Membranproteiner Kapitel 12 Membranproteiner Perifera membranproteiner Integrala membranproteiner
Membranproteiner Kapitel 12
Membranproteiner Perifera membranproteiner Integrala membranproteiner
Colicin A Paradox: Membranprotein Som är lösligt både i vatten och instopppat i membran Alternativ Konformation i lösning jämfört med i membran
Bakterierhodopsin
Bakterierhodopsin
Retinal, ljusabsorberande pigment
Rhodopsin Retinal Blå= grundtillstånd Röd=exciterat tillstånd
Proton förflyttning hos rhodopsin
Proton förflyttning hos rhodopsin
Proton förflyttning hos rhodopsin
Porin
Trimer av porin
K+-kanalen
K+-kanalen
K+-kanalen
K+-kanalen
K+-kanalen ”från sidan” ”uppifrån”
Fotosyntetiska pigment Ubikinon Klorofyll
Diffraktionsfoto på fotosyntetiska reaktionscentrat
Fotosyntetiska reaktionscentrat
Fotosyntetiska pigment
Schematisk bild över reaktionscentrat
Light harvesting complex, LH 2
Light harvesting complex, LH 2
Light harvesting complex, LH 2
Light harvesting complex, LH 1
LH 1, LH 2 och reaktionscentrat
Energiflöde via LH 2 och LH 1 till reaktionscentrat
Hydropathy plot • Beräkna utgående från ett ”fönster” (19 aa) hydrofobiciteten och plottar mot sekvensen • Kan förutsäga vilka delar av en transmembranhelix som är inbäddad i membranet • Kan även användas för cytosoliska proteiner, vilken information får man då?
Hydropathy plot
Hur beräknas dessa skalor?
Några exempel från PDB • K+-kanalen • Rhodopsin • Colicin A
Signaltransduktion kap 13
Topologi c. H-rasp 21 Topologisk brytpunkt
Bindning av GTP till aktiva ytan
Inbindning av GTP till transducin
Komformationsändringar hos transducin
Transducin
Komformationsändringar hos transducin
G protein, Transducin, heterotrimer
G protein, Transducin, heterotrimer
G protein, Transducin, b-subenheten
Phosducin, regulator av GTPase aktivitet
Phosducin bindning till transducin dimer Phosducin, blockerar bindning Till a-subenheten
Human growth hormone Four-helix bundle
Human growth hormone receptor Bindningsyta för HGH Immunoglobulinfold
Bindning av HGH till HGH receptor 1: 2 komplex Osymmetrisk bindning av HGH
Bindning av Prolactin receptor till HGH 1: 1 komplex
Hormon receptor interaktion
Hormon receptor interaktion
Tyrosinkinas familjen
Src Tyrosinkinas • Signalprotein som kontrollerar celltillväxt • Signalering sker med hjälp av fosforylering av tyrosiner • Hundratals olika Tyrosinkinaser som är närbesläktade, ”Knock-out” ofta ingen effekt • Onkogen, genen alltid aktiv ger ohämmad celltillväxt, utveckling av cancer
Src Tyrosinkinas, SH 2 domänen
Src Tyrosinkinas, aktiv och inaktiv form Från: PDB, ”molecule of the month”
From: Time Magazine 28 May 2001
Tyrosinkinas med inbunden Gleevec (Cancermedicin)
Några exempel från PDB • Transducin • G protein trimer • Inbinding av GTP/GDP kolla konformationsändring
- Slides: 78