METODY STATYSTYCZNE W BIOLOGII WYKADY 1 Wykad wstpny

METODY STATYSTYCZNE W BIOLOGII WYKŁADY 1. Wykład wstępny 2. Populacje i próby danych 3. Testowanie hipotez i estymacja parametrów 4. Planowanie eksperymentów biologicznych 5. Najczęściej wykorzystywane testy statystyczne 6. Podsumowanie dotychczasowego materiału, wspólna analiza przykładów, dyskusja 7. Regresja liniowa 8. Regresja nieliniowa 9. Określenie jakości dopasowania równania regresji liniowej i nieliniowej 10. Korelacja 11. Elementy statystycznego modelowania danych 12. Porównywanie modeli 13. Analiza wariancji 14. Analiza kowariancji 15. Podsumowanie dotychczasowego materiału, wspólna analiza przykładów, dyskusja

METODY STATYSTYCZNE W BIOLOGII ĆWICZENIA 1. Ćwiczenia wstępne 2. Populacje i próby danych 3. Testowanie hipotez i estymacja parametrów 4. Planowanie eksperymentów biologicznych 5. Najczęściej wykorzystywane testy statystyczne 6. Kolokwium 1 7. Regresja liniowa 8. Regresja nieliniowa 9. Praca w grupach roboczych – interpretacja wyników różnych modeli regresji 10. Korelacja 11. Kolokwium 2 12. Porównywanie modeli 13. Analiza wariancji 14. Prezentowanie przez grupy robocze wyników analizy danych 15. Zaliczenie ćwiczeń

BIOINFORMATYKA WYKŁADY 1. Wykład wstępny 2. Struktury danych w badaniach bioinformatycznych 3. Bazy danych: projektowanie i struktura 4. Bazy danych: projektowanie i struktura 5. Zastosowanie przykładowych programów do analizy danych 6. Zastosowanie przykładowych programów do analizy danych 7. Powiązania pomiędzy genami: Hardyego-Weinberga, współczynnik rekombinacji 8. Analiza sprzężeń 9. Analiza sprzężeń 10. Analiza asocjacyjna 11. Analiza asocjacyjna 12. Symulacje komputerowe, jackknife, bootstrap 13. Monte Carlo Markov Models 14. Metody klasyfikacyjne 15. Wykład podsumowujący

BIOINFORMATYKA ĆWICZENIA 1. Ćwiczenia wstępne: generowanie zbiorów danych 2. Analiza filogenetyczna 3. Analiza filogenetyczna 4. Wizualizacja struktury 3 D białek 5. Kolokwium 1 6. Zastosowanie programów do obliczenia wsp. równowagi Hardyego-Weinberga 7. Zastosowanie programów do obliczenia współczynnika rekombinacji 8. Zastosowanie programów do przeprowadzenia analizy sprzężeń 9. Zastosowanie programów do przeprowadzenia analizy sprzężeń 10. Zastosowanie programów do przeprowadzenia analizy asocjacyjnej 11. Zastosowanie programów do przeprowadzenia analizy asocjacyjnej 12. Kolokwium 2 13. Prezentacje 14. Prezentacje 15. Zaliczenie

SYSTEMY INFORMATYCZNE WSPOMAGAJĄCE HODOWLĘ WYKŁADY 1. Wykład wstępny 2. Bazy danych wartości produkcyjnych i hodowlanych w Polsce i na świecie 3. Struktura efektywnej bazy danych. Zastosowanie pakietu MS Excel 4. Zastosowanie pakietu My. Sql 5. Detekcja genów głównych w populacjach zwierząt hodowlanych – wprowadzenie 6. Przykłady programów: SAS 7. Przykłady programów: QTL-express, QTL-cartographer 8. Obliczanie współczynnika inbredu – przykłady programów 9. Ocena wartości hodowlanej bydła mlecznego – wprowadzenie 10. Model ojcowski – programy SAS i As. REML 11. Model osobniczy, laktacyjny – programy SAS i As. REML 12. Model osobniczy z regresjami dla próbnych udojów – wprowadzenie 13. Model osobniczy z regresjami dla próbnych udojów – program As. REML 14. Ocena wartości hodowlanej funkcjonalnej długowieczności – wprowadzenie 15. Ocena wartości hodowlanej funkcjonalnej długowieczności – program Survival. Kit

SYSTEMY INFORMATYCZNE WSPOMAGAJĄCE HODOWLĘ ĆWICZENIA 1. Ćwiczenia wstępne 2. Korzystanie z bazy danych wartości hodowlanych w Polsce i na świecie 3. Zapoznanie się ze zbiorami danych przeznaczonymi do analizy na ćwiczeniach 4. Zastosowanie pakietu My. Sql do tworzenia baz danych 5. Zastosowanie pakietu My. Sql do tworzenia baz danych 6. Kolokwium 1 7. Detekcja genów głównych, zastosowanie pakietu SAS - wprowadzenie 8. Detekcja genów głównych, zastosowanie pakietu SAS - wykonanie obliczeń 9. Detekcja genów głównych, zastosowanie pakietu SAS - interpretacja wyników 10. Kolokwium 2 11. Ocena wartości hodowlanej, model ojcowski – wykonanie obliczeń, SAS 12. Ocena wartości hodowlanej, model osobniczy – wykonanie obliczeń, SAS 13. Ocena wartości hodowlanej – wizualizacja i analiza wyników 14. Kolokwium 3 / Projekt 15. Zaliczenie