Lput kirjutamisest Vt ka http tera chem ut

Lõputöö kirjutamisest Vt ka http: //tera. chem. ut. ee/~ivo/Seminar/ Ivo Leito Ivo. leito@ut. ee 5. 03. 2021 1

Kirjutama hakkamine Ajajaotusest Igati tuleb vältida oluliste asjade jäämist maikuusse! • Kirjutama tuleks hakata oktoobris-novembris – Ei ole probleem, et tulemusi on veel vähe Just (tulemuste osa) kirjutades saate Te kõige paremini aru, mis eksperimente veel teha! 5. 03. 2021 2

Kasutage @ märke, kui miski veel Ajajaotusest täpsustub • Näide: Mõõtmistulemuste järgi suureneb nende ainete happelisus asendajast sõltuvalt järjekorras @F < @Cl < @Br. Lisaks nende asendajate erinevale induktiivsele ja resonants-efektile on erinev ka steeriline efekt: asendajate mahukus kasvab reas F < Cl < Br. Molekulaarmehaanika tulemused näitavad, et ainetel 1 -3 on karboksüülrühm aromaatse tuuma tasandist välja pööratud. Enim on karboksüülrühm aromaatse tuuma tasandist välja pööratud @bromo -asendatud aines 3 (kahetahulise nurga väärtus @°). Sellele järgneb @kloro-asendatud aine 2 (kahetahulise nurga väärtus @24°). Kõige vähem on karboksüülrühm aromaatse tuuma tasandist välja pööratud @fluoro-asendatud ainel 1 (kahetahulise nurga väärtus @13°). 5. 03. 2021 3

Ajajaotusest • Eksperiment on olulisem kui kirjutamine – Eriti neil, kes kasutavad kapriisseid või koormatud aparaate • Tegutseda tuleb pidevalt – Vältida „äravajumist“ • Initsiatiiv peab tulema Teie poolt! – Juhendaja poolne küsimus „kuidas läheb? “ on ohu märk • Tähtajad • Kaitsmisele lubamine 5. 03. 2021 4

Kui olete juhendajale saatnud. . . Suhtlemisest . . . Siis mitte mingil juhul ärge oodake juhendaja järgi ega katkestage kirjutamist! 5. 03. 2021 5

Suhtlemisest See on Teie töö ja initsiatiiv peab igal ajahetkel tulema Teie poolt! • Kui juhendaja küsib „kuidas läheb? “, siis ta ilmselt pole mõnda aega kuulnud Teist – Võtke seda kui pehmet etteheidet • Ivo Leito korral parim suhtlusmeetod: Skype – leitoivo – Sõna otseses mõttes 24/7 – Ajakriitilised asjad: ainult Skype! 5. 03. 2021 6

Pilvekaustad Suhtlemisest • Kõigil Teil võiks olla mõni pilvekaust – Dropbox – Google Drive – Nextcloud/Owncloud –. . . • Editeerida võiks otse seal – Pidev backup – Juhendaja näeb, mis toimub 5. 03. 2021 7

Lõputöö struktuur Struktuur Vaid põhilised osad – Sissejuhatus – Kirjanduse ülevaade • Põhimõisted • Probleemi avamine – (Töö eesmärk) – Eksperimentaalne osa – Tulemused ja arutelu • Nende tähtsus, seosed varemtehtuga • Töö edasiarendamise võimalused – Kokkuvõte – Viited – Lisad 5. 03. 2021 Nõuded ja näidised: http: //tera. chem. ut. ee/~ivo/Seminar/ 8

Sissejuhatus • • Struktuur Avab probleemi olemuse Viiteid reeglina ei ole Enamasti defineerib töö eesmärgi 1 - 1. 5 lk 5. 03. 2021 9

Kirjanduse ülevaade Struktuur • Defineerib põhimõisted • Avab teema tausta – Miks on see teema oluline, et selle peale üldse lõputööd teha? • Sisaldab viiteid • Seletab probleemi lahti – Mis on see, mis valdkonnas on halvasti, st, mida Teie oma töös tahate parandada? • Annab ülevaate meetoditest – Keskenduge neile meetoditele, mida Te kasutasite ja vähesel määral neile, mida oleks ka võinud kasutada – Oma kasutatud meetodite eeliseid tuleb välja tuua • 7 - 10 lk 5. 03. 2021 10

Plagieerimine Struktuur • Mingil juhul ei tohi võtta lauseid või lõike varasematest töödest! • Kõik lõputööd lähevad läbi plagiaadituvastussüsteemi Urkund 5. 03. 2021 11

(Töö eesmärk) Struktuur • Enamasti see pole iseseisev alajaotus – Enamasti defineerib eesmärgi sissejuhatus • Vahel siiski on, kui oluline info töö eesmärgi defineerimiseks lähtub kirjanduslikust osast • Sellisel juhul see alajaotus defineerib/täpsustab töö eesmärki 5. 03. 2021 12

Eksperimentaalne osa Struktuur • Seletab, kuidas eksperimendid, arvutused, andmetöötlus kavandati ja läbi viidi – Kirjeldus peab olema piisav, et haritud keemik suudaks eksperimente korrata • St pole vaja seletada keemia põhiariduse hulka kuuluvat – Kavandamine võib olla siin või ka tulemuste alguses • Oluline: meetodite valimine – Kavandamine (miks just nii tehti) võib vahel olenevalt teemast olla väga oluline • Ja on sageli meelisteema küsijatele – Komisjon tahab näha, et just töö teostaja oli kavandamises põhiline vedav jõud • 6 -10 lk 5. 03. 2021 13

Eksperimentaalne osa Struktuur • Head fotod ja skeemid, nagu näiteks see, on väga abiks: 5. 03. 2021 Siin ja edaspidi on kõik näidis-skeemid, -graafikud ja -tabelid pärit reaalsetest töödest või esitatud ettekannetest 14

Tulemused ja arutelu Struktuur • See osa – esitab tulemused ja – avab nende tähtsuse – Esitab töö edasiarendamise võimalused • Järeldused peavad olema korrektsed, mitte „olukorda ilustavad“ – Keegi ei oota, et bakalaureusetöö on mingi suure probleemi veatu lahendus • Kui ikka korratavuse standardhälve on kõrge või ei olnud võimalik segavaid efekte elimineerida, siis nii tuleb ka öelda • 6 -10 lk 5. 03. 2021 15

Kuidas vältida vajadust tulemuste ilustamise järele? Töötada intensiivselt, ilma „äravajumiseta“ ja mitte jäta eksperimente hilja peale. Siis on alati võimalik ebaõnnestunud eksperimente korrata. 5. 03. 2021 16

Kokkuvõte Struktuur • See osa võtab kokku olulisimad tulemused • Ei too sisse uut infot • 1 lk 5. 03. 2021 17

Kirjandusviited Struktuur • Head viited on ajakirjaartiklitele ja raamatutele • Automaatviited – Zotero on väga soovitatav – Formaat näiteks: J. Phys. Chem. A • Võimalusel võiks veebiviiteid mitte kasutada • Mingil juhul ei maksa kasutada Wikipedia viiteid! – Aga kasutage Wikipedia viiteid • Hea oleks 30+ viidet 5. 03. 2021 Viidete formaatide näidised vt LTT lõputööde nõuete all: http: //tera. chem. ut. ee/~ ivo/Seminar/ 18

Eesti keel • Töö peab olema kirjutatud võimalikult heas eesti keeles • Juhendaja saab aidata – Aga juhendaja vajab aega → tuleb saata juhendajale võimalikult vara • Mitmete terminite eestikeelsed vasted: – http: //lisa. chem. ut. ee/~koit/kemterm/ 5. 03. 2021 19

Matemaatilised avaldised ja reaktsioonivõrrandid Matemaatilised avaldised • Mõõdetavate suuruste tähised kursiivis, eelnevad Δ jms sümbolid, samuti ala- ja ülaindeksid püstkirjas: – Näited: p. Ka, ΔGacid • Reaktsioonis osalevad osakesed püstkirjas – Näide: HA, A–, H+ • Korrutusmärk: kasutage „·“, mitte „*“ – Ühikutes võib selle ka ära jätta: k. J mol-1 on sama hea kui k. J·mol-1 5. 03. 2021 20

Arvandmete esitamine Arvandmed • Arvandmed peavad olema esitatud nii, et on selge, mida mõõdeti ja mille kohta andmed käivad • Kõik arvandmed esitada ühikutega! – (va ühikuta suurused) – Ühik ei pea olema iga arvu taga, võib olla nt tabeli päises, aga peab olema üheselt selge, mis see ühik on • Eksponentkujul andmed: 6, 02· 1023, mitte 6, 02 E+23 • Kümnendkohtade eraldaja Eestis on üldiselt koma (mitte punkt). 5. 03. 2021 21

Arvandmete esitamine Arvandmed • Mõistlik hulk tüvenumbreid – Hea, kui on tulemused võimalik anda määramatuse hinnangutega – Määramatusel 1 -2 tüvenumbrit – Tulemusel ja tema määramatusel sama arv komakohti – Määramatused võivad olla ka eraldi üldistatult esitatud – Ka siis, kui ei tehtud süvitsi määramatuse arvutusi, peab Teil olema mingigi ettekujutus, millise usaldusväärsusega Teie tulemused on • Abimees No 1: juhendaja 5. 03. 2021 22

Ebamõistlikult esitatud arvandmed Arvandmed Comment: Date: Friday, February 26, 2010, 15: 33: 39 Device. Setting: MJD(UTC) Time 55253. 37973 26. 02. 10, 11: 06: 49 55253. 37995 26. 02. 10, 11: 07: 08 55253. 38017 26. 02. 10, 11: 07: 27 55253. 38038 26. 02. 10, 11: 07: 45 55253. 38060 26. 02. 10, 11: 08: 04 55253. 38082 26. 02. 10, 11: 08: 23 55253. 38104 26. 02. 10, 11: 08: 42 Ch 1 1. 02540000 e+002 1. 02530000 e+002 Ch 2 9. 89700000 e+001 9. 90900000 e+001 9. 90600000 e+001 9. 90700000 e+001 9. 90200000 e+001 9. 90300000 e+001 9. 90100000 e+001 Ch 3 9. 77100000 e+001 9. 76400000 e+001 9. 76100000 e+001 9. 75600000 e+001 9. 75300000 e+001 9. 75500000 e+001 9. 76600000 e+001 – Pole päris selge, mida mõõdeti – Ühikud on puudu – Ülemäära palju tüvenumbreid 5. 03. 2021 23

Tabelid Arvandmed • Mitte liiga palju lahtreid, mitte liiga keerukas struktuur • Veerud ja read defineeritud • Kui on arvandmeid, siis ühikud – Eelistatult veergude päistes, mitte lahtrites • • Lahtrite väljaeraldamine, nooltega selgitamine. . . Convert text to Table, Auto. Fit to Contents Automaatpealkirjad Merge: – Word: ainult äärmisel vajadusel – Excel: ohutu • Iga tabel peab olema tekstis viidatud 5. 03. 2021 24

Üsna mõistlik tabel Acid HBX 4 5. 03. 2021 Arvandmed Gas-phase acidity (kcal/mol) X = CN X=F X = CF 3 325 340 330 250 — 277 259 290 244 225 213 <175 25

Üsna mõistlik tabel 5. 03. 2021 26

Ebamõistlik tabel 5. 03. 2021 Arvandmed 27

Eelmise slaidi tabeli puudused Arvandmed • • • Veerud enamikus sisuliselt tähistamata Ühikud puudu Liiga väikesed numbrid Liiga palju andmeid Liiga palju tüvenumbreid 5. 03. 2021 28

Ebamõistlik tabel Arvandmed Instrumental LOD Xmean + 3 s Instrumental LOQ Xmean + 10 s Method LOD Xmean + 3 s Method LOQ Xmean + 10 s mg/m 3 orto-xylene 2 3 12 24 meta- and para-xylene 5 9 28 57 styrene 4 8 12 25 toluene 2 5 14 29 VOC Puudused: Tähesuurus, värvivalik, fondi valik, tühjad read 5. 03. 2021 29

Skeemid ja graafikud Skeemid ja Graafikud • Ülevaatlik ja hästi haaratav viis tulemuste esitamiseks – Kui on vaja edasi anda trendi, siis on graafik tabelist parem • Korrektne vormistus on oluline • Telgede tähistused, ühikud • Võimalusel võiksid graafikutel olla veavälbad • Nooltega selgitused, kastidega välja eraldamine jne on kasuks • Iga graafik peab olema tekstis viidatud 5. 03. 2021 30

Skeemid ja graafikud tuleb ise teha! Skeemid ja Graafikud • Mingil juhul ei maksa kasutada internetist saadud või raamatutest skaneeritud skeeme või graafikuid! 5. 03. 2021 31

Üsna mõistlik graafik 5. 03. 2021 Graafikud 32

Üsna mõistlik graafik 5. 03. 2021 Graafikud 33

Mitte parim graafik 5. 03. 2021 Graafikud 34

Eelmise slaidi graafik Graafikud • Puudused: – Y teljel pole korrektne mõõtesuurus: • Jagada saab suurusi, mitte elemente! • Ei saa olla Co/Ti, peab olema kas nende elementide sisalduste, signaalide vms suuruste jagatis – Katsepunktid liiga väikesed – Puuduvad veavälbad • Voorused: – X telg tähistatud – Joon pandud läbi punktide vastavalt mudelile, mitte punkte ühendades 5. 03. 2021 35

Peaaegu kohustuslikud graafikud Graafikud • Kui töös tegeletakse LC analüüsiga, spektrite interpreteerimisega vms, siis näidiskromatogramm(id) või spekter(rid) on peaaegu kohustuslikud • Kasutatav instrumendi tarkvara võib seada mõned piirangud vormistusele – Samas saab mitmeid vormistuselemente (nt telgede tähistused) lihtsasti muuta esitlus/tekstitöötlustarkvaras 5. 03. 2021 36

Kromatogramm 5. 03. 2021 Graafikud 37

Eelmise slaidi kromatogramm Graafikud • Hästi: – Piisava intensiivsusega ja tähesuurusega • Sageli on tarkvara piirangute tõttu tähed väga väikesed ja halvasti loetavad – Olulised piigid on tähistatud • Halvasti – X telg tähistamata ja Y telg peaaegu ka • Tähistused saab PPT-s tekstikastidega juurde panna, pole vaja, et tarkvara seda teeks, kui see raske on Mitte kunagi ei tohi teha graafikus sisulisi muudatusi! 5. 03. 2021 38

Graafikute sissetoomine Graafikud • Kaks tüüpi graafikat: – Vektorgraafika (Exceli graafikud, PPT skeemid, . . . ) – Rastergraafika (Fotod, JPG, TIF, PNG, . . . ) • Vektorgraafika võtab palju vähem ruumi ja on kvaliteetsem • Vektorgraafika tasuks hoida vektorkujul – Paste special → Enhanced metafile • Rastergraafikat võib vajadusel kompresseerida • Suured rastergraafika objektid võiks sisse tuua hiljem – Aga siiski mitte päev enne esitamist 5. 03. 2021 39

Sisulised aspektid Te peate olema kaitsmisel võimeline selgitama iga aspekti, iga lauset, iga terminit ja iga väljendit oma töös! – Peate oskama iga oma aine struktuuri joonistada – Peate oskama iga võrrandi sisu selgitada Mida rohkem silmi Teie tööd enne esitamist näeb, seda parem! 5. 03. 2021 40

Kirjutamise hõlbustamine • Õigekirja kontroll • Automaatviited kirjandusele: Zotero • Artiklid lisage DOI ja raamatud ISBN kaudu • Automaatpealkirjad, automaatsisukord • Automaatnummerdus – Skeemid, joonised, võrrandid: Jah! – Pealkirjad: Pigem ei. . . • Automaatviited skeemidele, joonistele võrranditele • MS Word’i kiirklahvid – Neid saab defineerida 5. 03. 2021 41