Konzervaciona biologija Veba V Parametri Rajtove statistike Izraunavanje
Konzervaciona biologija Vežba V Parametri Rajtove statistike Izrašunavanje efektivne veličine populacije
Fragmentisanost populacije • Mnoge prirodne populacije postaju fragmentisane usled antropogenog uticaja. • Uticaj fragmentisanosti populacije na genetički diverzitet, diferencija, inbriding i rizik nestajanja zavisi od nivoa protoka gena izmedju postojećih fragmenata.
• Genetička strukturiranost populacije zavisi od: a) Broja populacionih fragmenata b) Veličine lokalnih populacija c) Geografsko rasprostranjenje lokalnih populacija d) Udaljenost izmedju fragmenata e) Disperzivna sposobnost kao karakteristika vrste f) Karakteristike staništa izmedju fragmenata i njihov uticaj na disperziju g) Vreme proteklo od fragmentacije h) Stope nestajanja i ponovnog naseljavanja izmedju fragmenata
• Pojave kao što su gubitak genetičkog diverziteta i inbridna depresija zajedno sa stalnim smanjenjem veličine populacije se najčešće javljaju u fragmentisanim populacijama (gde je protok gena smanjen) za razliku od nefragmentisanih populacija iste ukupne veličine, gde su takve pojave redje.
Izračunavanje nivoa fragmentisanosti populacije – F statistika • Odnos heterozigotnosti i inbridinga se koristi za izračunavanje parametra F statistike. • Poredjenjem dobijene heterozigotnosti (H 0) sa očekivanom (He) se koristi za izračunavanje F koeficijenta • H 0= (1 -F)2 pq i He=2 pq • F= 1 -H 0/He
Izračunavanje nivoa fragmentisanosti populacije – F statistika • Inbriding, koji nastaje usled fragmentisanoti populacije se može koristiti za izračunavanje stepena diferencicjacije koja se javlja izmedju fragmenata. Diferencijacije izmedju fragmenata ili subpopulacija su direktno proporcionalne koeficijentu inbridinga unutar ili izmedju populacija. Inbriding u ukupnoj populaciji (FIT) može biti podeljen na 1. inbriding koji se javlja u okviru subpopulacija (Fis) 2. inbridnig koji se javlja zbog diferencijacije izmedju subpopulacija (FST)
• FIT, FIS i FST su parametri F statistike. • FIS je prosečni koeficijent inbridinga na nivou subpopulacije • FST je efekat populacione podeljenosti na inbriding (koeficijent medjupopulacione genetičke diferencijacije) Kada je stopa protoka gena izmedju fragmenata niska, populacija je podeljena i dolazi do inbridinga, Fst raste. Sa visokom stopom protoka gena Fst opada.
FIS = 1 – (HI/Hs) FST= 1 – (Hs/HT) FIT = 1 – (HI/HT) • HI-prosečna dobijena heterozigotnost unutar fragmenata • Hs-prosečna očekivana Hardy-Weinberg heterozigotnost po fragmentu • HT- očekivana HW heterozigotnost za ukupnu populaciju
Zadatak • U Kanadi postoji 9 populacija Pacifičke tise. Prosečna dobijena heterozigotnost za svih devet populacija je 0. 085, dok je prosečna očekivana heterozigotnost za sve populacije po fragmentu 0. 166. a)Izračunati inbriding u okviru subpopulacija. (Fis). Očekivana heterozigotnost za svih devet populacija iznosi 0. 18. b)Izračunati inbriding koji nastaje zbog diferencijacije izmedju populacija. c)Izračunati ukupan inbriding izazvan inbridingom unutar populacija kao i inbriding nastao zbog diferencijacije.
- Slides: 9