MTAMFA Nyri iskola 2009 Fehrjertegek levlasztsa s vizsglata

MTA-MFA Nyári iskola 2009 Fehérjerétegek leválasztása és vizsgálata Műszaki Fizikai és Anyagtudományi Kutatóintézet (MTA-MFA), Budapest Lovassy László Gimnázium, Veszprém Janosov Milán mentor: Kozma Péter Budapest, 2009. 06. 25.

Fehérjék • Fibrinogén - 45 nm x 9 nm x 6 nm - modell fehérje • Flagellin - baktériumok mozgásszervei - 5 -20μm hosszú, - 20 -25 nm átmérőjű - 1500 fordulat / s

Genetikai manipuláció • • Több tízezer monomer 3 belső domén a polimer szerkezetért felelős A külső domént genetikai módosítjuk Különféle vegyületeket megkötő receptorok

Atomerő mikroszkóp (AFM) • AIST-NT Smart. SPM™ 1000 • Üzemmódok: - ‘contact’ mód - ‘semi-contact mód - ‘non-contact’ mód • 10 -20 nm görbületi sugarú Si tű

Ellipszometria • Spektroszkópiai Ellipszométer (SE) Woollam M 2000 -DI • Ellipszometriai szögek: Ψ , Δ • Optikai modell - Cauchy - EMA • Számítógépes illesztő algoritmus - spektrum: Ψ , Δ hullámhossz függvényében - modell feltételezése - minimális MSE elérése

Folyadékcella • In situ vizsgálatokhoz • A folyadék (pl. fehérjeoldat) átáramlik • Fehérjeréteg kiválasztása

Optikai modellalkotás Minta Modell

AFM felvételek Fibrinogén Flagellin - Képméret: 1 µm x 1 µm - Felbontás: 512 x 512 - Pásztázási idő: 1 s / sor

SE in-situ kiértékelések Fibrinogén de Feijter formula felületi tömegsűrűség Flagellin

Összefoglalás • Folyadékcella fehérje leválsztása, in-situ vizsgálata • SE optikai modell megalkotása • Felületi tömegsűrűség meghatározása • AFM felvételekkel felületi morfológia