MYCOLOGIE tude des CHAMPIGNONS Syn MYCETES FUNGI Photo

MYCOLOGIE Étude des CHAMPIGNONS (Syn. MYCETES, FUNGI) Photo Nexstar YLF

Définitions • Règne à part, celui des FUNGI • Microorganismes – Munis d'une PAROI comme les bactéries et les végétaux – Noyau de type EUCARYOTE à la différence des bactéries (procaryotes) – Sans pigment assimilateur CHLOROPHYLLIEN à la différence des végétaux YLF

Organisation générale • Constitués – Soit réseau de filaments (MYCELIUM) – Soit sous forme dissociée faite d'éléments unicellulaires bourgeonnants (LEVURES) • Reproduction par formation de SPORES Très utiles pour identifier les champignons YLF

Illustration levures, filaments, spores Photo CHU Rennes LEVURES bourgeonnantes Photo M. Gari-Toussaint FILAMENTS mycéliens (hyphes) SPORES et filaments YLF

La Cellule Fongique d'Eucaryote Polyosidique dont b glucanes Colorable par PAS et Grocott Avec Ergostérol, Cible d'antifongiques Cible des Echinocandines Ampho. B, Triazolés YLF

Culture • Le milieu usuel est celui de SABOURAUD Colonies de Ch. filamenteux Colonies de levures YLF

CANDIDA et CANDIDOSES Candida albicans C. tropicalis C. parapsilosis C. krusei … C. (Torulopsis) glabrata … YLF

Morphologie • En culture – Milieu de Sabouraud: levures – Repiquage sur milieu R. A. T. ou P. C. B. : » C. albicans: levures + pseudomycélium + chlamydospores » Autres espèces: levures + pseudomycélium sauf C. g • Dans les lésions – Association levures + pseudofilaments • C. (Torulopsis) glabrata: levures seulement YLF

Morphologie 2 Photo V. Lavarde Colonies de C. albicans sur milieu de Sabouraud Photo F. Odds Levures de C. albicans MEB YLF

Morphologie 3 Photo Pfizer Chlamydospores de C. albicans sur milieu R. A. T. Pseudomycelium de C. sp. Sur milieu R. A. T. YLF

Habitat naturel • Tous commensaux ou saprophytes YLF

Conditions de pathogénicité Facteurs d'irritation locale: Humidité, transpiration, obésité, brûlures, dentiers, cathéters… Facteurs iatrogéniques: Antibiotiques, corticoïdes, cytostatiques, immunodépresseurs, greffes, chirurgie digestive, réa. lourde, psychotropes, pilule… OPPORTUNISME États pathologiques: Diabète, cancer, SIDA, Immunodépression* États physiologiques: Ages extrêmes, grossesse * Déficit lymphocytaire: candidoses digestives +++ Granulopénie: candidoses systémiques +++ YLF

Candidoses cutanées: Plis Photo D. Grigoriu Photo M. Miégeville YLF

Candidoses Digestives Photo D. Grigoriu Photo M. Feuilhade C. Lacroix Photo D. Grigoriu YLF

Candidoses Génitales Photo D. Grigoriu Photo M. Deniau Photo D. Grigoriu YLF

Candidoses systémiques: Dissémination hématogène aux viscères • Porte d'entrée – Foyer digestif – Cathéter colonisé • Tableau septicémique atypique – Fièvre résistante aux antibactériens • Localisations secondaires à recher: – – – Reins et urines Peau Œil Candidose hépato-splénique … YLF

Candidoses systémiques: localisations secondaires YLF Photo CHU Angers

Diagnostic des candidoses cutanéo-muqueuses • Prélèvements (par le biologiste) – Grattage de lésions sèches, écouvillonnage de lésions humides, débris d'ongle, selles etc. . • Examen direct – Levures + pseudofilaments – Appréciation semi-quantitative • Culture – Colonies en 48 h sur Sabouraud – Dénombrement U. F. C. • Identification • Antifongigramme YLF

Faisceau diagnostique des candidoses systémiques • Surveillance mycologique – Surveillance de la colonisation digestive et des urines. – Hémocultures (positivité tardive et inconstante), biopsies des localisations secondaires accessibles (examen ana-path. ET mycologique) • Surveillance sérologique (décevante) – Cinétique des anticorps (ascension ou chute brutale) – Recherche d'antigènes solubles • Traitement présomptif – Chez le malade à risque si fièvre résistante aux antibactériens plus de 48 – 72 H • Pour demain: PCR ? YLF

Traitement des candidoses • Antifongiques topiques ou systémiques selon la forme clinique – Cf. "Antifongiques" – Dans les candidoses systémiques le traitement doit être le plus précoce possible YLF

Cryptococcus et CRYPTOCOCCOSE Cryptococcus neoformans (3 variétés: neoformans, gattii, grubii) Les autres espèces non pathogénes YLF

Morphologie • En culture – Milieu de Sabouraud: colonies muqueuses beiges, levures rondes. – Milieu R. A. T. ou P. C. B. : levures seulement • Dans les lésions – Levures ENCAPSULEES YLF

Morphologie 2 Colonies de C. neoformans sur milieu de Sabouraud Levure de C. neoformans: Capsule (encre de Chine)YLF

Habitat naturel • Saprophytes dans le milieu extérieur Variété neoformans Variété gattii YLF

Conditions de pathogénicité OPPORTUNISME Inhalation de poussières contaminées Primo-infection pulmonaire infraclinique Immunodépression: Hémopathies Corticoïdes SIDA +++ Dissémination hématogène Localisation Neuroméningée +++ YLF

Aspects cliniques de la cryptococcose • Les manifestations pulmonaires primitives passent inaperçues • La méningite est l'expression la plus fréquente – Tableau subaigu ou chronique dégradé trompeur – PL = clé du diagnostic • Liquide clair, 20 à 1 OO éléments (lymphocytes), albuminorachie , glycorachie , levures encapsulées • Autres localisations plus inhabituelles (sauf dans le cadre du SIDA où la mycose est souvent généralisée): – Peau, encéphale, poumon, os, prostate, septicémie… YLF

Cryptococcose cutanée YLF

Diagnostic biologique des cryptococcoses • Prélèvements – LCR, LBA, hémocultures, urines, biopsies • Examen direct: Encre de Chine – Levures encapsulées • Culture – Colonies en 48 -72 h sur Sabouraud (sans actidione) • Identification, Antifongigramme • Sérologie: antigène capsulaire soluble – Test au latex sur sérum ou LCR YLF

Traitement des cryptococcoses • Antifongiques systémiques – Cf. cours "Antifongiques" YLF

Autres levuroses rares • En cas d'immunodépression sévère d'autres genres peuvent être impliqués: Trichosporon et Geotrichum, Saccharomyces, Rhodotorula… • Malassezia est un commensal, potentiellement pathogène au niveau de la peau (cf. cours suivant), il est exceptionnellement responsable de septicémie dans le cadre d'hyperalimentation lipidique parentérale YLF