Nukleotida dan asam nukleat Zaenal Arifin S Kep

Nukleotida dan asam nukleat Zaenal Arifin S. Kep. Ns. M. Kes

Nukleotida

u u Merupakan prekursor / dasar untuk asam nukleat, RNA dan DNA Struktur terdiri dari – Basa – Gula – phosphat

Basa penyusun nukleotida u Basa penyusun nukleotida biasanya adalah berupa purin atau pirimidin sementara gulanya adalah pentosa (ribosa), baik berupa deoksiribosa maupun ribosa.

Peran nukleotida u Nukleotida adalah monomer penyusun RNA, DNA dan beberapa kofaktor seperti Co A, FAD, FMN, NAD, dan NADP. Dalam sel kofaktor ini memainkan peran penting dalam fiksasi energi (misalnya fotosintesis, metabolisme dan biosignalling).

u Nukleotida berbeda dengan nukleosida karena nukleosida tdk mempunyai gugus fosfat u Sehingga kita sering menuliskan nukleotida sebagai – Nukleosida monofosfat – Nukleosida difosfat – Nukleosida trifosfat Tergantung pada jumlah fosfat yg dimiliki u Deoksiribonukleotida ditulis dng tambahan “d” menunjukkan adanya gugus hidroksil pd atom C nomer 2

u Terdiri dari 2 golongan : – Ribonukleotida – Deoksiribonukleotida u Jenis nukleotida : – Nama tergantung pada basanya – Jumlah fosfat yang dimiliki Adenin Guanin Sitosin Timin Urasil AMP, ADP, ATP, d. AMP, d. ADP, d. ATP GMP, GDP, GTP, d. GMP, d. GDP, d. GTP CMP, CDP, CTP, d. CDP, d. CTP TMP, TDP, TTP, UMP, UDP, UTP, d. UMP, d. UDP, d. UTP

Struktur nukleotida

Nukleotida mengikat basa nitrogennya pada atom C no. 1, dgn ikatan glikosida u Gugus fosfat terikat pada gugus hidroksil atom C no. 5 u Kedua kondisi diatas, menyebabkan nukleotida mempunyai sifat: – Gugus phosphat bertindak sbg asam kuat (p. Ka= 1) – Gugus amina dr basa purin dan pirimidine, dpt di protonasi – Nukleotida mampu menyerap sinar uv dapat diukur konsentrasinya u

Definisi Asam Nukleat u Asam Nukleat (bahasa Inggris: nucleic acid) adalah makromolekul biokimia yang kompleks. u Berbobot molekul tinggi dan tersusun atas rantai nukleotida yang mengandung informasi genetik. u Asam nukleat ditemukan pada semua sel hidup serta virus.

Asam nukleat Merupakan bagian organisme hidup yg sangat penting u Membawa informasi genetika yang akan diturunkan / ditransfer dr generasi ke generasi. Semua informasi yg ada dlm sel DNA u Ada 2 macam: u – Asam deoksiribonukleat : AND / DNA – Asam ribonukleat : ARN / RNA u Asam nukleat mrpk polimer nukleotida yg dihubungkan dgn ikatan fosfodiester

DNA (Deoxyribo. Nucleic Acid ) u Dikenal sebagai materi genetik u Merupakan komponen kromosom u Merupakan polimer deoksiribonukleotida yg dihubungkan dengan ikatan fosfodiester u Backbone (rangka) terdiri dr: gugus fosfat dan gula yg saling berseling u Memiliki orientasi 5’ 3’ jk gugus fosfat dr C 5 berikatan dgn OH C 3

Didalam sel dalam jalin ganda (double helix) u Dimana gugus fosfat berada di luar dan basa nitrogennya di dalam u Jalin ganda yg terbentuk bersifat anti parallel ? u

Bentuk molekul DNA u Struktur molekul DNA. Atom karbon berwarna hitam, oksigen merah, nitrogen biru, fosfor hijau, dan hidrogen putih

u. Susunan basa nitrogen pada jalin ganda DNA tidak random Guanin (G) – Sitosin (C) Adenin (A) - Timin (T) Antara basa nitrogen satu dengan yang lain dihubungkan dengan ikatan hidrogen u. Watson and Crick : replikasi sangat mungkin untuk suatu DNA diperbanyak dg informasi yg sama

u DNA di dalam sel ditemukan 3 bntk utama – Bentuk B A Z Perbedaanya ?

u seperti halnya protein, asam nukleat juga mempunyai struktur primer, sekunder dan tersier – asam nukleat mempunyai arah sense - Mempunyai individualitas ditentukan dari urutan basa nitrogennya disebut sebagai struktur primer - Informasi genetik ada pada struktur primer A C 3’ G 3’ P P 5’ T 3’ P 5’ C P 5’ ACGTC 3’ OH 5’

Struktur sekunder u Double helix – Watson n Crick menjawab struktur 3 D DNA dgn X-ray diffraction pattern : hsl penelitian Rosalind Franklin – Mampu menyimpulkan bahwa : u u u u mempunyai struktur double helix dengan 10 basa setiap putaran 360 , basa Nitrogen A-T , G – C cekukan mayor and minor double helix memutar ke kanan self replication

Semikonservatif pd Replikasi DNA Mekanisme pengkopian DNA melibatkan pembukaan double helix Setiap rantai menjadi pola / templat untuk pita baru Semi konservatif apa beda dengan konservatif dan dispersive?

u X-ray diffraction : ada 2 macam u Yg telah diterjemahkan struktur 3 D nya : B form u Bentuk yang umum adalah B form u A form RNA double helix – Gugus OH pd RNA tidak memungkinkan melipat lebih dekat membentuk A form yang lebih lebar

Dalam kondisi normal (kondisi fisiologis) DNA relatif stabil Kadang menjadi tidak stabil krn proses 2 replikasi, transkripsi

u Disosiasi double helix DNA denaturasi – apabila DNA dipanaskan diatas melting temperaturnya (Tm) maka double helix akan terbuka – Tm tergantung pada rasio (G+C)/(A+T) – G/C content dapat dihitung dengan (G+C) / (Total Basa N) x 100%

RNA Ada 4 mcm u u u Hn RNA m. RNA r. RNA t. RNA sn. RNA

u u hn. RNA heterogeonous nuclear RNA merupakan hasil transkripsi langsung dr DNA m. RNA – telah mengalami proses posttranskripsi menghilangkan intron informasi genetik dlm btk codon (urutan 3 nukleotida) u r. RNA – Komponen ribosom dimana translasi berlangsung u t. RNA – Menerjemahkan kode genetik – Menghubungkan antara asam nukleat dengan asam amino protein u sn. RNA – Small nuclear RNA membantu proses splicing dalam post transkripsi proses

Transfer RNA (t. RNA) composed of a nucleic acid and a specific amino acid provide the link between the nucleic acid sequence of m. RNA and the amino acid sequence it codes for. An anticodon a sequence of 3 nucleotides in a t. RNA that is complementary to a codon of m. RNA Structure of t. RNAs

Fungsi biologis u DNA sebagai pembawa informasi genetik – DNA komponen dr kromosom u Fungsi yang lain: – Nukleotida sbg pembawa energi – Nukleotida sebagi koensim – enzim