Lidentification des microorganismes par spectromtrie de masse type

L’identification des microorganismes par spectrométrie de masse type « MALDI-TOF » 1 TS ABM MALDI-TOF MS Année 2015 -2016

Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time Of Flight Séparation différentielle d’ions en fonction de leur rapport m/z Obtention d’un spectre spécifique de l’échantillon analysé 1 TS ABM MALDI-TOF MS Année 2015 -2016

Les appareils disponibles sur le marché… 1 TS ABM MALDI-TOF MS Année 2015 -2016

Mode opératoire du dépôt… 1 TS ABM MALDI-TOF MS Année 2015 -2016

La matrice… c’est quoi… ? UNE MOLECULE ACIDE ELLE CEDE UN PROTON 1 TS ABM MALDI-TOF MS Année 2015 -2016

Que se passe-t-il dans l’appareil…? 1 TS ABM MALDI-TOF MS Année 2015 -2016

Que se passe-t-il dans l’appareil…? 1 TS ABM MALDI-TOF MS Année 2015 -2016

L’acquisition du résultat sous forme de spectre 1 TS ABM MALDI-TOF MS Année 2015 -2016

Comparaison aux collections de spectres… détermination du score < 1, 7 : absence d’identification 1, 7<score<2 : identification au genre ou plusieurs espèces possibles Analyses supplémentaires. Ø 2 : identification de l’espèce. 1 TS ABM MALDI-TOF MS Année 2015 -2016

Identification d’une souche pathogène… 1 TS ABM MALDI-TOF MS Année 2015 -2016

Les avantages… RAPIDITE EVIDENTE GAIN DE PLUSIEURS HEURES A PARTIR DE LA CULTURE SUR GELOSE réduction d’un facteur 55 ! Remarque: levures, moisissures, mycobactéries… protocole spécifique à cause de la composition pariétale : délai légèrement plus long à partir de la culture. 1 TS ABM MALDI-TOF MS Année 2015 -2016

Les avantages… COÛT REDUIT ! Réduction d’un facteur 5 à 10 pour les coûts par rapport aux analyses biochimiques conventionnelles, et d’un facteur 90 par rapport aux analyses de biologie moléculaire. 1 TS ABM MALDI-TOF MS Année 2015 -2016

Quelques inconvénients… Des difficultés d’identifications peuvent apparaître en cas : MAIS AUSSI… 1 TS ABM MALDI-TOF MS Année 2015 -2016

D’où la bonne qualité d’un geste technique simple… 1 TS ABM MALDI-TOF MS Année 2015 -2016

Quelques inconvénients… 1 TS ABM MALDI-TOF MS Année 2015 -2016

Les résultats de niveau de confiance moyen… Expérience du technicien: contexte clinique (urine, selle? ), caractère biochimique simple… (Shigella lac - / E. coli lac +) 1 TS ABM MALDI-TOF MS Année 2015 -2016

Les résultats de « pathogènes critiques » … Expérience du technicien: sérotypage obligatoire… technique de base qui doit être maîtrisée ! 1 TS ABM MALDI-TOF MS Année 2015 -2016