MASSENSPEKTROMETRIE gestern heute morgen Dr Stefan Schrch Departement

MASSENSPEKTROMETRIE gestern - heute - morgen Dr. Stefan Schürch Departement für Chemie und Biochemie Universität Bern

MASSENSPEKTROMETRIE KLASSISCHES MASSENSPEKTROMETER DETEKTOR MAGNET IONENQUELLE 57 100% 120 176 232 273 288 39 29 20 71 40 60 91 105 80 145 161 216 259 100 120 140 160 180 200 220 240 260 280 300 m/z

MASSENSPEKTROMETRIE: GESTERN - HEUTE - MORGEN • 100 JAHRE MASSENSPEKTROMETRIE • ANWENDUNGEN IN DER BIOANALYTIK • PROTEOMICS O NH HO O N OH O O P O OH O O • BRÜCKENMUSTER VON SPINNENTOXINEN NH O N OH O O P O OH O O NH O N OH O O P O OH • OLIGONUCLEOTID SEQUENZIERUNG O O NH 2 OH O O P O OH N OH O

SIR JOSEPH JOHN THOMSON ENTDECKUNG DES ELEKTRONS (1897) ‘AT FIRST THERE WERE VERY FEW WHO BELIEVED IN THE EXISTENCE OF THESE BODIES SMALLER THAN ATOMS. I WAS EVEN TOLD LONG AFTERWARDS BY A DISTINGUISHED PHYSICIST WHO HAD BEEN PRESENT AT MY 1897 LECTURE AT THE ROYAL INSTITUTION THAT HE THOUGHT I HAD BEEN PULLING THEIR LEGS. ’ J. J. Thomson, ‘Recollections and Reflections’, G. Bell and Sons, London 1936. NOBELPREIS FÜR PHYSIK 1908 SCHEMA VON THOMSON’S KATHODENSTRAHL RÖHRE

THOMSON´S PARABEL-SPEKTROGRAPH (1910) Ne 20 Ne 22 CO Hg

DIE 20 ER JAHRE - DAS JAHRZEHNT DER ISOTOPEN MASSENSPEKTROGRAPH VON F. W. ASTON (1919), SCIENCE MUSEUM LONDON

DIE 20 ER JAHRE - DAS JAHRZEHNT DER ISOTOPEN ASTON’S MASSENSPEKTROGRAPH VORLÄUFER SPÄTERER HOCHAUFLÖSENDER MASSENSPEKTROMETER F. W. ASTON IM CAVENDISH LABORATORY, CAMBRIDGE (1920)

ISOTOPEN SEPARATION (F. W. ASTON 1920)

DIE 30 ER JAHRE - IONENOPTIKEN UND THEORIEN ERNEST LAWRENCE ENTWICKELT DAS CYCLOTRON (UC BERKELEY, 1931) HAROLD UREY ENTDECKT DAS DEUTERIUM (1932) JOSEF MATTAUCH UND RICHARD HERZOG ENTWICKELN DAS DOPPELFOKUSSIERENDE (HOCHAUFLÖSENDE) MASSENSPEKTROMETER (WIEN 1934)

DER KRIEG - PRÄPARATIVE MASSENSPEKTROMETRIE DAS CALUTRON IONENAUFFÄNGER ( Ni-FOLIEN ) U 238 99. 2 % U 235 0. 8% IONENQUELLE 100 g UCl 4 MAGNETSPULEN VAKUUMPUMPEN 7500 m 3/s STROMVERBRAUCH PRO MAGNET 4500 k. W (7500 A @ 600 V)

PRÄPARATIVE MASSENSPEKTROMETRIE - DAS CALUTRON

PRÄPARATIVE MASSENSPEKTROMETRIE - DAS CALUTRON

PRÄPARATIVE MASSENSPEKTROMETRIE - DAS CALUTRON MAGNETSPULEN AUS REINEM SILBER VOR DER RÜCKGABE AN DAS US DEPARTMENT OF TREASURY (ca. 1948) A TREASURY OFFICIAL WAS APPROACHED ABOUT THE POSSIBILITY OF LOANING SILVER TO A WARTIME EMERGENCY PROJECT. WHEN THE OFFICIAL ASKED ABOUT THE AMOUNT OF SILVER REQUIRED, HE WAS TOLD THAT THE PROJECT WOULD REQUIRE ABOUT 15’ 000 TONS OF THE METAL. HIS RESPONSE WAS ‘SIR, WE MEASURE OUR SILVER IN OUNCES, NOT TONS’….

DIE 5 OER JAHRE - KOMMERZIALISIERUNG CEC Model 21 -103 Sector Field Mass Spectrometer (1950)

DIE 5 OER JAHRE - KOMMERZIALISIERUNG

DIE 50 ER JAHRE - HOCHAUFLÖSENDE MASSENSPEKTROMETRIE MOLECULES HAVING THE SAME MASS NUMBERS BUT DIFFERING IN WEIGHT BY AN AMOUNT DETERMINED ONLY BY THE DIFFERENCE IN BINDING ENERGIES OF THE NUCLEAR PARTICLES CAN BE CLEARLY RESOLVED. . . ALFRED O. NIER, SCIENCE 121, 1955, 740.

ACCURATE MASS DETERMINATION (PEAK MATCHING) WINDOW [ppm] INTENSITY [V] 65 ppm = 0. 013 Da LOW REFERENCE UNKNOWN MASS HIGH REFERENCE

ACCURATE MASS DETERMINATION (PEAK MATCHING) THEORETICAL MASS ELEMENTS FOR EVALUATION EXPERIMENTAL MASS ELEMENTAL COMPOSITION DEVIATION FROM THEORETICAL MASS ERROR OF ACCURATE MASS DETERMINATION ON MICROMASS AUTOSPEC: ± 2 ppm

DIE 50 ER JAHRE - QUADRUPOLE UND IONENSPEICHER WOLFGANG PAUL BESCHREIBT DAS ELEKTRISCHE MASSENFILTER (QUADRUPOL ANALYSATOR) (W. Paul, H. Steinwedel, Z. Naturforsch. 8 a, 1953, 448. ) PRINZIP DES IONENSPEICHERS 1958 ERSTMALS BESCHRIEBEN (W. Paul) KOMMERZIALISIERUNG DER ION TRAP 1984 (George Stafford, Finnigan Corporation)

DIE 60 ER JAHRE - QUADRUPOL-MS, GC/MS KOPPLUNG, TANDEM MASSENSPEKTROMETRIE KLASSISCHES MASSENSPEKTROMETER DETEKTOR MAGNET ELEKTRONENSTOSS IONENQUELLE GASPHASEN-VERHALTEN ORGANISCHER VERBINDUNGEN MS 1 Vorläufer CID MS 2 Produkte TANDEM-MASSENSPEKTROMETRIE (Mc. Lafferty, Jennings 1967) ERSTES KOMMERZIELLES GC-QUADRUPOL-MS (FINNIGAN 1968)

DIE 70 ER JAHRE - KLASSISCHE ORGANISCHE MASSENSPEKTROMETRIE STRUKTURAUFKLÄRUNG ORGANISCHER VERBINDUNGEN 57 100% 120 176 EI-MS & EI-MS/MS 232 273 288 39 29 20 71 40 60 91 105 80 145 161 216 259 100 120 140 160 180 200 220 240 260 280 300 m/z GC/MS ZUR NATURSTOFF-ANALYSE

DIE 70 ER JAHRE - EXTRATERRESTRISCHE MASSENSPEKTROMETRIE 1969 -1972: SECHS MISSIONEN ZUM MOND MIT GC/MS KEINE BEWEISE FÜR LEBEN MINIATURISIERTE MASSENSPEKTROMETER AN BORD VON SATELLITEN ZUR UNTERSUCHUNG DER ÄUSSEREN ERDATMOSPHÄRE (SEIT 1961) PIONEER 13 MISSION ZUR VENUS MIT GC/MS (NASA 1979) VIKING MISSION ZUM MARS: VIKING LANDER MIT GC/MS ZUR UNTERSUCHUNG DER MARS-ATMOSPHÄRE (NASA 1975)

DIE 80 ER JAHRE - GRUNDSTEINE HEUTIGER BIOANALYTIK SANFTE IONISIERUNGSMETHODEN FAST ATOM BOMBARDMENT (BARBER 1981) MALDI (TANAKA 1988, KARAS & HILLENKAMP 1988) ELECTROSPRAY (DOLE 1984, FENN 1988)

Lysozym aus Hühnereiweiss 14’ 300 Da Koichi Tanaka Rapid Commun. Mass Spectrom. 2, 1988, 151 -153.

M. Karas and F. Hillenkamp, Anal. Chem. 60, 1988, 2299 -2301. Serum Albumin aus Rinderblut 66’ 600 Da M. Karas und F. Hillenkamp

MATRIX-ASSISTED LASER DESORPTION/IONIZATION (MALDI) 2, 5 -Dihydroxy-benzoesäure und Cytochrom c Intaktes, protoniertes Biomolekül [M+H]+ Energiereicher Primärstrahl UV-LASER 337 nm, 3 ns + + - Desorbierte Partikel Ionen, Neutralteilchen, Elektronen + 100 Shots @ 3. 1 m. J Kollisionskette MATRIX-MOLEKÜLE 350 Shots @ 3. 1 m. J

MALDI-TIME-OF-FLIGHT MASSENSPEKTROMETRIE LASER = START DSO DETEKTOR = ZIEL PROBE

MALDI-TIME-OF-FLIGHT MASSENSPEKTROMETRIE SERUM ALBUMIN AUS RINDERBLUT SANFTE IONISIERUNG, INTAKTE MOLEKÜLIONEN + EINFACH GELADENE IONEN [M+H] / [M-H] EINFACHE SPEKTREN: ‘EIN’ PEAK PRO KOMPONENTE GEMISCHANALYSE IST MÖGLICH POLYETHYLEN GLYKOL 6000

ELECTROSPRAY IONISIERUNG Protonen auf Tropfen. Oberfläche + + + ++ + + Verdampfen des Lösungsmittels ++ ++ ++ Rayleigh-Grenze Coulomb-Explosion + + + + + Desorption mehrfach geladener Ionen infolge des selbst erzeugten elektrischen Feldes MASSENANALYSATOR ATMOSPHÄRENDRUCK DETEKTOR SPRAY 5000 V 10 -2 mbar TROCKNUNGSGAS 10 -5 mbar

ELECTROSPRAY IONISIERUNG SANFTE IONISIERUNG FLUSSRATEN MEHRFACH GELADENE IONEN IONISIERUNG DIREKT AUS LÖSUNG LC/MS KOPPLUNG PROBENVOLUMEN (GEMISCHTRENNUNG, REINIGUNG) KONZENTRATION 2 - 2000 l/min > 2 l > 100 fmol/ l

ELECTROSPRAY IONISIERUNG Ionen mit erhöhten Ladungszuständen 21+ 22+ 20+ 19+ 23+ [M + n. H]n 18+ 24+ 17+ 25+ 26+ 27+ 28+ 16+ John Fenn 15+ 14+ 13+ Horse Heart Myoglobin, 1 pmol/ l

MASSENSPEKTROMETRIE HEUTE ORGANISCHE MS NIEDERMOLEKULARE ORGANIKA STRUKTURAUFKLÄRUNG, IDENTIFIZIERUNG, QUANTIFIZIERUNG SYNTHESE, NATURSTOFFCHEMIE, UMWELTANALYTIK, FOOD, TOXIKOLOGIE, KRIMINALISTIK, ARCHÄOLOGIE MS IN DER BIOANALYTIK BIOMOLEKÜLE GROSSER MASSER LABILE VERBINDUNGEN MASSENBESTIMMUNG, SEQUENZEN, MODIFIKATIONEN, IDENTIFIZERUNGEN EI-MS, FAB, ESI-MS GC/MS, LC/MS, MS/MS BIO-ORGANISCHE CHEMIE, BIOLOGIE, MEDIZIN ANORGANISCHE MS METALLIONEN (ICP-MS) FESTKÖRPER-OBERFLÄCHEN (SIMS) GASANALYTIK (EI-MS & GC/MS) ESI-MS, MALDI-MS LC/MS, MS/MS

DIE 90 ER JAHRE - AUTOMATISIERUNG, HIGH-TROUGHPUT UND PROTEOMICS GENOMICS: DNA SEQUENZ-ANALYSE STATISCHE INFORMATION NUR CODIERTE SEQUENZINFORMATION VIELE OPEN READING FRAMES PROTEOMICS: UMFASSENDE PROTEIN ANALYSE ABBILD DER ZELLE ZU BESTIMMTEM ZEITPUNKT ERFASSEN DES EXPRESSIONSMUSTERS DYNAMIK, UP/DOWN REGULIERUNG ERFASSEN VON MODIFIKATIONEN (PTMs) MEHR ALS 1 PROTEIN PRO DNA-SEQUENZ PROTEIN-PROTEIN WECHSELWIRKUNGEN PROTEOM: TOTALER PROTEINGEHALT EINER ZELLE (M. Wilkins, 1995)

PROTEIN IDENTIFIZIERUNG MIT PEPTIDE MASS MAPPING ZELLE: 5’ 000 PROTEINE TRENNUNG IN-GEL VERDAU 2 D-PAGE z. B. TRYPSIN PROTEIN-SPOTS PEPTIDMISCHUNG EXTRAKTION MALDI-TOF-MS MASSEN DER TRYPTISCHEN PEPTIDE SIND CHARAKTERISTISCH FÜR JEDES INDIVIDUELLE PROTEINDATENBANK 'PEPTIDE MASS MAP'

PROTEIN IDENTIFIZIERUNG MIT MS/MS TRENNUNG IN-GEL VERDAU 2 D-PAGE z. B. TRYPSIN ZELLE: 5’ 000 PROTEINE PEPTIDMISCHUNG EXTRAKTION PROTEIN-SPOTS 1 PEPTID AUSWÄHLEN TSY CID PHG G H P Y S T PROTEINDATENBANK PRODUKT-IONEN SPEKTRUM PARTIELLE AMINOSÄUREN-SEQUENZ ESI-MS/MS

TANDEM-MASSENSPEKTROMETRIE MIT DEM TRIPLE-QUAD IONEN-QUELLE 1. QUADRUPOL 2. QUADRUPOL q 2 Q 1 GAS VORLÄUFER-IONEN KOLLISIONSZELLE SELEKTION CID VORLÄUFER-ION m. P + COLLISION INDUCED DISSOCIATION 3. QUADRUPOL DETEKTOR Q 3 PRODUKT-IONEN ANALYSE NEUTRALTEILCHEN mn PRODUKT-ION m. F + KOLLISIONSAKTIVIERUNG UND FRAGMENTIERUNG DES VORLÄUFER-IONS

MODERNE TANDEM-MASSENSPEKTROMETER: Qq. TOF Gepulste Ionenbeschleuigung Ionenquelle (Electrospray) Detektor Trocknungsgas q 0 QUADRUPOL q 0 (Ionen Fokussierung) Q 1 QUADRUPOL MASSENFILTER (Vorläuferionen Selektion) TOF q 2 Produktionen Analyse KOLLISIONSZELLE (rf-only Quadrupol) Reflektor Applied Biosystems / Sciex QSTAR Pulsar Hybrid Quadrupole Time-of-Flight Mass Spectrometer

Applied Biosystems / Sciex QSTAR Pulsar Hybrid Quadrupole Time-of-Flight Mass Spectrometer

ESI-MS EINES TRYPTISCHEN PEPTID-GEMISCHES 547. 260 m/z

ISOLATION EINES VORLÄUFER-IONS (PEPTID) ISOTOPENPEAKS 547. 260 all-C 12 547. 595 Dm/z = 0. 33 1 x C 13 [M+3 H]3+ 547. 928 2 x C 13 1 x S 34 DREIFACH GELADENES ION 548. 259 3 x C 13 m/z MINIMALE KOLLISIONSENERGIE

PEPTID-SEQUENZIERUNG MIT TANDEM-MS y 2 y 3 z 3 x 3 y 1 z 2 x 2 z 1 x 1 H - NH - CH - CO - OH c 2 a 3 c 1 a 2 a 1 b 1 AMINOSÄURE 1 R 4 R 3 R 2 R 1 b 2 AMINOSÄURE 2 c 3 b 3 AMINOSÄURE 4 (FAST) JEDE AMINOSÄURE HAT IHRE CHARAKTERISTISCHE MASSE

PEPTID-SEQUENZIERUNG MIT TANDEM-MS 1187 1088 1001 900 803 702 589 491 361 262 175 Val - Ser - Thr - Pro - Thr - Leu/Ile - Val - Glu - Val - Ser - Lys 589. 152 490. 117 y-IONEN-SERIE Ser Val Glu Val Leu/Ile Thr Pro Thr Ser Val 87. 0 99. 1 129. 0 99. 1 113. 1 101. 1 97. 1 101. 1 87. 0 99. 1 702. 209 175. 068 900. 248 803. 222 361. 116 1088. 283 262. 078 1001. 239 VORLÄUFER-ION m/z 547. 26 (3+) m/z 1187. 339

CUPIENNIUS SALEI

DAS GIFT VON CUPIENNIUS SALEI • 8 - 12 l TOXIN PRO SPINNE UND MONAT • HOHER SALZGEHALT • FREIE AMINOSÄUREN • PEPTIDE CUPIENNINE 8 PEPTIDE ~35 AMINOSÄUREN KEINE DISULPHID-BRÜCKEN CSTX - PEPTIDE CUPIENNIUS SALEI TOXINE 13 PEPTIDE 65 - 78 AMINOSÄUREN STARK VERKNOTETES BRÜCKENMUSTER

CSTX-PEPTIDE: AMINOSÄUREN-SEQUENZEN (EDMAN) 10 20 CSTX-1 S C I P K H E E C T N D K H N C C R K G L F CSTX-9 K D D K N C I P K H H E C T N D K K N C C K K G L T CSTX-13 S D C T L R N H D C T D D R H S C C R S K M F 30 40 50 CSTX-1 K L K C Q C S T F D D E S G Q P T E R C A C G R P CSTX-9 K M K C F T V A D A K G A T S E R C A C D S S CSTX-13 K D V C T C F Y P S Q A K K E L C T C Q Q P 60 70 CSTX-1 M G H Q A I E T G L N I F R G L F K G K K K N K K T K CSTX-9 L L Q K F G F T G L H I I K G L F CSTX-13 K H L K Y I E K G L Q K A K D Y A T

6 Lys ? 21 Thr 20 Lys Lys Cys Asn Lys Met Lys Cys 30 Lys TRYPTISCHER ABBAU Leu Thr 32 Cys Phe Thr Val ? Ala Lys Gly Leu 48 46 Ser Asp Cys Ala Cys Arg Glu Ser Ala Thr Phe Thr Asn Asp ? Phe Lys Gln Leu CSTX-9 ? Gly Glu 13 Cys Asp Lys His Asp Lys Asn Cys Ile Pro Gly Leu Ile Lys His Gly Leu Phe ICK-BRÜCKENMUSTER

CSTX-9: CYSTINE-HALTIGE FRAGMENTE AUS TRYPTISCHEM ABBAU 13 His Glu Cys Thr Asn Asp Lys 6 Asn - Cys - Ile - Pro - Lys ? 20 30 Cys Lys 21 Cys 13 - Cys 30 Asn - Cys - Lys ? 46 48 Cys - Ala - Cys - Asp - Ser - Leu - Gln - Lys ? 27 AMINOSÄUREN 32 Cys - Phe - Thr - Val - Ala - Asp - Ala - Lys 3 DISULPHIDE-BRÜCKEN MASSE 2953. 36 Da

NANO-ELECTROSPRAY IONENQUELLE FÜR GERINGSTEN PROBENVERBRAUCH • PROBENVOLUMEN • FLUSSRATE • NADELÖFFNUNG 0. 5 - 5 l 10 -20 nl/min 1 m • MECHANISMUS WIE ESI • EFFIZIENTE IONISIERUNG • NUR OFF-LINE BETRIEB !

Nanospray Ionenquelle

MS/MS DES TRYPTISCHEN CSTX-9 FRAGMENTS 357. 25244. 16 147. 11 Asn - Cys - Ile - Pro - Lys S S Asn - Cys - Lys S S 790. 43 675. 40 588. 37 501. 34 388. 25 275. 17 147. 11 Cys - Ala - Cys - Asp - Ser - Leu - Gln - Lys S S 751. 40 604. 33 503. 28 404. 21 357. 25 244. 16 147. 11 Cys - Phe - Thr - Val - Ala - Asp - Ala - Lys 32 86 60 4 50 3 . 2 17. 2 40 4 Ala Asp m/z 591. 69 Thr Val Leu Ser Asp 26. 4 79 0 04. 4 67 5 53 35 7 . 2 33 3 . 1 82 38 8 . 2 58 8 58 . 0 64 50 1 . 3 41 Gln 78 Lys Ala . 1 Lys Precursor Ion [M+5 H] 5+ Ile Pro 27 5 Lys 24 4 14 7 . 1 69 16 21 8 . 1 53 all y 1+ Ions CID (N 2) 30 e. V m/z

MS/MS DES TRYPTISCHEN CSTX-9 FRAGMENTS 6 Asn - Cys - Ile - Pro - Lys S S 20 21 Asn - Cys - Lys E DISULPHID-DEFINIERENDE FRAGMENT IONEN S C S 46 D 48 Cys - Ala - Cys - Asp - Ser - Leu - Gln - Lys y+ m/z 604. 33 S S y 3+ m/z 643. 46 A 675. 40 32 Cys - Phe - Thr - Val - Ala - Asp - Ala - Lys y 3+ m/z 667. 30 B B 604. 33 b 4+ m/z 534. 22 A E y+ m/z 675. 40 532 600 625 650 675 534 536 538 Precursor [M+5 H]5+

INHIBITOR CYSTINE KNOT (ICK) STRUCTRUAL MOTIF VI II I Cys III Cys VI IV V Cys IV Cys V III GENERELLE DISULPHID-ANORDNUNG IM ICK-MOTIV Cys(I-IV) Cys(II-V) Cys(III-VI)

DANK THE SPIDER PEOPLE DR. LUZIA KUHN-NENTWIG PROF. DR. WOLFGANG NENTWIG BENNO WULLSCHLEGER THE PROTEIN SEQUENCING PEOPLE PD DR. JOHANN SCHALLER URS KÄMPFER THE OLIGONUCLEOTIDE PEOPLE PROF. DR. CHRISTIAN LEUMANN DR. ELOY BERNAL-MENDEZ THE MASS SPEC PEOPLE JAN TROMP SELINA MONN KAROL KROCKA MARKUS STADLER