La rsistance aux fongicides Par Herv Van der

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La résistance aux fongicides Par Hervé Van der Heyden Collaborateurs: Odile Carisse Jean-Benoit Charron

La résistance aux fongicides Par Hervé Van der Heyden Collaborateurs: Odile Carisse Jean-Benoit Charron

Plan de la présentation § Méthodes et théorie – Phénotypage – Génotypage – Échantillonnage

Plan de la présentation § Méthodes et théorie – Phénotypage – Génotypage – Échantillonnage § Résumé des essais § Stratégies d’atténuation

Questions de résistance § Comment doit-on la tester? § Sensible, résistants, un peu, beaucoup?

Questions de résistance § Comment doit-on la tester? § Sensible, résistants, un peu, beaucoup? § Quels sont les mécanismes de résistance? § Quel est le statut de la résistance au Québec? § Comment échantillonner? § Combien d’échantillons? § Évitable? Réversible? § Stratégies d’atténuation?

Groupe de travail Hervé Van Der Heyden Mélanie Gobeil-Richard Thérèse Wallon Dr. Odile Carisse

Groupe de travail Hervé Van Der Heyden Mélanie Gobeil-Richard Thérèse Wallon Dr. Odile Carisse Mathieu Tremblay Annie Lefebvre Dr. Jean-Benoit Charron Steven Zhe Jia Producteurs

Plan de travail Acquisition des connaissances de base et développement des processus : Botrytis

Plan de travail Acquisition des connaissances de base et développement des processus : Botrytis cinerea (2009 -2011) § Consolidation des acquis, mise à l’échelle et mobilisation (20122013) § Interprétation et développement d’une grille décisionnelle (20142017) § Acquisition de nouvelles connaissances, accroissement du portefeuille d’outils moléculaires pour d’autres pathogènes d’importance économique (2014 -2017) §

Approche phénotypique

Approche phénotypique

Tests phénotypiques

Tests phénotypiques

Mécanismes de résistance Mécanisme Pesticides Herbicides Insecticides Fongicides Moins de pesticide atteint la cible

Mécanismes de résistance Mécanisme Pesticides Herbicides Insecticides Fongicides Moins de pesticide atteint la cible • absorption réduite • exsorption accrue • détoxification accrue • système de compensation + ? ++ + + ? +++ ? + + + ? Cible modifiée • Non fonctionnelle • Production accrue • Affinité réduite + +++ ? +++ + + +++ Leroux et al. , 1999

Tests moléculaires

Tests moléculaires

Phase d’émergence § Le pathogène résistant doit apparaître (mutation et invasion) – Mutation: Un

Phase d’émergence § Le pathogène résistant doit apparaître (mutation et invasion) – Mutation: Un ou plusieurs changements génétiques héritables qui confèrent un caractère résistant – Invasion: Augmentation naturelle de la partie résistante de la population

Phase de sélection § La fraction résistante augmente au sein de la population à

Phase de sélection § La fraction résistante augmente au sein de la population à cause de la pression de sélection imposée par la présence du fongicide

Phase d’ajustement § Quand la fraction résistante d’une population devient trop importante, il faut

Phase d’ajustement § Quand la fraction résistante d’une population devient trop importante, il faut adapter les applications de fongicides pour s’assurer de garder le contrôle

Type de résistance • Niveau individuel: • Caractère stable et héréditaire qui se traduit

Type de résistance • Niveau individuel: • Caractère stable et héréditaire qui se traduit par une réduction de la sensibilité d’un individu (souche) à un fongicide • Niveau de la population: • Baisse d’efficacité d’un traitement fongicide, liée au nombre d’individus résistants

Boscalid R 1 68% Boscalid R 1 61% Boscalid R 2 20% Iprodione 55%

Boscalid R 1 68% Boscalid R 1 61% Boscalid R 2 20% Iprodione 55% Iprodione 59%

Échantillonnage et dépistage § Revoir notre façon d’échantillonner § Nb échantillons § Plan d’échantillonnage

Échantillonnage et dépistage § Revoir notre façon d’échantillonner § Nb échantillons § Plan d’échantillonnage § Population

Combien d’échantillons 2 0 1 1 0 2 0 0 1 3 0 1

Combien d’échantillons 2 0 1 1 0 2 0 0 1 3 0 1 0 2 0 0 1 2 2 4 0 1 0 2 1 3 1 2 4 0 1 1 0 1 2 0 4 1 6 3 0 1 6 1 1 0 0 0 1 0 2 1 9 1 3 1 2 1 5 0 10 0 1 1 3 0 0 0 6 3 0 2 3 0 0 6 1 0 0 0 4 4 1 6 0 2 Van der Heyden et al. , 2014

Suivi de fermes sentinelles Carisse et Van der Heyden. , 2015

Suivi de fermes sentinelles Carisse et Van der Heyden. , 2015

Suivi de fermes sentinelles Carisse et Van der Heyden. , 2015

Suivi de fermes sentinelles Carisse et Van der Heyden. , 2015

Sélection de la résistance T T

Sélection de la résistance T T

SÉLECTION DE LA RÉSISTANCE Qualitative: Strobilurines (ex: Quadris) Quantitative: Boscalide (ex: Lance, Cantus) Deising

SÉLECTION DE LA RÉSISTANCE Qualitative: Strobilurines (ex: Quadris) Quantitative: Boscalide (ex: Lance, Cantus) Deising et al. , 2008

Phénotypage 2015 -2016

Phénotypage 2015 -2016

Le cas du boscalid

Le cas du boscalid

Le cas des groupes 7

Le cas des groupes 7

Génotypage 2012 -2014

Génotypage 2012 -2014

Inventaire pancanadien

Inventaire pancanadien

Génotypage Canada

Génotypage Canada

Génotypage par culture

Génotypage par culture

Impact du ratio résistant sensible 280 0% Coverage 25% Coverage 50% Coverage 240 Lesions

Impact du ratio résistant sensible 280 0% Coverage 25% Coverage 50% Coverage 240 Lesions per Plant 200 160 120 80 40 0 100%S 75%S/25%R 50%S/50%R Sensitive (S)/Resistant (R) Ratio Travaux réalisés par Steven Zhe Jia, Étudiant à la maîtrise, Mc. Gill 25%S/75%R 100%R

Favoriser le développement de la résistance Traitements 1 Témoin 2 Producteur, 30% 3 Producteur,

Favoriser le développement de la résistance Traitements 1 Témoin 2 Producteur, 30% 3 Producteur, 50% 4 Producteur, 75% 5 Rovral, 30% 6 Rovral, 50% 7 Rovral, 75%

Impact sur le contrôle Incidence Traitements 1 Témoin 2 Producteur, 30% 3 Producteur, 50%

Impact sur le contrôle Incidence Traitements 1 Témoin 2 Producteur, 30% 3 Producteur, 50% 4 Producteur, 75% 5 Rovral, 30% 6 Rovral, 50% 7 Rovral, 75%

Stratégies d’atténuation • Limitation du nombre de traitements • Mélange en cuve • Rotation

Stratégies d’atténuation • Limitation du nombre de traitements • Mélange en cuve • Rotation des matières actives

Qualitative: Strobilurines (ex: Quadris) Quantitative: Boscalide (ex: Lance, Cantus) Deising et al. , 2008

Qualitative: Strobilurines (ex: Quadris) Quantitative: Boscalide (ex: Lance, Cantus) Deising et al. , 2008

Stratégies d’atténuation ou favoriser l’hétérogénéité • Favoriser la diversité Population hétérogène Population homogène

Stratégies d’atténuation ou favoriser l’hétérogénéité • Favoriser la diversité Population hétérogène Population homogène

Stratégies d’atténuation ou favoriser l’hétérogénéité Van der Bosch et al. , 2014

Stratégies d’atténuation ou favoriser l’hétérogénéité Van der Bosch et al. , 2014

Stratégies d’atténuation ou favoriser l’hétérogénéité • Rotation des matières actives: temps et espace F

Stratégies d’atténuation ou favoriser l’hétérogénéité • Rotation des matières actives: temps et espace F 1 F 2 F 3 F 4 F 1 F 2 F 3

Stratégies d’atténuation ou favoriser l’hétérogénéité • Faire varier la dose Faible de dose Forte

Stratégies d’atténuation ou favoriser l’hétérogénéité • Faire varier la dose Faible de dose Forte dose l’efficacité et la pression sélective peuvent augmenter en cas de fractionnement mais baissent généralement en absence de fractionnement… Hobbelen et al. , 2014; Leroux, 1999

Conclusion § Tester pour la résistance § Repenser § Éviter l’utilisation du boscalid (Cantus)

Conclusion § Tester pour la résistance § Repenser § Éviter l’utilisation du boscalid (Cantus) § Fluazinam § Éviter notre façon de faire le suivi (Allegro) les applications répétées du même fongicide

Merci § Innov’Action agro-alimentaire (MAPAQ) § Programme Canadien d’adaptation Agricole (PCAA) § Agri-Innovation (AAC)

Merci § Innov’Action agro-alimentaire (MAPAQ) § Programme Canadien d’adaptation Agricole (PCAA) § Agri-Innovation (AAC) Mélanie Gobeil-Richard Thérèse Wallon Mathieu Tremblay Annie Lefebvre Audrey Levasseur Jean-Benoit Charron Steven Zhe Jia Dr. Pierre Dutilleul Anne-Marie Fortier

Améliorer la surveillance phytosanitaire québécoise par le déploiement de réseaux de capteurs de spores

Améliorer la surveillance phytosanitaire québécoise par le déploiement de réseaux de capteurs de spores sentinelles Responsables: Hervé Van der Heyden (Phytodata) Collaborateurs: Odile Carisse (AAC), Liette Lambert (MAPAQ), Stéphanie Tellier (MAPAQ), Pierre Lafontaine (CIEL), Sylvie Rioux (CEROM) Objectifs: 1. Implanter quatre réseaux sentinelles pilotes 2. Évaluer le potentiel de différents types de capteurs pour les maladies dispersées par les éclaboussures Méthode: 1. Organismes cibles C. acutatum et C. gloeosporioides responsables de l'anthracnose; 2. 2 types de capteurs seront évalués 3. 2 sites d'essais seront implantés en conditions commerciales. 4. Les paramètres qui seront évalués dans le cadre de cette activité seront la hauteur du capteur, la distribution spatiale, la fréquence d'échantillonnage et la relation entre les symptômes et la CAS. 5. Les spores de C. acutatum et C. gloeosporoides seront comptés à l'aide d'un test PCR de type Taq. Man. 40 MAPAQ-Stratégie Phytosanitaire-Prime. Vert volet 3. 2 -Fond Vert