Monogenn a multigenn nemoci MUDr Michal Jurajda Ph

  • Slides: 17
Download presentation
Monogenní a multigenní nemoci MUDr. Michal Jurajda, Ph. D. ÚPF LF MU 16. 3.

Monogenní a multigenní nemoci MUDr. Michal Jurajda, Ph. D. ÚPF LF MU 16. 3. 2018

Terminologie • Symptom – příznak (chorobný) • Syndrom – skupina příznaků • Nemoc jako

Terminologie • Symptom – příznak (chorobný) • Syndrom – skupina příznaků • Nemoc jako nosologická jednotka – obvykle definována podle příznaků a příčin (etiologie) • Pojem normality

Nemoc • Nosologická jednotka popsaná deskriptivně a empiricky • Molekulárně patofyziologický děj, manifestující se

Nemoc • Nosologická jednotka popsaná deskriptivně a empiricky • Molekulárně patofyziologický děj, manifestující se různě za daných podmínek zevního prostředí

Dělení nemocí podle etiologických faktorů • Nemoci z vnějších příčin • Nemoci z vnitřních

Dělení nemocí podle etiologických faktorů • Nemoci z vnějších příčin • Nemoci z vnitřních příčin • Choroby z jedné „velké“ příčiny • Multifaktoriální choroby

Nemoci z vnějších příčin • Příčiny: – Fyzikální – Chemické – Biologické

Nemoci z vnějších příčin • Příčiny: – Fyzikální – Chemické – Biologické

Nemoci z genetického hlediska • Nemoci monogenní • Nemoci multigenní – multifaktoriální

Nemoci z genetického hlediska • Nemoci monogenní • Nemoci multigenní – multifaktoriální

Multifaktoriální nemoci • Projevují se obyčejně v postreprodukčním věku – selekční tlak • Jsou

Multifaktoriální nemoci • Projevují se obyčejně v postreprodukčním věku – selekční tlak • Jsou projevem nerovnováhy genomu a zevního prostředí – civilizační nemoci

Multifaktoriální dědičnost

Multifaktoriální dědičnost

Efekt zkoumané alely • • Je alela riziková jen pro jednu chorobu, nebo pro

Efekt zkoumané alely • • Je alela riziková jen pro jednu chorobu, nebo pro více chorob? Je alela pro některou chorobu riziková a pro jinou se uplatňuje jako ochranný faktor?

Studium multifaktoriální dědičnosti

Studium multifaktoriální dědičnosti

Asociační studie

Asociační studie

Výběr vzorku pacientů a vzorku kontrol 1. 2. 3. 4. Severly affected x Extremely

Výběr vzorku pacientů a vzorku kontrol 1. 2. 3. 4. Severly affected x Extremely normal Affected with early onset x Normal eldery Positive family history x Negative family history Affected x Normal with intense environmetal exposure 5. Eldery survivor x Young I. Day (ed. ), Molecular Genetic Epidemiology – A Laboratory Perspective

Confoundings „matoucí faktory“ • Rozvrstvení populace • Linkage disekvilibrium mezi studovaným markrem a skutečnou

Confoundings „matoucí faktory“ • Rozvrstvení populace • Linkage disekvilibrium mezi studovaným markrem a skutečnou nemoc způsobující alelou • Rozdíl v genetických a environmentálních rizikových faktorech mezi pacienty a kontrolami

Kauzální asociace • • • Konzistence asociace Síla asociace Biologická věrohodnost Biologický gradient Existence

Kauzální asociace • • • Konzistence asociace Síla asociace Biologická věrohodnost Biologický gradient Existence analogií Specificita – těžko očekávatelná u pleiotropních genů • Experimentální důkaz The Pharmacogenomics Journal (2002) 2, 349– 360

Publikační bias • První publikovaná pozitivní asociace obvykle z malé studie usnadňuje publikování dalších

Publikační bias • První publikovaná pozitivní asociace obvykle z malé studie usnadňuje publikování dalších pozitivních studií a znesnadňuje publikování negativních studií. Nevíme kolik výsledků končí v „šuplíku“. • Meta-analýzy mají schopnost upozornit na publikační bias • funnel plots, Eggerův test Clin Genet 2003: 64: 7– 17 BMJ 1997; 315: 629 -634 J Clin Epidemiol. 2000 Feb; 53(2): 207 -16.

Malé studie versus velká studie ● + ○ samostatné studie, ■ velká studie

Malé studie versus velká studie ● + ○ samostatné studie, ■ velká studie

Databáze • NIH • NCBI • Genetic Association Database http: //geneticassociationdb. nih. gov/cgibin/index. cgi

Databáze • NIH • NCBI • Genetic Association Database http: //geneticassociationdb. nih. gov/cgibin/index. cgi