L 3 Module Libre Anne universitaire 2005 2006
L 3 Module Libre Année universitaire 2005 -2006 Initiation à la Bioinformatique Jean-Michel RICHER
Qu’est ce que la bioinformatique ? Domaine de recherche passionnant qui interagit avec plusieurs disciplines Agronomie Médecine Biologie Physique Chimie Informatique Mathématiques Application de l’informatique à la biologie : computational biology Analyse de l’information biologique : bioinformatics
Pourquoi s‘y intéresser ? Les programmes de séquençage des génomes ont ouvert la voie : § à de nouvelles perspectives de recherche (ex. thérapie génique, amélioration des plantes) § et de nouvelles approches (ex. phylogénie) Développement régional (Grand Ouest) Ouest Génopole (2002, Bretagne + Pays de la Loire) - Agro (INRA, INH) - Mer (Ifremer) - Santé (Inserm) - Bioinformatique (INRIA) Le Réseau National des Génopoles (1999, coordination de 8 Génopoles françaises)
Comment aborder la bioinformatique ? Biologie Méthodes Informatique Mathématiques Outils B I Nous proposons d’aborder les 3 aspects Statistiques M § Interrogation de bases de données (PDB) § Utilisation d’outils logiciels (Clustal W, Blast) § Analyse statistique des résultats (Excel, R) § Travail sur un sujet de recherche (DBDB)
Le Module Libre Les intervenants : § Biochimie : Emmanuel Jaspard, Bureau F 208 http: //ead. univ-angers. fr/~jaspard/ § Statistiques : Gilles Hunault, Bureau H 103 http: //www. info. univ-angers. fr/pub/gh/Bis/bis. htm §Informatique : Jean-Michel Richer, Bureau H 206 http: //www. info. univ-angers. fr/pub/richer/ensl 3 bio. php Contrôle des connaissances Examen terminal 2 h
Comptes Machines § Comptes Windows utilisation du disque D: § Comptes UNIX demander l’ouverture H 101 (signature) Login + mot de passe § Liste de diffusion : bioinfo@info. univ-angers. fr
Questions ? Merci de votre attention Bon travail !
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