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基因庫(libraries)建構 Ø過去已完成的基因庫 Cosmid libraries BAC libraries Ø目前進行中的基因庫建構 Cosmid libraries BAC libraries
由血樣萃取基因組DNA之品質測定值 動物 性別 頭數 畜試土雞L 9 ♂ 畜試土雞L 9 ♀ 畜試土雞L 11 ♂ 畜試土雞L 11 ♀ 桃園豬 ♂ 桃園豬 ♀ 藍瑞斯 ♂ 藍瑞斯 ♀ 蘭嶼豬 ♂ 蘭嶼豬 ♀ 3 3 3 2 3 3 3 OD 260/OD 280 DNA濃度 ( mg/ml) 0. 269± 0. 044 0. 228± 0. 044 0. 253± 0. 0023 0. 227± 0. 034 0. 081± 0. 023 0. 128± 0. 054 0. 132± 0. 003 0. 293± 0. 028 0. 198± 0. 042 0. 150± 0. 026 1. 84± 0. 04 1. 79± 0. 06 1. 86± 0. 01 1. 84± 0. 03 1. 87± 0. 01 1. 84± 0. 02 1. 85± 0. 02 1. 87± 0. 01 1. 90± 0. 01 1. 86± 0. 03 0. 497± 0. 078 0. 407± 0. 072 0. 467± 0. 045 0. 420± 0. 056 0. 153± 0. 047 0. 233± 0. 101 0. 159± 0. 001 0. 273± 0. 027 0. 188± 0. 039 0. 140± 0. 024
不同動物基因庫力價與體積 動物 Titer (cfu/ml) 性別 未放大前 組裝後 畜試土雞 L 9 畜試土雞 L 11 桃園豬 藍瑞斯 蘭嶼豬 ♂ ♀ ♂ ♀ ♂ ♀ 1. 8× 105 4. 2× 105 3. 5× 105 4. 2× 105 4. 8× 105 3. 2× 105 2. 4× 105 3. 9× 105 2. 4× 105 5. 2× 105 4. 5× 105 6. 3× 105 5. 2× 105 6. 3× 105 1. 2× 106 1. 1× 106 放大後 1. 5× 109 1. 2× 109 1. 4× 109 1. 2× 109 1. 3× 109 1. 4× 109 7. 0× 109 4. 4× 109 1. 2× 109 3. 4× 109 總量 (ml) 165 100 100 165 160 152 162 155
由血樣萃取基因組DNA之品質測定值 動物 編號 性別 OD 260/OD 280 DNA濃度 ( mg/ml) 優質牛 H 19978 K 437 ♀ 0. 145 1. 71 0. 32 台灣水鹿 SB 1997027 ♂ 0. 284 1. 95 0. 28 梅花鹿 SK 1999053 ♂ 0. 124 1. 92 0. 12 褐色菜鴨 GD 505 ♀ 0. 206 2. 05 0. 21 黑色番鴨 BD 135 ♀ 0. 1323 1. 97 0. 32 褐色華鵝 CB 20050231 ♀ 0. 272 2. 00 0. 27
Cosmid library的構築過程可分成四個階段 A. 純化genomic DNA:純化及 genomic DNA 定量 B. Lambda Cosmid Vector (Super. Cos 1)之處 理 C. 部份水解純化的genomic DNA:利用Sau 3 A I限制脢處理genomic DNA D. 粘合DNA片段與vector,轉殖到E. coli,完 成基因庫的建立
ØBAC libraries 本年度預計完成桃園豬公豬 1 個 BAC library
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