http www callutheran eduAcademicProgramsDepar tmentsBio Devommribosome htm http
ここでもう少し詳しく、、 次のサイトが参考になる。 http: //www. callutheran. edu/Academic_Programs/Depar tments/Bio. Dev/omm/ribosome. htm http: //pubs. acs. org/cen/coverstory/85/8508 cover. html
タンパク質の一次構造 たとえば卵白リゾチームの一次構造 は次のとおりである。 1 16 31 46 61 76 91 106 121 1 Lys Gly Ala Asn Arg Cys Ser Asn Gln 2 3 4 5 6 7 8 9 Val Phe Gly Arg Cys Glu Leu Ala Leu Asp Asn Tyr Arg Gly Tyr Ser Ala Lys Phe Glu Ser Asn Phe Asn Thr Asp Gly Ser Thr Asp Tyr Gly Trp Cys Asn Asp Gly Arg Thr Asn Ile Pro Cys Ser Ala Leu Val Asn Cys Ala Lys Ile Val Ala Trp Arg Asn Arg Ala Trp Ile Arg Gly Cys Arg Leu 10 11 12 Ala Met Leu Gly Asn Thr Gln Ala Ile Leu Gln Pro Gly Ser Ser Asp Gly Cys Lys Gly 13 Lys Trp Thr Ile Arg Ile Asn Thr 14 15 Arg His Val Cys Asn Arg Asn Ser Asn Leu Thr Ala Gly Met Asp Val 15 30 45 60 75 90 105 120
βシート Ball and stick 模型
分泌タンパク質の一次構造 翻訳直後の、卵白リゾチームの一次 構造は次のとおり 1 1 Met 16 Ala 31 Lys 46 Trp 61 Thr 76 Ile 91 Arg 106 Ile 121 Asn 136 Thr 2 Arg Leu Arg Val Asn Asn Thr Gly Asp 3 Ser Gly His Cys Arg Ser Leu Ala Met Val 4 Leu Lys Gly Ala Asn Arg Cys Ser Asn Gln 5 Leu Val Leu Ala Thr Trp Asn Val Ala 6 Ile Phe Asp Lys Asp Trp Ile Asn Trp 7 Leu Gly Asn Phe Gly Cys Pro Cys Val Ile 8 Val Arg Tyr Glu Ser Asn Cys Ala Arg 9 Leu Cys Arg Ser Thr Asp Ser Lys Trp Gly 10 Cys Glu Gly Asn Asp Gly Ala Lys Arg Cys 11 Phe Leu Tyr Phe Tyr Arg Leu Ile Asn Arg 12 Leu Ala Ser Asn Gly Thr Leu Val Arg Leu 13 Pro Ala Leu Thr Ile Pro Ser Cys 14 Leu Ala Gly Gln Leu Gly Ser Asp Lys マゼンダ色がシグナルペプチド 15 Ala Met Asn Ala Gln Ser Asp Gly 15 30 45 60 75 90 105 120 135
卵白リゾチーム 1 16 31 46 61 76 91 106 121 1 Lys Gly Ala Asn Arg Cys Ser Asn Gln 2 3 4 5 6 7 8 9 Val Phe Gly Arg Cys Glu Leu Ala Leu Asp Asn Tyr Arg Gly Tyr Ser Ala Lys Phe Glu Ser Asn Phe Asn Thr Asp Gly Ser Thr Asp Tyr Gly Trp Cys Asn Asp Gly Arg Thr Asn Ile Pro Cys Ser Ala Leu Val Asn Cys Ala Lys Ile Val Ala Trp Arg Asn Arg Ala Trp Ile Arg Gly Cys Arg Leu 10 11 12 Ala Met Leu Gly Asn Thr Gln Ala Ile Leu Gln Pro Gly Ser Ser Asp Gly Cys Lys Gly 13 Lys Trp Thr Ile Arg Ile Asn Thr 14 15 Arg His Val Cys Asn Arg Asn Ser Asn Leu Thr Ala Gly Met Asp Val 15 30 45 60 75 90 105 120 リゾチーム(lysozyme)は、細菌の細胞 壁を構成するN-アセチルムラミン酸とN -アセチルグルコサミン間の結合を切断 する。
ヒトリゾチーム 1 16 31 46 61 76 91 106 121 1 Lys Gly Leu Asn Ser Ala Asp Ile Val 2 3 4 5 6 7 8 9 Val Phe Glu Arg Cys Glu Leu Ala Met Asp Gly Tyr Arg Gly Ile Ser Ala Lys Trp Glu Ser Gly Tyr Asn Ala Gly Asp Arg Ser Thr Asp Tyr Arg Tyr Trp Cys Asn Asp Gly Lys Cys His Leu Ser Cys Ser Ala Leu Ala Val Ala Cys Ala Lys Arg Val Arg Ala Trp Val Ala Trp Arg Asn Arg Gln Tyr Val Gln Gly Cys Gly 10 11 12 Arg Thr Leu Ala Asn Thr Arg Ala Gly Ile Phe Thr Pro Gly Leu Gln Asp Val Arg Asp Arg Cys Gln Val 13 Lys Trp Thr Gln Ala Asn Pro Asn 14 15 Arg Leu Met Cys Asn Tyr Ile Asn Val Asn Ile Ala Gln Gly Arg Asp 15 30 45 60 75 90 105 120 ヒトでは、涙のなかに含まれていて殺 菌に寄与する。他に免疫にも関与する
リゾチームの比較 eggwhite human 1 11 21 31 41 MRSLLILVLC FLPLAALGKV FGRCELAAAM KRHGLDNYRG YSLGNWVCAA MKALIVLGLV LLSVTVQGKV FERCELARTL KRLGMDGYRG ISLANWMCLA eggwhite Human 51 61 71 81 91 KFESNFNTQA TNRN-TDGST DYGILQINSR WWCNDGRTPG SRNLCNIPCS KWESGYNTRA TNYNAGDRST DYGIFQINSR YWCNDGKTPG AVNACHLSCS eggwhite human 101 111 121 131 141 ALLSSDITAS VNCAKKIVSD GNGMNAWVAW RNRCKGTDVQ AWIRGCRL ALLQDNIADA VACAKRVVRD PQGIRAWVAW RNRCQNRDVR QYVQGCGV 活性部位 E: グルタミン酸、D: アスパラギン酸 SS結合: 24 -145(146), 48 -133(134) 82(83)-98(99), 94(95)-112(113)
ヒトリゾチーム 1 16 31 46 61 76 91 106 121 1 Lys Gly Leu Asn Ser Ala Asp Ile Val 2 3 4 5 6 7 8 9 Val Phe Glu Arg Cys Glu Leu Ala Met Asp Gly Tyr Arg Gly Ile Ser Ala Lys Trp Glu Ser Gly Tyr Asn Ala Gly Asp Arg Ser Thr Asp Tyr Arg Tyr Trp Cys Asn Asp Gly Lys Cys His Leu Ser Cys Ser Ala Leu Ala Val Ala Cys Ala Lys Arg Val Arg Ala Trp Val Ala Trp Arg Asn Arg Gln Tyr Val Gln Gly Cys Gly 10 11 12 Arg Thr Leu Ala Asn Thr Arg Ala Gly Ile Phe Thr Pro Gly Leu Gln Asp Val Arg Asp Arg Cys Gln Val 13 Lys Trp Thr Gln Ala Asn Pro Asn 14 15 Arg Leu Met Cys Asn Tyr Ile Asn Val Asn Ile Ala Gln Gly Arg Asp 15 30 45 60 75 90 105 120 SS結合が4本あって、三次構造に寄与 している。
キモトリプシンは、セリンプロテアーゼの 一つで、膵臓から不活性型のキモトリプ シノーゲンとして十二指腸へ分泌される ウシのキモトリプシンの一次構造 1 61 121 181 241 10 CGVPAIQPVL TTSDVVVAGE VCLPSASDDF ICAGASGVSS TLAAN 20 SGLSRIVNGE FDQGSSSEKI AAGTTCVTTG CMGDSGGPLV 30 EAVPGSWPWQ QKLKIAKVFK WGLTRYTNAN CKKNGAWTLV 40 VSLQDKTGFH NSKYNSLTIN TPDRLQQASL GIVSWGSSTC 50 FCGGSLINEN NDITLLKLST PLLSNTNCKK STSTPGVYAR 60 WVVTAAHCGV AASFSQTVSA YWGTKIKDAM VTALVNWVQQ 60 120 180 240
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