Monogenn a multigenn nemoci MUDr Michal Jurajda Ph
- Slides: 17
Monogenní a multigenní nemoci MUDr. Michal Jurajda, Ph. D. ÚPF LF MU 16. 3. 2018
Terminologie • Symptom – příznak (chorobný) • Syndrom – skupina příznaků • Nemoc jako nosologická jednotka – obvykle definována podle příznaků a příčin (etiologie) • Pojem normality
Nemoc • Nosologická jednotka popsaná deskriptivně a empiricky • Molekulárně patofyziologický děj, manifestující se různě za daných podmínek zevního prostředí
Dělení nemocí podle etiologických faktorů • Nemoci z vnějších příčin • Nemoci z vnitřních příčin • Choroby z jedné „velké“ příčiny • Multifaktoriální choroby
Nemoci z vnějších příčin • Příčiny: – Fyzikální – Chemické – Biologické
Nemoci z genetického hlediska • Nemoci monogenní • Nemoci multigenní – multifaktoriální
Multifaktoriální nemoci • Projevují se obyčejně v postreprodukčním věku – selekční tlak • Jsou projevem nerovnováhy genomu a zevního prostředí – civilizační nemoci
Multifaktoriální dědičnost
Efekt zkoumané alely • • Je alela riziková jen pro jednu chorobu, nebo pro více chorob? Je alela pro některou chorobu riziková a pro jinou se uplatňuje jako ochranný faktor?
Studium multifaktoriální dědičnosti
Asociační studie
Výběr vzorku pacientů a vzorku kontrol 1. 2. 3. 4. Severly affected x Extremely normal Affected with early onset x Normal eldery Positive family history x Negative family history Affected x Normal with intense environmetal exposure 5. Eldery survivor x Young I. Day (ed. ), Molecular Genetic Epidemiology – A Laboratory Perspective
Confoundings „matoucí faktory“ • Rozvrstvení populace • Linkage disekvilibrium mezi studovaným markrem a skutečnou nemoc způsobující alelou • Rozdíl v genetických a environmentálních rizikových faktorech mezi pacienty a kontrolami
Kauzální asociace • • • Konzistence asociace Síla asociace Biologická věrohodnost Biologický gradient Existence analogií Specificita – těžko očekávatelná u pleiotropních genů • Experimentální důkaz The Pharmacogenomics Journal (2002) 2, 349– 360
Publikační bias • První publikovaná pozitivní asociace obvykle z malé studie usnadňuje publikování dalších pozitivních studií a znesnadňuje publikování negativních studií. Nevíme kolik výsledků končí v „šuplíku“. • Meta-analýzy mají schopnost upozornit na publikační bias • funnel plots, Eggerův test Clin Genet 2003: 64: 7– 17 BMJ 1997; 315: 629 -634 J Clin Epidemiol. 2000 Feb; 53(2): 207 -16.
Malé studie versus velká studie ● + ○ samostatné studie, ■ velká studie
Databáze • NIH • NCBI • Genetic Association Database http: //geneticassociationdb. nih. gov/cgibin/index. cgi