kelas III: Bacilli Bacillus, Lactobacillus, Streptococcus, Enterococcus, Listeria, Staphylococcus 4. Bakteri Gram positif dengan G+C tinggi • Kelas: Actinobacteria Actinomyces, Micrococcus, Corynebacterium, Mycobacterium, Nocardia, Streptomyces

5. Planctomycetes, spirochaetes, Fibrobacteria, Bacteroides, Fusobacteria Phyllum: Chlamydia Phyllum: Spirochaetes Spirochaeta, Borrellia, Treponema, Leptospira Phyllum: Bacteroidetes Bacteroides, Cytophage Archae atau Archaebacteria