Modlisation molculaire Les outils de la librairie de

Modélisation moléculaire Les outils de la librairie de molécules

Un bref historique O 1989 : Ras. Mol O 1998 : Chime O 2002 : Ras. Top O 2004 : Librairie de molécules O 2005 : Jmol remplace Chime dans la librairie O 2007 : Min. USc et fichiers CIF O 2010 : Librairie interactive (clé concours) O 2012 : Scribmol (construction de molécules)

Quelles nouveautés ? O Types de données utilisables et donc objets étudiables O Traitements applicables aux molécules O Ergonomie des outils, conception des logiciels (interface Homme/Machine)

Utiliser de nouvelles données O Nouvelles O O déterminations (veille scientifique) Structures minérales « Petites » molécules Cryo-microscopie électronique 3 D Conservation de séquences et autres annotations (domaines, localisation des membranes…)

Réaliser de nouveaux traitements O Superposer automatiquement des modèles O Démonter des modèles O Calculer des surfaces O Déterminer les interactions non covalentes (hydrophobes, …)

Ergonomie et interfaces O Visualiser les actions de l’utilisateur : sélection, survol d’un résidu, calcul en cours O Conserver le travail réalisé : cacher au lieu de restreindre O Garder le sens de l’orientation : centrer les rotations sur l’affichage O Donner du sens : informer sur la signification des représentations (légendes, informations)

L’informatique dans le nuage O Les applications sont disponibles en ligne : pas d’installation, utilisation hors les murs possible O Les données utilisables et le travail réalisé sont stockés sur le serveur. Pas de manipulation de fichiers. O Les documents sont échangeables entre utilisateurs O Les statistiques informent en direct sur les usages